More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_1200 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011059  Paes_0916  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  85.27 
 
 		 610 aa  1073    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.345122 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1620  biotin/lipoyl attachment  53.61 
 
 		 609 aa  646    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1568  Oxaloacetate decarboxylase  71.07 
 
 		 641 aa  936    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00759156  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1267  oxaloacetate decarboxylase, alpha subunit  80.32 
 
 		 615 aa  1027    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0859  oxaloacetate decarboxylase, alpha subunit  71.8 
 
 		 650 aa  944    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00177232  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1508  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase 2  54.63 
 
 		 600 aa  656    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0063  Pyruvate carboxylase  54.55 
 
 		 603 aa  649    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000388454  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0964  biotin/lipoyl attachment  54.83 
 
 		 602 aa  661    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0659271  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1200  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  100 
 
 		 609 aa  1257    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.45293 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0808  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  82.82 
 
 		 611 aa  1038    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.443377  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1197  pyruvate carboxylase, subunit B  53.78 
 
 		 592 aa  647    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.278458  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1192  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  73 
 
 		 634 aa  954    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.345988  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0604  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  52.05 
 
 		 601 aa  637    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.984732  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0940  oxaloacetate decarboxylase, alpha subunit, putative  54.5 
 
 		 599 aa  637    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1011  oxaloacetate decarboxylase, alpha subunit, putative  53.68 
 
 		 599 aa  632  1e-180  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0881  oxaloacetate decarboxylase, alpha subunit, putative  53.52 
 
 		 599 aa  631  1e-179  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.178794  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1293  biotin/lipoyl attachment  51.85 
 
 		 613 aa  624  1e-177  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.352378  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1259  pyruvate carboxylase/oxaloacetate decarboxylase beta subunit  52.79 
 
 		 603 aa  607  9.999999999999999e-173  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.911837  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0320  oxaloacetate decarboxylase  30.65 
 
 		 605 aa  243  6e-63  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0612  pyruvate carboxylase subunit B  29.11 
 
 		 569 aa  239  1e-61  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.86669  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0862  oxaloacetate decarboxylase  30.24 
 
 		 590 aa  238  3e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1350  pyruvate carboxylase subunit B  28.92 
 
 		 568 aa  236  7e-61  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1341  pyruvate carboxylase subunit B  28.73 
 
 		 569 aa  236  7e-61  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.421509 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3712  oxaloacetate decarboxylase  30.08 
 
 		 590 aa  235  1.0000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0060  oxaloacetate decarboxylase  30.08 
 
 		 590 aa  235  1.0000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.580433  normal  0.307421 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1334  pyruvate carboxylase subunit B  29.29 
 
 		 569 aa  235  2.0000000000000002e-60  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1733  pyruvate carboxylase subunit B  30.03 
 
 		 567 aa  230  5e-59  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6223  pyruvate carboxylase subunit B  29.84 
 
 		 607 aa  228  2e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0061  oxaloacetate decarboxylase  29.3 
 
 		 589 aa  226  9e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71720  pyruvate carboxylase subunit B  29.68 
 
 		 607 aa  226  1e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0062  oxaloacetate decarboxylase  29.95 
 
 		 588 aa  226  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3544  oxaloacetate decarboxylase  29.46 
 
 		 589 aa  225  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0803  oxaloacetate decarboxylase  29.58 
 
 		 589 aa  225  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1005  pyruvate carboxylase subunit B  29.11 
 
 		 567 aa  224  3e-57  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3543  oxaloacetate decarboxylase  29.46 
 
 		 589 aa  224  3e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.549121  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1586  pyruvate carboxylase subunit B  30.44 
 
 		 573 aa  224  4e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.526056  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5124  pyruvate carboxylase subunit B  29.62 
 
 		 602 aa  222  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.588617 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3615  oxaloacetate decarboxylase  29.23 
 
 		 589 aa  223  9.999999999999999e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.472152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3925  pyruvate carboxylase subunit B  29 
 
 		 602 aa  221  3e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.246664  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0631  Conserved carboxylase region  26.88 
 
 		 633 aa  221  3e-56  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_128  oxaloacetate decarboxylase, alpha subunit  30.39 
 
 		 587 aa  221  3.9999999999999997e-56  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4478  pyruvate carboxylase subunit B  29.14 
 
 		 602 aa  220  6e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3650  oxaloacetate decarboxylase  30.53 
 
 		 594 aa  220  7e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5346  pyruvate carboxylase subunit B  29.34 
 
 		 602 aa  219  1e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00544178 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5255  pyruvate carboxylase subunit B  29.34 
 
 		 602 aa  219  1e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.594563 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5395  pyruvate carboxylase subunit B  29.45 
 
 		 602 aa  218  2e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0145041 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5060  pyruvate carboxylase subunit B  29.7 
 
 		 602 aa  218  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5510  oxaloacetate decarboxylase, alpha subunit  29.84 
 
 		 602 aa  217  5e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0060  oxaloacetate decarboxylase  29.69 
 
 		 591 aa  216  7e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.653336 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0202  oxaloacetate decarboxylase  27.99 
 
 		 599 aa  216  7e-55  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0059  oxaloacetate decarboxylase  30.02 
 
 		 591 aa  216  9.999999999999999e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.265333  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0693  oxaloacetate decarboxylase  30.06 
 
 		 602 aa  216  9.999999999999999e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0119  pyruvate carboxylase subunit B  29.9 
 
 		 584 aa  215  1.9999999999999998e-54  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.698581  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1556  pyruvate carboxylase subunit B  27.98 
 
 		 604 aa  215  1.9999999999999998e-54  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.411533  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2425  pyruvate carboxylase subunit B  28.9 
 
 		 571 aa  213  5.999999999999999e-54  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1512  pyruvate carboxylase subunit B  28.06 
 
 		 617 aa  213  7.999999999999999e-54  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.841478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0085  oxaloacetate decarboxylase  28.76 
 
 		 597 aa  213  7.999999999999999e-54  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0260292  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1784  pyruvate carboxylase subunit B  29.27 
 
 		 582 aa  213  9e-54  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.803588  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0250  pyruvate carboxylase subunit B  29.68 
 
 		 582 aa  213  1e-53  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3623  oxaloacetate decarboxylase  30.21 
 
 		 599 aa  213  1e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00192901  decreased coverage  0.000000118523 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1435  pyruvate carboxylase subunit B  28.24 
 
 		 638 aa  212  2e-53  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000897989  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0631  pyruvate carboxylase subunit B  27.87 
 
 		 619 aa  211  3e-53  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5639  pyruvate carboxylase subunit B  29.84 
 
 		 602 aa  211  4e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.509278  normal  0.279946 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0831  oxaloacetate decarboxylase  29.53 
 
 		 591 aa  210  6e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.977578  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1049  oxaloacetate decarboxylase  28.46 
 
 		 592 aa  209  1e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02060  pyruvate carboxylase subunit B  28.66 
 
 		 599 aa  209  2e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0894  oxaloacetate decarboxylase  28.64 
 
 		 589 aa  207  4e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3189  pyruvate carboxylase subunit B  28.01 
 
 		 577 aa  207  4e-52  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0531  pyruvate carboxylase subunit B  27.52 
 
 		 596 aa  207  6e-52  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0507  pyruvate carboxylase subunit B  26.77 
 
 		 596 aa  206  7e-52  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1916  pyruvate carboxylase subunit B  27.5 
 
 		 609 aa  206  7e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.566124  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1556  pyruvate carboxylase subunit B  28.23 
 
 		 615 aa  205  2e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.944098  normal  0.0959021 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2480  oxaloacetate decarboxylase  29.35 
 
 		 598 aa  204  3e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0819  oxaloacetate decarboxylase  30.87 
 
 		 462 aa  204  3e-51  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1321  oxaloacetate decarboxylase  28.12 
 
 		 604 aa  204  4e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0140986 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0139  pyruvate carboxylase subunit B  27.17 
 
 		 616 aa  204  6e-51  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0177448  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0796  oxaloacetate decarboxylase  30.87 
 
 		 462 aa  202  9.999999999999999e-51  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1220  oxaloacetate decarboxylase  28.27 
 
 		 601 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0185712  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0639  oxaloacetate decarboxylase  27.21 
 
 		 595 aa  202  1.9999999999999998e-50  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1010  pyruvate carboxylase subunit B  27.11 
 
 		 579 aa  202  1.9999999999999998e-50  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.843574 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002525  oxaloacetate decarboxylase alpha chain  29.1 
 
 		 594 aa  201  3e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.450431  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3336  oxaloacetate decarboxylase  28.41 
 
 		 602 aa  201  3e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000131691 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3012  oxaloacetate decarboxylase  27.59 
 
 		 596 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.930079  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0971  oxaloacetate decarboxylase  28.14 
 
 		 595 aa  198  3e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.195309  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3266  oxaloacetate decarboxylase  28.59 
 
 		 607 aa  196  9e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0475332 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3068  oxaloacetate decarboxylase  28.21 
 
 		 611 aa  196  1e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.515821 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1030  oxaloacetate decarboxylase  28.89 
 
 		 608 aa  195  2e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02841  oxaloacetate decarboxylase  27.84 
 
 		 604 aa  195  2e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.698673  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1025  oxaloacetate decarboxylase  28.44 
 
 		 606 aa  195  2e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1306  oxaloacetate decarboxylase  28.05 
 
 		 596 aa  194  4e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00193568  normal  0.0412594 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2986  oxaloacetate decarboxylase  28.05 
 
 		 611 aa  194  4e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.657693 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1199  oxaloacetate decarboxylase  29.19 
 
 		 603 aa  193  6e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.584656  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1066  oxaloacetate decarboxylase  27.88 
 
 		 592 aa  193  1e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1052  oxaloacetate decarboxylase  27.66 
 
 		 599 aa  192  1e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0474655  normal  0.268345 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2893  oxaloacetate decarboxylase  27.59 
 
 		 592 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.345555  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1092  oxaloacetate decarboxylase  27.8 
 
 		 607 aa  190  5e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3165  oxaloacetate decarboxylase  27.63 
 
 		 611 aa  191  5e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.668035 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0137  pyruvate carboxylase subunit B  27.18 
 
 		 577 aa  191  5e-47  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2034  Methylmalonyl-CoA carboxytransferase  30.24 
 
 		 507 aa  190  5.999999999999999e-47  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00118828  decreased coverage  0.000000727606 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1015  pyruvate carboxylase subunit B  27.79 
 
 		 614 aa  190  7e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.091976  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>