20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_3548 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_3548  hypothetical protein  100 
 
 		 505 aa  1038    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0896627  normal  0.0134633 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2876  parallel beta-helix repeat-containing protein  32.52 
 
 		 512 aa  180  5.999999999999999e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.794955 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4180  parallel beta-helix repeat protein protein  30.72 
 
 		 513 aa  176  7e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.23585  normal  0.0401044 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4387  hypothetical protein  31.79 
 
 		 502 aa  169  1e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0662  parallel beta-helix repeat-containing protein  31.95 
 
 		 500 aa  163  7e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.000522571  normal  0.950756 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0099  hypothetical protein  29.29 
 
 		 520 aa  138  2e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4699  hypothetical protein  28.53 
 
 		 472 aa  84.3  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0214281  normal  0.949284 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0455  pectate lyase-related protein  26.45 
 
 		 563 aa  67.8  0.0000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3115  hypothetical protein  46.67 
 
 		 368 aa  61.2  0.00000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2850  hypothetical protein  21.68 
 
 		 665 aa  58.9  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3111  hypothetical protein  44 
 
 		 446 aa  58.5  0.0000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0112  hypothetical protein  46.77 
 
 		 1024 aa  52.8  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0292658  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0292  parallel beta-helix repeat-containing protein  58.14 
 
 		 463 aa  51.6  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2919  hypothetical protein  24.24 
 
 		 338 aa  50.8  0.00005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000462284  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1761  hypothetical protein  71.43 
 
 		 805 aa  46.2  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.102589 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0361  hypothetical protein  35.94 
 
 		 341 aa  45.8  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0371  hypothetical protein  35.14 
 
 		 480 aa  45.8  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2195  carbohydrate-binding family 6 protein  33.61 
 
 		 965 aa  45.8  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.862232  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3576  hemolysin-type calcium-binding region  27.54 
 
 		 547 aa  43.9  0.006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.996068  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1882  parallel beta-helix repeat-containing protein  21.68 
 
 		 428 aa  44.3  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.640976 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>