40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_0318 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_0318  protein of unknown function DUF1275  100 
 
 		 213 aa  420  1e-117  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0238  putative permease transmembrane protein  33.65 
 
 		 236 aa  95.1  7e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3824  hypothetical protein  36.59 
 
 		 235 aa  92  5e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4133  protein of unknown function DUF1275  36.59 
 
 		 235 aa  92  7e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.913687  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4752  hypothetical protein  32.06 
 
 		 244 aa  89.4  4e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.703735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1399  hypothetical protein  37.43 
 
 		 232 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1377  hypothetical protein  37.43 
 
 		 232 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.343918  normal  0.236805 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5806  hypothetical protein  36 
 
 		 230 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.740879 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0917  hypothetical protein  37.43 
 
 		 232 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4542  hypothetical protein  36.65 
 
 		 231 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.370889  normal  0.654023 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5590  hypothetical protein  36.5 
 
 		 230 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1276  hypothetical protein  39.43 
 
 		 231 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1310  hypothetical protein  40.91 
 
 		 231 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.109342 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3178  hypothetical protein  35.91 
 
 		 238 aa  77.4  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0680  protein of unknown function DUF1275  35.71 
 
 		 259 aa  77  0.0000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.118447  normal  0.265496 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0190  hypothetical protein  35.08 
 
 		 196 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0735535 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3145  protein of unknown function DUF1275  34.81 
 
 		 225 aa  75.9  0.0000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0679  hypothetical protein  39.74 
 
 		 226 aa  72  0.000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0586  hypothetical protein  39.74 
 
 		 226 aa  72  0.000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.785468  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4098  hypothetical protein  39.38 
 
 		 236 aa  72  0.000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.258612  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1977  hypothetical protein  38.61 
 
 		 258 aa  71.6  0.000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.35374  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5590  hypothetical protein  30.19 
 
 		 229 aa  71.6  0.000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.424596 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7005  hypothetical protein  38.75 
 
 		 245 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0174683 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1919  hypothetical protein  29.72 
 
 		 237 aa  68.9  0.00000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6339  hypothetical protein  35.84 
 
 		 245 aa  68.6  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1490  hypothetical protein  35.84 
 
 		 245 aa  68.6  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2300  hypothetical protein  29.25 
 
 		 255 aa  67  0.0000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000548729  hitchhiker  0.00456123 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1543  hypothetical protein  26.44 
 
 		 240 aa  66.6  0.0000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.107512  normal  0.494853 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4851  hypothetical protein  32.23 
 
 		 240 aa  66.6  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.40878  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5725  hypothetical protein  37.74 
 
 		 247 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.308552  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1401  permease transmembrane protein  27.01 
 
 		 240 aa  63.2  0.000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0337517  normal  0.139208 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5464  protein of unknown function DUF1275  29.95 
 
 		 234 aa  58.2  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1423  hypothetical protein  30.23 
 
 		 231 aa  45.8  0.0005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.108069  normal  0.24451 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1046  putative transmembrane protein of unknown function  30.52 
 
 		 231 aa  45.1  0.0007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.650406 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0007  protein of unknown function DUF1275  26.34 
 
 		 230 aa  45.1  0.0009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00254664  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0313  protein of unknown function DUF1275  22.53 
 
 		 225 aa  44.7  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000535924  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1206  protein of unknown function DUF1275  29.13 
 
 		 262 aa  43.5  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1053  protein of unknown function DUF1275  23.08 
 
 		 239 aa  43.1  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0750  hypothetical protein  23.44 
 
 		 220 aa  42.4  0.005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3258  hypothetical protein  22.93 
 
 		 243 aa  41.6  0.01  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.213289  normal  0.46952 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>