More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1796 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_1796  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 		 230 aa  472  1e-132  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2569  metallo-beta-lactamase family protein  48.21 
 
 		 228 aa  208  5e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0247403  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2902  metallo-beta-lactamase family protein  47.77 
 
 		 228 aa  207  1e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.150382  normal  0.132575 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2221  Zn-dependent hydrolase  47.32 
 
 		 228 aa  206  3e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.448191  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2428  metallo-beta-lactamase family protein  47.77 
 
 		 228 aa  204  1e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2506  metallo-beta-lactamase family protein  47.77 
 
 		 228 aa  200  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0156142  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1991  beta-lactamase domain-containing protein  45.7 
 
 		 226 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00243387  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2266  Zn-dependent hydrolase  45.98 
 
 		 228 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.064814  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2298  metallo-beta-lactamase family protein  45.54 
 
 		 228 aa  198  5e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2472  metallo-beta-lactamase family protein  45.54 
 
 		 228 aa  198  5e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.760184  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2493  metallo-beta-lactamase family protein  45.54 
 
 		 228 aa  198  5e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3947  beta-lactamase domain protein  42.73 
 
 		 246 aa  182  5.0000000000000004e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.304771  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1873  beta-lactamase domain protein  38.01 
 
 		 244 aa  163  3e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.871278  normal  0.674736 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2167  beta-lactamase domain protein  33.8 
 
 		 245 aa  136  2e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0330732  normal  0.0181786 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2440  hydrolase, putative  38.18 
 
 		 217 aa  132  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0911202  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2372  putative hydrolase  37.27 
 
 		 217 aa  130  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2218  beta-lactamase domain-containing protein  36.89 
 
 		 217 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.250629  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2960  putative hydrolase  37.27 
 
 		 217 aa  126  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0047526 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2505  putative hydrolase  35.91 
 
 		 217 aa  123  2e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.341858  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2241  hydrolase  35.91 
 
 		 217 aa  122  5e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.282445  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2175  metal-dependent hydrolase  35.91 
 
 		 217 aa  122  5e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000879537  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2422  putative hydrolase  35.91 
 
 		 217 aa  122  5e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2405  hydrolase  35.91 
 
 		 217 aa  122  5e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.903974  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2161  metal-dependent hydrolase  35.45 
 
 		 217 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.57885  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2384  beta-lactamase domain protein  28.76 
 
 		 230 aa  92.4  5e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1919  beta-lactamase domain protein  26.83 
 
 		 243 aa  84  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000566164  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3996  beta-lactamase domain-containing protein  25.58 
 
 		 296 aa  84  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.590455  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1101  beta-lactamase domain protein  26.2 
 
 		 232 aa  81.6  0.000000000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2710  beta-lactamase domain protein  25.12 
 
 		 237 aa  76.3  0.0000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2563  beta-lactamase domain protein  27.19 
 
 		 282 aa  74.7  0.000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2916  beta-lactamase-like protein  23.96 
 
 		 239 aa  74.3  0.000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1047  beta-lactamase domain-containing protein  26.56 
 
 		 295 aa  73.2  0.000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5069  beta-lactamase domain protein  26.87 
 
 		 214 aa  72  0.000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.137937  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1288  beta-lactamase-like protein  27.31 
 
 		 329 aa  70.9  0.00000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3529  beta-lactamase-like  26.16 
 
 		 277 aa  71.6  0.00000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0508  beta-lactamase domain protein  28.5 
 
 		 295 aa  70.9  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1675  beta-lactamase domain protein  26.92 
 
 		 242 aa  69.3  0.00000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0424  beta-lactamase domain protein  25.84 
 
 		 223 aa  68.9  0.00000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.65466  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5818  beta-lactamase domain protein  26.12 
 
 		 294 aa  68.6  0.00000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0619  beta-lactamase domain-containing protein  24.26 
 
 		 273 aa  68.2  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1374  beta-lactamase domain-containing protein  26.37 
 
 		 192 aa  67.4  0.0000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.09884  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1263  beta-lactamase domain protein  27.55 
 
 		 231 aa  66.2  0.0000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.795749 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0387  beta-lactamase domain-containing protein  29.44 
 
 		 231 aa  66.2  0.0000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.084331  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4636  beta-lactamase domain protein  27.1 
 
 		 299 aa  65.9  0.0000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.218254 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3968  beta-lactamase domain-containing protein  26.03 
 
 		 317 aa  65.1  0.0000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0386675  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2424  beta-lactamase domain protein  25.81 
 
 		 322 aa  64.7  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.238173  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2427  beta-lactamase domain-containing protein  25.46 
 
 		 300 aa  64.7  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.501309  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0619  beta-lactamase domain protein  26.06 
 
 		 240 aa  63.9  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.256454 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0769  beta-lactamase domain-containing protein  24.17 
 
 		 273 aa  63.5  0.000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.310253 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0646  beta-lactamase domain protein  25.5 
 
 		 226 aa  63.2  0.000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2396  beta-lactamase domain protein  25.73 
 
 		 228 aa  62.4  0.000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1869  Beta-lactamase-like  21.03 
 
 		 330 aa  61.6  0.000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.356372  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5582  beta-lactamase domain protein  23.26 
 
 		 322 aa  61.2  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3121  metallo-beta-lactamase family protein  25.91 
 
 		 285 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2128  metal-dependent hydrolase  25.91 
 
 		 281 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4522  beta-lactamase domain protein  26.05 
 
 		 299 aa  61.6  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.231723  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4206  metallo-beta-lactamase domain-containing protein  25.57 
 
 		 317 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3890  zinc metallohydrolase  25.57 
 
 		 317 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.489775  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4269  hypothetical protein  25.57 
 
 		 317 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1095  hydroxyacylglutathione hydrolase  31.91 
 
 		 215 aa  60.8  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4154  beta-lactamase domain-containing protein  26.25 
 
 		 299 aa  60.8  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.336345 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1003  hydroxyacylglutathione hydrolase  31.91 
 
 		 215 aa  60.8  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.105674  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1062  hydroxyacylglutathione hydrolase  31.91 
 
 		 215 aa  60.8  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00136718 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4159  hypothetical protein  25.57 
 
 		 317 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1112  hydroxyacylglutathione hydrolase  31.91 
 
 		 215 aa  60.8  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.347617  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1030  hydroxyacylglutathione hydrolase  31.91 
 
 		 215 aa  60.8  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.88889  hitchhiker  0.00661846 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2769  metallo-beta-lactamase family protein  27.17 
 
 		 295 aa  60.1  0.00000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5141  metallo-beta-lactamase family protein  28.57 
 
 		 240 aa  60.1  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4716  metallo-beta-lactamase family protein  28 
 
 		 240 aa  59.7  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4245  hypothetical protein  25.57 
 
 		 317 aa  59.7  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0528  beta-lactamase-like protein  24.89 
 
 		 317 aa  60.1  0.00000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000304282  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3882  Zn-dependent hydrolase  25.11 
 
 		 317 aa  59.7  0.00000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06736  zinc metallohydrolase  25 
 
 		 249 aa  59.7  0.00000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4384  beta-lactamase domain protein  24.64 
 
 		 258 aa  59.7  0.00000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0493064 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1277  beta-lactamase domain protein  24.15 
 
 		 242 aa  59.3  0.00000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3110  metallo-beta-lactamase family protein  25.35 
 
 		 285 aa  59.3  0.00000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5146  metallo-beta-lactamase family protein  29.14 
 
 		 240 aa  59.3  0.00000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00931  predicted metal-binding enzyme  31.21 
 
 		 215 aa  58.9  0.00000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00844744  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2716  beta-lactamase domain protein  31.21 
 
 		 215 aa  58.9  0.00000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.187181  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1088  metallo-beta-lactamase family protein  31.21 
 
 		 215 aa  58.9  0.00000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00153658  normal  0.346644 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00938  hypothetical protein  31.21 
 
 		 215 aa  58.9  0.00000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0114501  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5114  metallo-beta-lactamase family protein  26.86 
 
 		 240 aa  58.9  0.00000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1454  beta-lactamase domain-containing protein  29.17 
 
 		 259 aa  58.9  0.00000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1026  metallo-beta-lactamase family protein  31.21 
 
 		 215 aa  58.9  0.00000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.043416  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1034  metallo-beta-lactamase family protein  31.21 
 
 		 215 aa  58.9  0.00000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0035  beta-lactamase domain protein  23.2 
 
 		 210 aa  58.9  0.00000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0991  hypothetical protein  25.11 
 
 		 317 aa  58.5  0.00000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2669  beta-lactamase domain-containing protein  31.21 
 
 		 215 aa  58.9  0.00000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00771642  normal  0.138863 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2900  metallo-beta-lactamase family protein  27.07 
 
 		 285 aa  58.5  0.00000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.248774  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4731  metallo-beta-lactamase family protein  27.05 
 
 		 240 aa  58.5  0.00000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3118  metallo-beta-lactamase family protein  27.07 
 
 		 281 aa  58.5  0.00000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3140  metallo-beta-lactamase family protein  27.23 
 
 		 281 aa  58.5  0.00000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0313805  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2193  metallo-beta-lactamase family protein  30.5 
 
 		 215 aa  57.8  0.0000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.700248  normal  0.270656 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2292  beta-lactamase domain protein  24.07 
 
 		 321 aa  57.8  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0204091  normal  0.304902 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2870  metal-dependent hydrolase  25.45 
 
 		 285 aa  58.2  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.154446  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2827  metal-dependent hydrolase  26.03 
 
 		 285 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0133277  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2832  beta-lactamase domain-containing protein  24.2 
 
 		 317 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.422682  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5245  metallo-beta-lactamase family protein  26.86 
 
 		 240 aa  57.8  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2391  metallo-beta-lactamase family protein  31.21 
 
 		 215 aa  58.2  0.0000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.178829  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4832  beta-lactamase domain-containing protein  28.57 
 
 		 240 aa  57.8  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>