More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_0941 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_0941  Thioredoxin-disulfide reductase  100 
 
 
313 aa  634    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1531  Thioredoxin-disulfide reductase  69.33 
 
 
313 aa  456  1e-127  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.22031  normal  0.0207408 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0901  Thioredoxin-disulfide reductase  62.62 
 
 
313 aa  397  1e-109  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1451  thioredoxin reductase  48.06 
 
 
322 aa  281  9e-75  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0532473  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2006  thioredoxin-disulfide reductase  45.51 
 
 
319 aa  269  4e-71  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.827549  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03841  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  45.43 
 
 
317 aa  268  1e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.469371 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02311  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  44.34 
 
 
318 aa  266  4e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1578  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  44.03 
 
 
318 aa  264  1e-69  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02881  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  43.53 
 
 
318 aa  263  3e-69  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1699  thioredoxin-disulfide reductase  45.74 
 
 
318 aa  261  8.999999999999999e-69  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02291  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  43.3 
 
 
318 aa  256  5e-67  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02311  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  43.22 
 
 
318 aa  255  7e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.352426  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0213  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  42.99 
 
 
318 aa  254  2.0000000000000002e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02401  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  42.59 
 
 
318 aa  253  2.0000000000000002e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.250311  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1583  thioredoxin-disulfide reductase  44.15 
 
 
297 aa  241  7.999999999999999e-63  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.639711  hitchhiker  0.00905635 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0622  thioredoxin reductase  38.46 
 
 
312 aa  209  4e-53  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00106042  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0470  thioredoxin reductase  39.09 
 
 
409 aa  205  1e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1946  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  37.13 
 
 
427 aa  204  2e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000621838  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2685  thioredoxin reductase  37.74 
 
 
318 aa  199  3e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.118835 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13948  thioredoxin reductase trxB2  40.4 
 
 
335 aa  199  3e-50  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6067  thioredoxin reductase  40.73 
 
 
331 aa  199  7e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.976607  normal  0.125234 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0924  thioredoxin reductase  36.72 
 
 
304 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3108  thioredoxin reductase  40.92 
 
 
310 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.264051  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0887  thioredoxin reductase  39.05 
 
 
319 aa  194  2e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.146962  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4232  thioredoxin reductase  38.59 
 
 
318 aa  193  3e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.7622  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0823  thioredoxin reductase  39.47 
 
 
396 aa  193  3e-48  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5778  thioredoxin reductase  39.68 
 
 
333 aa  193  4e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0605147  normal  0.600469 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5402  thioredoxin reductase  39.68 
 
 
333 aa  193  4e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0839  thioredoxin reductase  40.07 
 
 
336 aa  192  4e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.242227 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5491  thioredoxin reductase  39.68 
 
 
333 aa  193  4e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0634892  normal  0.216162 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0760  thioredoxin reductase  36.84 
 
 
323 aa  192  5e-48  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.474741  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0518  thioredoxin reductase  37.58 
 
 
306 aa  192  6e-48  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31890  thioredoxin-disulfide reductase  39.61 
 
 
353 aa  192  9e-48  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26940  thioredoxin-disulfide reductase  37.3 
 
 
359 aa  191  1e-47  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0542  thioredoxin-disulfide reductase  38.33 
 
 
306 aa  191  2e-47  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2420  thioredoxin reductase  38.28 
 
 
304 aa  191  2e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000290803  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2471  thioredoxin-disulfide reductase  37.62 
 
 
302 aa  191  2e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000932394  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0254  thioredoxin reductase  37.01 
 
 
308 aa  190  2.9999999999999997e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0385075  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_483  thioredoxin reductase  37.58 
 
 
306 aa  190  2.9999999999999997e-47  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4859  thioredoxin reductase  40.39 
 
 
310 aa  189  4e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.143952  normal  0.0952253 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0097  thioredoxin reductase  37.01 
 
 
320 aa  189  4e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.653318  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2343  thioredoxin reductase  39.23 
 
 
322 aa  189  4e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0229  thioredoxin reductase  38.36 
 
 
332 aa  189  5.999999999999999e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4027  thioredoxin reductase  41.03 
 
 
323 aa  188  1e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3928  thioredoxin reductase  37.13 
 
 
318 aa  186  3e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.185424 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6431  thioredoxin reductase  37.05 
 
 
310 aa  186  4e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.2716 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1576  thioredoxin reductase  37.94 
 
 
317 aa  186  5e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0228  thioredoxin reductase  37.94 
 
 
312 aa  186  5e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1613  thioredoxin reductase  37.22 
 
 
322 aa  185  9e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0381  thioredoxin reductase  37.94 
 
 
326 aa  185  1.0000000000000001e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39670  thioredoxin-disulfide reductase  37.34 
 
 
330 aa  185  1.0000000000000001e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.388089 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2812  thioredoxin reductase  34.92 
 
 
326 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0680  thioredoxin reductase  37.34 
 
 
320 aa  184  2.0000000000000003e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0359349  normal  0.0127651 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4503  thioredoxin reductase  37.03 
 
 
346 aa  184  2.0000000000000003e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.219362  normal  0.0129962 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3717  thioredoxin reductase  37.5 
 
 
340 aa  183  3e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.268925  hitchhiker  0.00183833 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0058  thioredoxin reductase  36.99 
 
 
317 aa  183  3e-45  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00992397  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2441  thioredoxin reductase  38.82 
 
 
345 aa  183  3e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0877885  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2361  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  37.66 
 
 
306 aa  183  3e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.244772  hitchhiker  0.000649797 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4687  thioredoxin reductase  39.03 
 
 
329 aa  183  4.0000000000000006e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.323134  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1071  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  34.5 
 
 
555 aa  182  8.000000000000001e-45  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000005332  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14640  thioredoxin-disulfide reductase  36.89 
 
 
332 aa  181  1e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7086  thioredoxin reductase  37.62 
 
 
331 aa  181  1e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4960  thioredoxin reductase  37.86 
 
 
319 aa  180  2e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0030  thioredoxin reductase  37.62 
 
 
320 aa  181  2e-44  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2721  thioredoxin reductase  37.85 
 
 
324 aa  181  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.137171  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0058  thioredoxin reductase  36.3 
 
 
317 aa  181  2e-44  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0360012  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2772  thioredoxin reductase  39.1 
 
 
321 aa  181  2e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2750  thioredoxin-disulfide reductase  35.41 
 
 
312 aa  180  2e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2436  thioredoxin-disulfide reductase  35.41 
 
 
312 aa  180  2e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0256  thioredoxin reductase  36.86 
 
 
335 aa  180  2e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.464072 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0145  thioredoxin reductase  37.69 
 
 
321 aa  180  2.9999999999999997e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2879  thioredoxin reductase  36.93 
 
 
312 aa  180  2.9999999999999997e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1919  thioredoxin reductase  37.17 
 
 
306 aa  179  4e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1226  thioredoxin reductase  37.42 
 
 
325 aa  179  4.999999999999999e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4579  thioredoxin reductase  39.16 
 
 
317 aa  179  5.999999999999999e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.777909  hitchhiker  0.00491977 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2982  thioredoxin reductase  36.91 
 
 
324 aa  179  5.999999999999999e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0371232 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2112  thioredoxin reductase  37.07 
 
 
324 aa  179  7e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0949537  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0579  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  37.99 
 
 
325 aa  178  8e-44  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.455766  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5097  thioredoxin reductase  39.16 
 
 
362 aa  177  1e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.121367  hitchhiker  0.000000380245 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0181  thioredoxin reductase  37.42 
 
 
334 aa  178  1e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl064  thioredoxin reductase NADPH  36.24 
 
 
311 aa  178  1e-43  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1576  thioredoxin reductase  38.41 
 
 
327 aa  178  1e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.608559  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0086  thioredoxin reductase  36.33 
 
 
320 aa  177  1e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.585746 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4161  thioredoxin reductase  37.95 
 
 
318 aa  178  1e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.307371  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6803  thioredoxin reductase, FAD/NAD(P)-binding  38.24 
 
 
321 aa  178  1e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.2043  normal  0.741138 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9376  thioredoxin reductase  36.6 
 
 
310 aa  177  2e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3815  thioredoxin reductase  33.76 
 
 
316 aa  177  2e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0152515  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0114  thioredoxin reductase  36.16 
 
 
308 aa  177  2e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000498339  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3793  thioredoxin reductase  37.5 
 
 
325 aa  177  2e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.119595  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25100  thioredoxin reductase  34.91 
 
 
552 aa  177  2e-43  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.19765  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1248  thioredoxin reductase  37.54 
 
 
324 aa  177  2e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.335568  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4853  thioredoxin reductase  36.42 
 
 
330 aa  177  2e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.838149  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3701  thioredoxin reductase  36.88 
 
 
318 aa  177  3e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.600246  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0563  thioredoxin reductase  37.3 
 
 
326 aa  176  4e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0552475  normal  0.0148693 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2753  thioredoxin reductase  37.3 
 
 
320 aa  176  4e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3838  thioredoxin reductase  38.11 
 
 
321 aa  176  4e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0907  Thioredoxin-disulfide reductase  35.74 
 
 
547 aa  176  5e-43  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000675051  normal  0.496773 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0614  thioredoxin reductase  36.42 
 
 
313 aa  176  5e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.305667  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23380  thioredoxin-disulfide reductase  36.63 
 
 
333 aa  176  5e-43  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3368  thioredoxin reductase  35.71 
 
 
330 aa  175  7e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.244664  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>