More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_1192 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011059  Paes_0916  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  71.67 
 
 		 610 aa  942    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.345122 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1200  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  73.16 
 
 		 609 aa  931    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.45293 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1267  oxaloacetate decarboxylase, alpha subunit  74.13 
 
 		 615 aa  956    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0859  oxaloacetate decarboxylase, alpha subunit  76 
 
 		 650 aa  1026    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00177232  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0808  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  72.3 
 
 		 611 aa  925    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.443377  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1568  Oxaloacetate decarboxylase  77.41 
 
 		 641 aa  1029    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00759156  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1192  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  100 
 
 		 634 aa  1311    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.345988  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1508  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase 2  51.25 
 
 		 600 aa  616  1e-175  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0063  Pyruvate carboxylase  50.47 
 
 		 603 aa  617  1e-175  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000388454  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0964  biotin/lipoyl attachment  50.71 
 
 		 602 aa  612  9.999999999999999e-175  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0659271  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1197  pyruvate carboxylase, subunit B  50 
 
 		 592 aa  609  1e-173  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.278458  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1620  biotin/lipoyl attachment  50.94 
 
 		 609 aa  605  9.999999999999999e-173  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0940  oxaloacetate decarboxylase, alpha subunit, putative  50 
 
 		 599 aa  599  1e-170  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1011  oxaloacetate decarboxylase, alpha subunit, putative  49.38 
 
 		 599 aa  595  1e-169  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0881  oxaloacetate decarboxylase, alpha subunit, putative  49.06 
 
 		 599 aa  595  1e-169  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.178794  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0604  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  48.9 
 
 		 601 aa  588  1e-167  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.984732  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1293  biotin/lipoyl attachment  48.58 
 
 		 613 aa  585  1e-166  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.352378  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1259  pyruvate carboxylase/oxaloacetate decarboxylase beta subunit  46.73 
 
 		 603 aa  552  1e-156  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.911837  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4478  pyruvate carboxylase subunit B  28.9 
 
 		 602 aa  228  3e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3925  pyruvate carboxylase subunit B  28.77 
 
 		 602 aa  226  7e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.246664  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0612  pyruvate carboxylase subunit B  27.39 
 
 		 569 aa  223  8e-57  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.86669  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1341  pyruvate carboxylase subunit B  27.39 
 
 		 569 aa  222  1.9999999999999999e-56  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.421509 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6223  pyruvate carboxylase subunit B  29.21 
 
 		 607 aa  221  3e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71720  pyruvate carboxylase subunit B  29.06 
 
 		 607 aa  219  1e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02060  pyruvate carboxylase subunit B  28.86 
 
 		 599 aa  219  2e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5124  pyruvate carboxylase subunit B  28.77 
 
 		 602 aa  218  2e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.588617 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1556  pyruvate carboxylase subunit B  28.28 
 
 		 604 aa  219  2e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.411533  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5395  pyruvate carboxylase subunit B  28.88 
 
 		 602 aa  217  5e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0145041 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5346  pyruvate carboxylase subunit B  28.88 
 
 		 602 aa  216  8e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00544178 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5255  pyruvate carboxylase subunit B  28.88 
 
 		 602 aa  216  8e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.594563 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5510  oxaloacetate decarboxylase, alpha subunit  28.62 
 
 		 602 aa  215  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5060  pyruvate carboxylase subunit B  28.62 
 
 		 602 aa  215  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5639  pyruvate carboxylase subunit B  28.46 
 
 		 602 aa  213  5.999999999999999e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.509278  normal  0.279946 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1334  pyruvate carboxylase subunit B  27.68 
 
 		 569 aa  211  3e-53  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0796  oxaloacetate decarboxylase  32.39 
 
 		 462 aa  206  8e-52  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0631  pyruvate carboxylase subunit B  26.61 
 
 		 619 aa  205  2e-51  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0119  pyruvate carboxylase subunit B  28.75 
 
 		 584 aa  205  3e-51  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.698581  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0819  oxaloacetate decarboxylase  32.17 
 
 		 462 aa  204  3e-51  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1350  pyruvate carboxylase subunit B  26.76 
 
 		 568 aa  204  4e-51  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1916  pyruvate carboxylase subunit B  27.61 
 
 		 609 aa  204  5e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.566124  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_128  oxaloacetate decarboxylase, alpha subunit  29.15 
 
 		 587 aa  203  7e-51  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1435  pyruvate carboxylase subunit B  27.78 
 
 		 638 aa  202  1.9999999999999998e-50  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000897989  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0250  pyruvate carboxylase subunit B  27.34 
 
 		 582 aa  201  3e-50  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0507  pyruvate carboxylase subunit B  27.77 
 
 		 596 aa  201  3.9999999999999996e-50  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1005  pyruvate carboxylase subunit B  27.07 
 
 		 567 aa  201  3.9999999999999996e-50  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1733  pyruvate carboxylase subunit B  27.68 
 
 		 567 aa  201  5e-50  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0531  pyruvate carboxylase subunit B  27.61 
 
 		 596 aa  199  9e-50  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0139  pyruvate carboxylase subunit B  27.26 
 
 		 616 aa  198  2.0000000000000003e-49  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0177448  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1556  pyruvate carboxylase subunit B  27.08 
 
 		 615 aa  191  2.9999999999999997e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.944098  normal  0.0959021 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0320  oxaloacetate decarboxylase  26.16 
 
 		 605 aa  191  2.9999999999999997e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1512  pyruvate carboxylase subunit B  26.8 
 
 		 617 aa  191  4e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.841478  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0202  oxaloacetate decarboxylase  26.05 
 
 		 599 aa  191  4e-47  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1015  pyruvate carboxylase subunit B  27.58 
 
 		 614 aa  188  2e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.091976  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1784  pyruvate carboxylase subunit B  26.13 
 
 		 582 aa  187  5e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.803588  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2034  Methylmalonyl-CoA carboxytransferase  30.22 
 
 		 507 aa  186  8e-46  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00118828  decreased coverage  0.000000727606 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1606  oxaloacetate decarboxylase alpha subunit  27.1 
 
 		 608 aa  186  1.0000000000000001e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0818232  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1064  pyruvate carboxylase subunit B  25.91 
 
 		 634 aa  185  2.0000000000000003e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000214042  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3189  pyruvate carboxylase subunit B  25.86 
 
 		 577 aa  186  2.0000000000000003e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0075  hypothetical protein  27.12 
 
 		 681 aa  184  5.0000000000000004e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.273109  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1586  pyruvate carboxylase subunit B  27.94 
 
 		 573 aa  183  6e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.526056  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3650  oxaloacetate decarboxylase  27.27 
 
 		 594 aa  181  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2603  pyruvate carboxylase subunit B  25.76 
 
 		 624 aa  180  5.999999999999999e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000143186  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0061  oxaloacetate decarboxylase  27.16 
 
 		 589 aa  180  5.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1582  oxaloacetate decarboxylase  31.02 
 
 		 465 aa  177  4e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3615  oxaloacetate decarboxylase  27.05 
 
 		 589 aa  177  5e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.472152  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1439  oxaloacetate decarboxylase  27.72 
 
 		 462 aa  177  7e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00378235  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1864  oxaloacetate decarboxylase  27.92 
 
 		 458 aa  173  7.999999999999999e-42  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00728685  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1010  pyruvate carboxylase subunit B  25.9 
 
 		 579 aa  173  9e-42  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.843574 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0558  pyruvate carboxylase subunit B  26.68 
 
 		 636 aa  173  1e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0745803  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1435  Pyruvate carboxylase  29.07 
 
 		 507 aa  171  3e-41  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1230  Conserved carboxylase region  29.25 
 
 		 475 aa  171  5e-41  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1284  pyruvate carboxylase subunit B  29.65 
 
 		 618 aa  168  2e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.01303  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1755  oxaloacetate decarboxylase  28.05 
 
 		 461 aa  168  2.9999999999999998e-40  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1306  oxaloacetate decarboxylase  26.85 
 
 		 596 aa  166  2.0000000000000002e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00193568  normal  0.0412594 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0033  oxaloacetate decarboxylase  27.88 
 
 		 499 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000614565  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3084  oxaloacetate decarboxylase  27.88 
 
 		 499 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000401568  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3508  pyruvate carboxylase subunit B  25.08 
 
 		 621 aa  164  4.0000000000000004e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000543633  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1049  oxaloacetate decarboxylase  26.56 
 
 		 592 aa  163  8.000000000000001e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3623  oxaloacetate decarboxylase  25.27 
 
 		 599 aa  162  1e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00192901  decreased coverage  0.000000118523 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0639  oxaloacetate decarboxylase  25.66 
 
 		 595 aa  163  1e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0631  Conserved carboxylase region  28.35 
 
 		 633 aa  161  3e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3336  oxaloacetate decarboxylase  25.23 
 
 		 602 aa  160  8e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000131691 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1736  oxaloacetate decarboxylase  28.85 
 
 		 510 aa  160  8e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3316  pyruvate carboxyltransferase  29.37 
 
 		 502 aa  159  1e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.817216 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0316  oxaloacetate decarboxylase  26.73 
 
 		 501 aa  159  1e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0701  oxaloacetate decarboxylase  27.74 
 
 		 465 aa  158  2e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0334  oxaloacetate decarboxylase  26.5 
 
 		 501 aa  158  3e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.849727  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2425  pyruvate carboxylase subunit B  27.69 
 
 		 571 aa  156  1e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1321  oxaloacetate decarboxylase  25.04 
 
 		 604 aa  156  1e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0140986 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1025  oxaloacetate decarboxylase  25.6 
 
 		 606 aa  155  2e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1525  pyruvate carboxylase subunit B  25.08 
 
 		 643 aa  155  2e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000118935  normal  0.0137179 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3068  oxaloacetate decarboxylase  25.42 
 
 		 611 aa  155  2e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.515821 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1220  oxaloacetate decarboxylase  26.23 
 
 		 601 aa  154  4e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0185712  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3266  oxaloacetate decarboxylase  25.49 
 
 		 607 aa  154  5e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0475332 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1092  oxaloacetate decarboxylase  24.89 
 
 		 607 aa  153  8e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1030  oxaloacetate decarboxylase  24.59 
 
 		 608 aa  153  1e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1594  oxaloacetate decarboxylase  27.39 
 
 		 480 aa  153  1e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.244683  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2986  oxaloacetate decarboxylase  25.08 
 
 		 611 aa  151  3e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.657693 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1319  Conserved carboxylase region  29.75 
 
 		 463 aa  151  4e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3165  oxaloacetate decarboxylase  24.51 
 
 		 611 aa  151  4e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.668035 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>