More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_0295 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_0295  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  100 
 
 		 748 aa  1523    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0006  DNA gyrase, A subunit  41.97 
 
 		 802 aa  562  1.0000000000000001e-159  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.540811  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0007  DNA gyrase subunit A  43.21 
 
 		 839 aa  556  1e-157  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0008  DNA gyrase subunit A  40.87 
 
 		 807 aa  554  1e-156  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.425562  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0007  DNA gyrase subunit A  43.21 
 
 		 839 aa  554  1e-156  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0007  DNA gyrase, A subunit  41.4 
 
 		 932 aa  547  1e-154  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0706522  hitchhiker  0.000130108 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0008  DNA gyrase, A subunit  41.24 
 
 		 809 aa  546  1e-154  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.191063  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0010  DNA gyrase, A subunit  41.28 
 
 		 807 aa  545  1e-153  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0200618  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0006  DNA gyrase subunit A  39.56 
 
 		 818 aa  542  9.999999999999999e-153  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0006  DNA gyrase, A subunit  41.36 
 
 		 814 aa  539  9.999999999999999e-153  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0624353  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00060  DNA gyrase subunit A  41.61 
 
 		 870 aa  541  9.999999999999999e-153  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00061935  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0006  DNA gyrase, A subunit  40.55 
 
 		 828 aa  538  1e-151  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5314  DNA gyrase subunit A  39.79 
 
 		 823 aa  536  1e-151  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0584522  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0006  DNA gyrase, A subunit  39.66 
 
 		 820 aa  535  1e-151  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00070  DNA gyrase, A subunit  41.3 
 
 		 816 aa  538  1e-151  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0006  DNA gyrase subunit A  39.63 
 
 		 825 aa  538  1e-151  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.119691  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1256  DNA gyrase subunit A  40.39 
 
 		 817 aa  537  1e-151  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0006  DNA gyrase, A subunit  42.4 
 
 		 899 aa  533  1e-150  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0006  DNA gyrase subunit A  41.14 
 
 		 821 aa  535  1e-150  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0979169  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0008  DNA gyrase, A subunit  39.33 
 
 		 819 aa  534  1e-150  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.163769  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0960  DNA gyrase subunit A  40.13 
 
 		 819 aa  530  1e-149  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00632258  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0006  DNA gyrase subunit A  39.66 
 
 		 823 aa  531  1e-149  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2361  DNA gyrase subunit A  41.44 
 
 		 827 aa  529  1e-149  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00518277  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0006  DNA gyrase subunit A  39.66 
 
 		 823 aa  530  1e-149  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.182786  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0006  DNA gyrase subunit A  39.4 
 
 		 823 aa  526  1e-148  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.711032  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0006  DNA gyrase subunit A  39.4 
 
 		 823 aa  526  1e-148  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.814718  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0006  DNA gyrase subunit A  39.4 
 
 		 823 aa  526  1e-148  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0006  DNA gyrase subunit A  39.4 
 
 		 823 aa  526  1e-148  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0006  DNA gyrase subunit A  39.4 
 
 		 823 aa  526  1e-148  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0006  DNA gyrase subunit A  39.53 
 
 		 823 aa  527  1e-148  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0500902  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0006  DNA gyrase subunit A  39.4 
 
 		 823 aa  526  1e-148  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00261664  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1216  DNA gyrase subunit A  41.88 
 
 		 836 aa  526  1e-148  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.504333  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0007  DNA gyrase, A subunit  39.79 
 
 		 811 aa  524  1e-147  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0007  DNA gyrase, A subunit  40.17 
 
 		 818 aa  524  1e-147  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000039295  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00060  DNA gyrase subunit A  40.5 
 
 		 838 aa  520  1e-146  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.120033  normal  0.0325774 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0006  DNA gyrase subunit A  40.76 
 
 		 834 aa  522  1e-146  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0218004  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0008  DNA gyrase, A subunit  39.82 
 
 		 812 aa  521  1e-146  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000800696  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0007  DNA gyrase, A subunit  40.67 
 
 		 901 aa  519  1e-146  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.607285  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1039  DNA gyrase subunit A  39.05 
 
 		 878 aa  521  1e-146  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.641491  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0008  DNA gyrase, A subunit  39.52 
 
 		 814 aa  520  1e-146  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000266151  unclonable  0.0000000153333 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2548  DNA gyrase, A subunit  40.21 
 
 		 893 aa  518  1.0000000000000001e-145  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0828  hypothetical protein  40.03 
 
 		 816 aa  518  1.0000000000000001e-145  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.725746 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1408  DNA gyrase, A subunit  40.44 
 
 		 811 aa  516  1.0000000000000001e-145  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1310  DNA gyrase subunit A  38.8 
 
 		 885 aa  513  1e-144  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0388177  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2846  DNA gyrase subunit A  38.8 
 
 		 897 aa  513  1e-144  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.215176  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0027  DNA gyrase, A subunit  38.87 
 
 		 848 aa  514  1e-144  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000124476  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2767  DNA gyrase subunit A  38.92 
 
 		 897 aa  513  1e-144  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0123016  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0006  DNA gyrase subunit A  39.28 
 
 		 852 aa  512  1e-144  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11750  DNA gyrase subunit A  40.59 
 
 		 796 aa  513  1e-144  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0708355  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0006  DNA gyrase, A subunit  39.63 
 
 		 812 aa  513  1e-144  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3269  DNA gyrase subunit A  38.92 
 
 		 882 aa  514  1e-144  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00267185  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0006  DNA gyrase, A subunit  39.79 
 
 		 829 aa  514  1e-144  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000708877  hitchhiker  8.0391e-18 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1512  DNA gyrase, A subunit  40.91 
 
 		 809 aa  514  1e-144  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.257014  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4447  DNA gyrase, A subunit  39.41 
 
 		 914 aa  514  1e-144  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.950017 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2331  DNA gyrase, A subunit  39.94 
 
 		 824 aa  513  1e-144  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.772308  hitchhiker  0.00342265 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3019  DNA gyrase subunit A  38.52 
 
 		 877 aa  511  1e-143  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.542004  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1421  DNA gyrase, A subunit  38.34 
 
 		 860 aa  509  1e-143  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.633923  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4181  DNA gyrase, A subunit  39.28 
 
 		 911 aa  511  1e-143  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.549723  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2616  DNA gyrase subunit A  38.8 
 
 		 878 aa  509  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.341614 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1801  DNA gyrase subunit A  40.18 
 
 		 913 aa  510  1e-143  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.303162  normal  0.145926 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2408  DNA gyrase subunit A  38.8 
 
 		 878 aa  509  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000367831  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2457  DNA gyrase subunit A  38.8 
 
 		 878 aa  509  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0910619  normal  0.208896 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3211  DNA gyrase subunit A  38.28 
 
 		 879 aa  509  1e-143  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1105  DNA gyrase subunit A  38.28 
 
 		 879 aa  509  1e-143  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0580579  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2512  DNA gyrase subunit A  38.8 
 
 		 878 aa  509  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0982635 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0006  DNA gyrase subunit A  38.57 
 
 		 866 aa  509  1e-143  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0006  DNA gyrase subunit A  40.97 
 
 		 848 aa  510  1e-143  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.889145  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02157  DNA gyrase subunit A  38.8 
 
 		 875 aa  508  9.999999999999999e-143  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1630  DNA gyrase, A subunit  40.77 
 
 		 809 aa  507  9.999999999999999e-143  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02116  hypothetical protein  38.8 
 
 		 875 aa  508  9.999999999999999e-143  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1744  DNA gyrase subunit A  39.35 
 
 		 943 aa  505  9.999999999999999e-143  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2192  DNA gyrase, A subunit  38.99 
 
 		 853 aa  507  9.999999999999999e-143  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2371  DNA gyrase subunit A  38.67 
 
 		 875 aa  506  9.999999999999999e-143  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3365  DNA gyrase subunit A  38.67 
 
 		 875 aa  506  9.999999999999999e-143  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.329132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1375  DNA gyrase subunit A  40.63 
 
 		 809 aa  508  9.999999999999999e-143  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.261522  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0005  DNA gyrase, A subunit  38.63 
 
 		 843 aa  507  9.999999999999999e-143  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000262861  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1428  DNA gyrase, A subunit  38.41 
 
 		 875 aa  503  1e-141  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000222135  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0006  DNA gyrase, A subunit  40.08 
 
 		 889 aa  503  1e-141  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.314343  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0006  DNA gyrase, A subunit  40.08 
 
 		 889 aa  503  1e-141  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.864295  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2498  DNA gyrase subunit A  38.54 
 
 		 878 aa  504  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2526  DNA gyrase subunit A  38.54 
 
 		 875 aa  504  1e-141  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0272  DNA gyrase, A subunit  40.27 
 
 		 816 aa  504  1e-141  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00337054  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2578  DNA gyrase subunit A  38.47 
 
 		 904 aa  503  1e-141  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.551431 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2606  DNA gyrase subunit A  38.54 
 
 		 875 aa  504  1e-141  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00734  DNA gyrase subunit A  37.94 
 
 		 898 aa  504  1e-141  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.942934  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1420  DNA gyrase subunit A  38.41 
 
 		 875 aa  502  1e-141  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000467679 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0006  DNA gyrase, A subunit  38.06 
 
 		 855 aa  503  1e-141  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2869  DNA gyrase subunit A  39.97 
 
 		 913 aa  502  1e-140  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.135991  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0005  DNA gyrase, A subunit  40.19 
 
 		 832 aa  501  1e-140  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3482  DNA gyrase, A subunit  38.98 
 
 		 840 aa  501  1e-140  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.600634  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2557  DNA topoisomerase IV subunit A  39.81 
 
 		 814 aa  500  1e-140  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1244  DNA gyrase subunit A  39.03 
 
 		 875 aa  501  1e-140  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0006  DNA gyrase, A subunit  40.08 
 
 		 840 aa  499  1e-140  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000948225 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0413  DNA gyrase subunit A  39.55 
 
 		 824 aa  500  1e-140  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0903108  decreased coverage  0.000217687 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2325  DNA topoisomerase IV subunit A  40.92 
 
 		 979 aa  501  1e-140  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.582923  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2039  DNA topoisomerase IV subunit A  40.95 
 
 		 979 aa  499  1e-140  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2379  DNA gyrase subunit A  38.28 
 
 		 875 aa  501  1e-140  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.076856  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1618  DNA topoisomerase IV subunit A  39.42 
 
 		 814 aa  499  1e-140  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000651164  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0005  DNA gyrase, A subunit  38.63 
 
 		 836 aa  500  1e-140  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.301958 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2663  DNA gyrase subunit A  37.89 
 
 		 827 aa  501  1e-140  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0795874  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>