More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_1843 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_1843  uroporphyrin-III C-methyltransferase  100 
 
 
451 aa  927    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.572708  normal  0.146892 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0142  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  61.94 
 
 
462 aa  567  1e-160  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0709  uroporphyrin-III C-methyltransferase  60.81 
 
 
458 aa  556  1e-157  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0050  uroporphyrin-III C-methyltransferase-like  58.93 
 
 
467 aa  544  1e-153  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.929104 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0043  uroporphyrin-III C-methyltransferase  57.68 
 
 
462 aa  528  1e-148  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2306  uroporphyrin-III C-methyltransferase  69.66 
 
 
351 aa  387  1e-106  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.500417  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1942  uroporphyrin-III C-methyltransferase-like  66.53 
 
 
331 aa  348  9e-95  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0409  uroporphyrin-III C-methyltransferase  32.75 
 
 
511 aa  233  4.0000000000000004e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0409  uroporphyrin-III C-methyltransferase  31.65 
 
 
510 aa  227  3e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3452  uroporphyrin-III C-methyltransferase  33.33 
 
 
525 aa  222  9.999999999999999e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.305578  normal  0.171928 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3286  uroporphyrinogen III synthase/methyltransferase  32.1 
 
 
515 aa  221  3e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3062  uroporphyrinogen-III methylase  31.38 
 
 
513 aa  219  1e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3999  uroporphyrin-III C-methyltransferase  45.93 
 
 
463 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.426226  hitchhiker  0.00756787 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1834  uroporphyrin-III C-methyltransferase  45.93 
 
 
463 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000289405 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3604  uroporphyrin-III C-methyltransferase  45.93 
 
 
463 aa  213  5.999999999999999e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.556509 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3403  uroporphyrin-III C-methyltransferase  44.62 
 
 
464 aa  212  9e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.242571 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1346  uroporphyrin-III C-methyltransferase  33.19 
 
 
511 aa  211  2e-53  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.694338  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1125  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase, uroporphyrinogen-III synthase  31.56 
 
 
516 aa  211  2e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.325525 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1248  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / uroporphyrinogen-III synthase  33.08 
 
 
520 aa  210  3e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.472521 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3235  uroporphyrinogen-III synthase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  31.71 
 
 
513 aa  209  8e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0761379  normal  0.140873 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3062  uroporphyrin-III C-methyltransferase  32.41 
 
 
512 aa  208  1e-52  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00105684  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2528  uroporphyrinogen-III synthase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  32.74 
 
 
493 aa  208  1e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.172889  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0701  uroporphyrin-III C-methyltransferase  32.52 
 
 
504 aa  208  2e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3353  uroporphyrin-III C-methyltransferase  30.63 
 
 
504 aa  207  3e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.422788  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3581  precorrin-2 dehydrogenase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  43.62 
 
 
464 aa  207  5e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.249196  normal  0.492888 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3797  uroporphyrin-III C-methyltransferase  44.58 
 
 
269 aa  207  5e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000253578  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0687  hypothetical protein  32.75 
 
 
505 aa  206  6e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.943133  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28170  Uroporphyrin-III C-methyltransferase  44.13 
 
 
464 aa  206  8e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0671  uroporphyrin-III C-methyltransferase  45.04 
 
 
482 aa  204  2e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.523068  normal  0.0127709 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3344  siroheme synthase  42.4 
 
 
464 aa  204  2e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00903193  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0787  uroporphyrin-III C-methyltransferase  45.38 
 
 
273 aa  204  2e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.464331  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2767  uroporphyrin-III C-methyltransferase  34.29 
 
 
503 aa  203  4e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0252  uroporphyrin-III C-methyltransferase  31.78 
 
 
511 aa  203  5e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2383  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  43.9 
 
 
462 aa  203  6e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.806488  hitchhiker  0.00704026 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2207  uroporphyrin-III C-methyltransferase  30.11 
 
 
507 aa  202  7e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00880064  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2837  uroporphyrinogen-III synthase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  31.49 
 
 
503 aa  203  7e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.452302  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3174  uroporphyrin-III C-methyltransferase, C-terminal:siroheme synthase, N-terminal  42 
 
 
464 aa  202  8e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.108275  normal  0.319321 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3519  uroporphyrin-III C-methyltransferase  41.3 
 
 
480 aa  202  9.999999999999999e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.605082  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3073  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  45.02 
 
 
276 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.419877  normal  0.821671 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0862  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  45.02 
 
 
276 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0632575  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1252  uroporphyrin-III C-methyltransferase  32.03 
 
 
505 aa  202  9.999999999999999e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1278  uroporphyrin-III C-methyltransferase  31.16 
 
 
504 aa  201  1.9999999999999998e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000100069  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03694  uroporphyrin-III C-methyltransferase  42.68 
 
 
479 aa  201  1.9999999999999998e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2313  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.8 
 
 
502 aa  201  1.9999999999999998e-50  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1107  uroporphyrin-III C-methyltransferase  42.97 
 
 
487 aa  201  1.9999999999999998e-50  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2449  uroporphyrin-III C-methyltransferase  32.89 
 
 
502 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.448467  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3362  uroporphyrin-III C-methyltransferase  41.7 
 
 
480 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2235  uroporphyrin-III C-methyltransferase  41.32 
 
 
470 aa  201  3e-50  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0899  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  45.02 
 
 
276 aa  201  3e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30340  siroheme synthase  41.53 
 
 
465 aa  200  5e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3188  uroporphyrin-III C-methyltransferase  44.31 
 
 
272 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2162  uroporphyrin-III C-methyltransferase  31.81 
 
 
512 aa  198  2.0000000000000003e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000123773  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0358  uroporphyrin-III C-methyltransferase  31.75 
 
 
510 aa  198  2.0000000000000003e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1160  uroporphyrin-III C-methyltransferase  44.87 
 
 
473 aa  198  2.0000000000000003e-49  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.277445  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0953  uroporphyrin-III C-methyltransferase  45.04 
 
 
278 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.553083  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2173  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  40.57 
 
 
489 aa  198  2.0000000000000003e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0861  uroporphyrin-III C-methyltransferase  42 
 
 
472 aa  198  2.0000000000000003e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.402872  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2236  uroporphyrin-III C-methyltransferase  30.84 
 
 
503 aa  197  3e-49  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0343  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.97 
 
 
248 aa  197  4.0000000000000005e-49  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00230836  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1977  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / uroporphyrinogen-III synthase  30.13 
 
 
513 aa  197  4.0000000000000005e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0017868  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0672  uroporphyrin-III C-methyltransferase  44.76 
 
 
273 aa  197  5.000000000000001e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00608831 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2597  siroheme synthase  41.13 
 
 
465 aa  196  6e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1397  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.08 
 
 
528 aa  196  7e-49  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0961  uroporphyrin-III C-methyltransferase  44.63 
 
 
281 aa  196  9e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.509191  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0652  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  40.87 
 
 
493 aa  195  1e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0927  uroporphyrin-III C-methyltransferase  44.63 
 
 
281 aa  196  1e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3409  uroporphyrin-III C-methyltransferase  44.63 
 
 
278 aa  195  1e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3044  uroporphyrin-III C-methyltransferase  45.04 
 
 
277 aa  195  2e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1065  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  43.37 
 
 
554 aa  195  2e-48  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1823  uroporphyrin-III C-methyltransferase  41.84 
 
 
478 aa  194  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.1629  normal  0.347271 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3201  uroporphyrin-III C-methyltransferase  32.68 
 
 
519 aa  194  2e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3728  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.67 
 
 
276 aa  194  3e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2558  uroporphyrin-III C-methyltransferase  29.15 
 
 
506 aa  194  3e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0215  siroheme synthase  41.56 
 
 
462 aa  194  3e-48  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1636  uroporphyrin-III C-methyltransferase  41.42 
 
 
478 aa  193  4e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0591457  normal  0.234749 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3719  siroheme synthase  40.91 
 
 
470 aa  193  5e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.411824  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0232  siroheme synthase  40.91 
 
 
473 aa  193  5e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3959  siroheme synthase  40.91 
 
 
473 aa  193  5e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2892  uroporphyrin-III C-methyltransferase  44.21 
 
 
269 aa  193  5e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0795  siroheme synthase (Includes: Uroporphyrin-III C-methyltransferase, Precorrin-2 dehydrogenase,Sirohydrochlorin ferrochelatase)  42.49 
 
 
275 aa  192  7e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.751719  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1099  uroporphyrin-III C-methyltransferase  42.49 
 
 
484 aa  192  8e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.656193 
 
 
-
 
NC_004310  BR0179  siroheme synthase  42.8 
 
 
477 aa  191  2e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3437  uroporphyrin-III C-methyltransferase  41.9 
 
 
472 aa  191  2e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3305  siroheme synthase  41.9 
 
 
472 aa  191  2e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0970  siroheme synthase  41.9 
 
 
472 aa  191  2e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1698  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  42.15 
 
 
458 aa  191  2.9999999999999997e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0715064 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1111  uroporphyrin-III C-methyltransferase  41.25 
 
 
482 aa  190  4e-47  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4598  siroheme synthase  39.92 
 
 
467 aa  190  4e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2471  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  41.74 
 
 
479 aa  189  8e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0675252  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0188  uroporphyrin-III C-methyltransferase  42.55 
 
 
475 aa  189  1e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0173  siroheme synthase  42.37 
 
 
478 aa  189  1e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0958  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.8 
 
 
273 aa  189  1e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.297399  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0662  uroporphyrin-III C-methyltransferase  42.46 
 
 
271 aa  187  2e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1025  uroporphyrin-III C-methyltransferase  39.68 
 
 
293 aa  188  2e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3374  uroporphyrin-III C-methyltransferase  30.22 
 
 
509 aa  186  5e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4048  siroheme synthase  40.41 
 
 
459 aa  186  6e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2089  ferrochelatase  40.16 
 
 
474 aa  186  7e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0691041  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0708  uroporphyrin-III C-methyltransferase  29.13 
 
 
464 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0863  uroporphyrin-III C-methyltransferase-like  40.5 
 
 
468 aa  185  1.0000000000000001e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.147258  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0417  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.5 
 
 
462 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>