290 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_0937 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_0937  chlorophyllide reductase iron protein subunit X  100 
 
 
372 aa  758    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1535  chlorophyllide reductase iron protein subunit X  74.05 
 
 
365 aa  548  1e-155  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.292172  normal  0.0217876 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0979  chlorophyllide reductase iron protein subunit X  72.4 
 
 
370 aa  535  1e-151  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0897  chlorophyllide reductase iron protein subunit X  70.92 
 
 
365 aa  522  1e-147  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.159363  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1792  chlorophyllide reductase iron protein subunit X  69.13 
 
 
368 aa  513  1e-144  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.344281  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0400  chlorophyllide reductase iron protein subunit X  67.76 
 
 
369 aa  499  1e-140  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0534457  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1423  chlorophyllide reductase iron protein subunit X  68.48 
 
 
366 aa  493  9.999999999999999e-139  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3127  chlorophyllide reductase iron protein subunit X  50.84 
 
 
411 aa  305  8.000000000000001e-82  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3260  chlorophyllide reductase iron protein subunit X  46.53 
 
 
392 aa  292  6e-78  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0257772 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3746  chlorophyllide reductase iron protein subunit X  48.83 
 
 
392 aa  289  7e-77  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0605815  hitchhiker  0.0000012212 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3517  bacteriachlorophyllide reductase iron protein subunit X  44.9 
 
 
335 aa  231  1e-59  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.326677 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1293  chlorophyllide reductase iron protein subunit X  45.12 
 
 
331 aa  231  1e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.579367  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2980  chlorophyllide reductase iron protein subunit X  45.45 
 
 
322 aa  230  2e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.551452  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4001  chlorophyllide reductase iron protein subunit X  49.42 
 
 
332 aa  231  2e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.18225  hitchhiker  0.00239808 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0262  chlorophyllide reductase, BchX subunit  46.48 
 
 
333 aa  230  3e-59  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1906  chlorophyllide reductase iron protein subunit X  46.48 
 
 
333 aa  230  3e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.195312  normal  0.342059 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0179  chlorophyllide reductase iron protein subunit X  52.65 
 
 
332 aa  228  1e-58  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6437  bacteriochlorophyllide reductase subunit  44.06 
 
 
332 aa  227  2e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.967786  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1710  chlorophyllide reductase iron protein subunit X  49.03 
 
 
332 aa  228  2e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2036  chlorophyllide reductase iron protein subunit X  47.84 
 
 
333 aa  226  5.0000000000000005e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.128879  normal  0.148477 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2052  chlorophyllide reductase iron protein subunit X  44.37 
 
 
329 aa  226  6e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0401365 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3756  chlorophyllide reductase iron protein subunit X  43.73 
 
 
332 aa  225  1e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00499393 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1610  chlorophyllide reductase iron protein subunit X  43.58 
 
 
308 aa  224  3e-57  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2818  chlorophyllide reductase iron protein subunit X  45.8 
 
 
334 aa  217  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.292291  normal  0.370983 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2957  chlorophyllide reductase iron protein subunit X  45.45 
 
 
334 aa  216  7e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.562644  normal  0.106043 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2730  chlorophyllide reductase iron protein subunit X  45.1 
 
 
334 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.44114  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2852  chlorophyllide reductase iron protein subunit X  44.76 
 
 
334 aa  210  3e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.467181 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3697  chlorophyllide reductase iron protein subunit X  50.22 
 
 
334 aa  209  5e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.326081  hitchhiker  0.00364932 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1815  Nitrogenase  40.78 
 
 
251 aa  173  5e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0803  nitrogenase reductase-like protein  39.47 
 
 
292 aa  171  2e-41  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.186385  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0506  nitrogenase reductase-like protein  37.93 
 
 
290 aa  171  3e-41  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1528  nitrogenase reductase-like protein  39.7 
 
 
313 aa  168  1e-40  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0237  Nitrogenase  44.09 
 
 
272 aa  168  2e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.848648  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1152  nitrogenase reductase-like protein  38.78 
 
 
292 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1616  NifH/frxC-family protein  35.84 
 
 
276 aa  165  1.0000000000000001e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1147  nitrogenase reductase-like protein  37.74 
 
 
292 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1224  nitrogenase reductase-like protein  39.16 
 
 
278 aa  163  5.0000000000000005e-39  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0793  nitrogenase  41.82 
 
 
280 aa  162  7e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00476725  normal  0.0446468 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0774  nitrogenase  36.52 
 
 
290 aa  161  1e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0165  nitrogenase iron protein subunit NifH  41.78 
 
 
268 aa  160  3e-38  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1813  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  38.7 
 
 
276 aa  160  4e-38  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0217  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  39.92 
 
 
276 aa  159  5e-38  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3978  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  37.28 
 
 
312 aa  159  6e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.475922  normal  0.178633 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2027  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  42.6 
 
 
275 aa  159  7e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0592137 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0171  nitrogenase reductase  39.46 
 
 
273 aa  159  8e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.217628  normal  0.670038 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0404  NifH/frxC-family protein  41.45 
 
 
731 aa  159  1e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.394931 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2192  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  42.41 
 
 
275 aa  158  1e-37  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1733  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  36.92 
 
 
312 aa  158  2e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1201  nitrogenase iron protein  35.25 
 
 
273 aa  158  2e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1041  nitrogenase iron protein subunit NifH  38.52 
 
 
248 aa  158  2e-37  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.343788  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0326  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  42.41 
 
 
275 aa  157  3e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0117283  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1353  nitrogenase iron protein  37.11 
 
 
292 aa  157  3e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000220216  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0795  nitrogenase iron protein  39.91 
 
 
291 aa  157  4e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.835028  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2886  Nitrogenase  41.63 
 
 
290 aa  156  6e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.781168  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2083  nitrogenase  37.89 
 
 
270 aa  156  7e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2907  nitrogenase iron protein  41.18 
 
 
289 aa  155  8e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1038  nitrogenase iron protein subunit NifH  36.29 
 
 
264 aa  155  8e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000199125  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1023  nitrogenase iron protein  36.82 
 
 
275 aa  155  8e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1908  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  39.92 
 
 
273 aa  155  9e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00331132 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1627  nitrogenase reductase  37.45 
 
 
274 aa  155  1e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000481616  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4043  nitrogenase iron protein  34.39 
 
 
273 aa  155  1e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0162942 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1751  nitrogenase reductase  39.3 
 
 
274 aa  155  1e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.555016  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2386  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  42.41 
 
 
275 aa  155  1e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1949  nitrogenase reductase  37.45 
 
 
274 aa  155  1e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00645764  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2597  nitrogenase iron protein  40.72 
 
 
289 aa  154  2e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.036256  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2258  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  41.26 
 
 
275 aa  154  2.9999999999999998e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00421326  normal  0.488321 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1931  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  40.45 
 
 
297 aa  153  4e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.47686 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0288  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  40.45 
 
 
297 aa  153  4e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1538  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  41.96 
 
 
273 aa  153  4e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000698797 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1019  nitrogenase reductase  40.99 
 
 
274 aa  154  4e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.855562  normal  0.490785 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0561  nitrogenase iron protein  36.15 
 
 
276 aa  151  1e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.0000368653  normal  0.199489 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2821  nitrogenase iron protein  37.74 
 
 
272 aa  151  1e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.436411  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0408  nitrogenase  40.27 
 
 
254 aa  151  2e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1007  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  40 
 
 
297 aa  151  2e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.474133 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0274  nitrogenase iron protein  33.45 
 
 
291 aa  151  2e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.23577  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0685  nitrogenase reductase  40.09 
 
 
274 aa  150  3e-35  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1528  nitrogenase reductase  40.09 
 
 
274 aa  150  3e-35  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0095  Nitrogenase  41.54 
 
 
299 aa  150  3e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0228262 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3030  nitrogenase iron protein  37.5 
 
 
288 aa  150  3e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2008  nitrogenase iron protein  36.02 
 
 
324 aa  150  3e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.221735  normal  0.365396 
 
 
-
 
NC_002936  DET1158  nitrogenase reductase  40.09 
 
 
274 aa  150  4e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0741  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  37.91 
 
 
296 aa  150  4e-35  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0620  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  40.81 
 
 
295 aa  150  4e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  unclonable  0.0000136812  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3537  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  40 
 
 
299 aa  150  4e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2098  nitrogenase iron protein  33.57 
 
 
292 aa  149  8e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1142  nitrogenase iron protein  35.77 
 
 
276 aa  149  9e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.442855  normal  0.809863 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4813  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  36.2 
 
 
297 aa  149  9e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.124271  normal  0.0880049 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1244  nitrogenase reductase  37.4 
 
 
274 aa  149  1.0000000000000001e-34  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000240583  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3467  nitrogenase iron protein  34.02 
 
 
288 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0744  nitrogenase reductase  37.02 
 
 
274 aa  148  1.0000000000000001e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1937  nitrogenase  35.64 
 
 
272 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.894359  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1538  Nitrogenase  37.7 
 
 
259 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.925068  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07931  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  42.01 
 
 
296 aa  147  2.0000000000000003e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5358  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  36.2 
 
 
297 aa  147  3e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.142804  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2613  nitrogenase reductase  36.15 
 
 
276 aa  147  3e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1845  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  35.48 
 
 
297 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0704164 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5280  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  35.84 
 
 
297 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.174082  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1621  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  41.74 
 
 
299 aa  146  5e-34  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.534029  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3203  nitrogenase iron protein  34.48 
 
 
288 aa  146  7.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1573  nitrogenase iron protein subunit NifH  39.46 
 
 
284 aa  145  8.000000000000001e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>