197 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_3758 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_3758  phosphoesterase domain-containing protein  100 
 
 		 684 aa  1412    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2258  phosphoesterase, RecJ-like protein  40.82 
 
 		 669 aa  495  9.999999999999999e-139  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0125063  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0080  phosphoesterase RecJ domain protein  37.84 
 
 		 667 aa  464  1e-129  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.609068  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2651  DHH family protein  36.81 
 
 		 652 aa  428  1e-118  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0151664  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2973  DHH family protein  39.36 
 
 		 652 aa  426  1e-117  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0533  phosphoesterase RecJ domain protein  34.56 
 
 		 669 aa  372  1e-101  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0880  phosphoesterase RecJ domain protein  32.68 
 
 		 667 aa  360  3e-98  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.631011  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3413  diguanylate cyclase and phosphoesterase  32.73 
 
 		 658 aa  348  3e-94  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3542  diguanylate cyclase and phosphoesterase  37.65 
 
 		 658 aa  346  8.999999999999999e-94  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2539  DHH family protein  30.43 
 
 		 655 aa  340  4e-92  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5323  DHH subfamily 1 protein  35.98 
 
 		 657 aa  336  9e-91  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5151  DHH family phosphoesterase  35.98 
 
 		 657 aa  336  9e-91  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00172819  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5167  DHH family phosphoesterase  35.98 
 
 		 657 aa  336  9e-91  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5719  DHH subfamily 1 protein  35.98 
 
 		 657 aa  336  9e-91  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000267067  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5580  DHH subfamily 1 protein  35.98 
 
 		 657 aa  336  9e-91  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.33995e-19 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5621  DHH subfamily 1 protein  35.98 
 
 		 657 aa  335  1e-90  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000144841  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5658  DHH subfamily 1 protein  35.98 
 
 		 657 aa  335  1e-90  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000148947  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5338  DHH subfamily 1 protein  35.86 
 
 		 657 aa  335  2e-90  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00027618  hitchhiker  0.000000025759 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5597  DHH subfamily 1 protein  35.86 
 
 		 657 aa  335  2e-90  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0188603  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5263  diguanylate cyclase and phosphoesterase  35.98 
 
 		 657 aa  334  3e-90  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.129533  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0014  hypothetical protein  30.57 
 
 		 655 aa  333  7.000000000000001e-90  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0014  phosphoesterase domain-containing protein  30.57 
 
 		 655 aa  333  7.000000000000001e-90  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4010  diguanylate cyclase and phosphoesterase  36.09 
 
 		 657 aa  332  1e-89  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.874769  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0011  signal protein  34.95 
 
 		 672 aa  307  4.0000000000000004e-82  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00560638  hitchhiker  0.0000000733083 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0010  phosphoesterase domain-containing protein  35.9 
 
 		 672 aa  306  7e-82  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0144039  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1967  signal protein  35.02 
 
 		 675 aa  304  3.0000000000000004e-81  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.764897  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0013  signal protein  29.98 
 
 		 685 aa  269  2e-70  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2141  DHH family protein  27.64 
 
 		 660 aa  242  1e-62  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.195838  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1977  signal protein  29.96 
 
 		 654 aa  237  6e-61  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.152853  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0788  signal protein  30.63 
 
 		 654 aa  232  2e-59  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0653759  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf692  hypothetical protein  26.95 
 
 		 653 aa  151  4e-35  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1856  phosphoesterase RecJ domain protein  28.18 
 
 		 335 aa  87.4  7e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.766478  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1197  phosphoesterase domain-containing protein  27.11 
 
 		 333 aa  87  0.000000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0177078  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0611  phosphoesterase RecJ domain protein  24.56 
 
 		 324 aa  85.9  0.000000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0230502  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0902  phosphoesterase, RecJ-like protein  23.65 
 
 		 320 aa  83.2  0.00000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1458  Polynucleotide adenylyltransferase region  29.54 
 
 		 892 aa  83.6  0.00000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.402567  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1258  phosphoesterase domain-containing protein  26.81 
 
 		 333 aa  79.7  0.0000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1955  phosphoesterase domain-containing protein  26.87 
 
 		 323 aa  78.6  0.0000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0358  CBS domain containing protein  29.18 
 
 		 1077 aa  77.4  0.0000000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0457131 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10698  hypothetical protein  25.29 
 
 		 351 aa  74.7  0.000000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.240357  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0480  phosphoesterase RecJ domain-containing protein  24.77 
 
 		 325 aa  74.3  0.000000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0422  phosphoesterase RecJ domain protein  25.47 
 
 		 341 aa  73.6  0.00000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.788368  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0679  polynucleotide adenylyltransferase region  28.12 
 
 		 888 aa  73.2  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.197003  normal  0.0338911 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl488  exopolyphosphatase-like  24.92 
 
 		 314 aa  71.6  0.00000000005  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3570  phosphoesterase RecJ domain protein  24.4 
 
 		 330 aa  71.2  0.00000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.672109  normal  0.13788 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4214  phosphoesterase, RecJ-like  24 
 
 		 318 aa  71.2  0.00000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0130006 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1290  phosphoesterase, RecJ-like protein  24.34 
 
 		 335 aa  71.2  0.00000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0478  phosphoesterase domain-containing protein  26.63 
 
 		 330 aa  70.9  0.00000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.134646  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0324  phosphoesterase RecJ domain protein  26.58 
 
 		 478 aa  70.1  0.0000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.988829  normal  0.0678816 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2246  CBS domain-containing protein  25.53 
 
 		 875 aa  69.7  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0770  phosphoesterase RecJ domain protein  25.9 
 
 		 315 aa  69.3  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1643  phosphoesterase domain-containing protein  23.72 
 
 		 317 aa  69.3  0.0000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1129  phosphoesterase domain-containing protein  26.85 
 
 		 333 aa  69.3  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2395  hypothetical protein  26.32 
 
 		 336 aa  68.6  0.0000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5468  phosphoesterase RecJ domain protein  23.73 
 
 		 334 aa  68.2  0.0000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.296573  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1711  phosphoesterase RecJ domain protein  23.86 
 
 		 366 aa  67.8  0.0000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.041209  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf830  DHH family phosphoesterase  28.48 
 
 		 329 aa  67  0.000000001  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1656  DHH subfamily 1 protein  21.49 
 
 		 317 aa  66.6  0.000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1231  phosphoesterase domain-containing protein  24.52 
 
 		 326 aa  67  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1492  phosphoesterase RecJ domain protein  24.86 
 
 		 330 aa  67  0.000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.136328  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3559  phosphoesterase, RecJ-like  24.48 
 
 		 386 aa  66.2  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0624488  normal  0.616422 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1938  DHH subfamily 1 protein  20.9 
 
 		 317 aa  66.2  0.000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2370  phosphoesterase domain-containing protein  22.82 
 
 		 334 aa  65.9  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.275233  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4381  phosphoesterase RecJ domain protein  24.12 
 
 		 344 aa  66.6  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.342236  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0539  phosphoesterase RecJ domain protein  23.26 
 
 		 336 aa  65.9  0.000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000146173 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0126  phosphoesterase RecJ domain protein  24.92 
 
 		 330 aa  65.5  0.000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.096959  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1506  phosphoesterase RecJ domain protein  25.16 
 
 		 352 aa  65.1  0.000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0682991  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6028  phosphoesterase RecJ domain protein  24.13 
 
 		 343 aa  64.7  0.000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.120644 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1578  PolyA polymerase family protein  24.46 
 
 		 880 aa  64.3  0.000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.507141  normal  0.242793 
 
 
-
 
NC_002950  PG1091  DHH subfamily 1 protein  25.55 
 
 		 331 aa  62.8  0.00000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.302124 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0492  phosphoesterase RecJ domain protein  24.1 
 
 		 330 aa  62.8  0.00000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0990  phosphoesterase DHHA1  22.26 
 
 		 330 aa  62.8  0.00000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00349102  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1211  phosphoesterase RecJ domain protein  22.77 
 
 		 332 aa  63.2  0.00000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.029721  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1433  polynucleotide adenylyltransferase region  27.31 
 
 		 904 aa  63.2  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.743333  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2844  phosphoesterase RecJ domain protein  26.48 
 
 		 547 aa  62.8  0.00000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.061718  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2693  phosphoesterase RecJ domain protein  26.82 
 
 		 315 aa  62.4  0.00000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0900  TrkA domain-containing protein  28.83 
 
 		 511 aa  62  0.00000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1929  CBS domain containing protein  23.55 
 
 		 875 aa  61.2  0.00000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1479  DHH superfamily protein, subfamily 1  24.76 
 
 		 333 aa  60.1  0.0000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0983  phosphoesterase RecJ domain protein  24.52 
 
 		 314 aa  60.1  0.0000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0953  DHH family protein  22.57 
 
 		 355 aa  59.7  0.0000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.307691 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2417  phosphoesterase RecJ domain protein  24.44 
 
 		 320 aa  59.7  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.163067  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3186  phosphoesterase RecJ domain protein  23.6 
 
 		 326 aa  59.3  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.500315  normal  0.376889 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0601  hypothetical protein  23.85 
 
 		 336 aa  59.3  0.0000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1660  phosphoesterase RecJ domain protein  26.22 
 
 		 332 aa  58.9  0.0000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12852  hypothetical protein  23.08 
 
 		 336 aa  59.3  0.0000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000356507  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2511  phosphoesterase RecJ domain protein  23.4 
 
 		 330 aa  58.5  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1275  phosphoesterase RecJ domain protein  24.28 
 
 		 353 aa  58.5  0.0000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000587589  normal  0.191981 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1053  phosphoesterase RecJ domain protein  23.33 
 
 		 318 aa  58.2  0.0000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000135026  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0318  phosphoesterase RecJ domain protein  21.48 
 
 		 344 aa  58.2  0.0000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1184  Polynucleotide adenylyltransferase region  28.05 
 
 		 905 aa  58.2  0.0000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1760  phosphoesterase domain-containing protein  21.93 
 
 		 313 aa  58.2  0.0000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.619947  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1794  phosphoesterase domain-containing protein  21.93 
 
 		 313 aa  58.2  0.0000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0891  polynucleotide adenylyltransferase region  24.61 
 
 		 883 aa  58.2  0.0000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2030  Polynucleotide adenylyltransferase region  26.53 
 
 		 854 aa  57.8  0.0000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.609547  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1203  CBS domain-containing protein  25.19 
 
 		 873 aa  57.8  0.0000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.452152  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1441  Polynucleotide adenylyltransferase region  25.38 
 
 		 821 aa  57.8  0.0000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000556215  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2294  CBS domain containing protein  23.24 
 
 		 875 aa  57.4  0.0000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1808  phosphoesterase RecJ domain protein  28.51 
 
 		 338 aa  56.6  0.000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.270612  normal  0.187391 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2435  phosphoesterase domain-containing protein  25 
 
 		 333 aa  56.6  0.000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.190071  normal  0.601258 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>