More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_2709 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008639  Cpha266_2709  F0F1 ATP synthase subunit A  100 
 
 
342 aa  678    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.018476  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2885  F0F1 ATP synthase subunit A  76.23 
 
 
340 aa  503  1e-141  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000677372  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0064  F0F1 ATP synthase subunit A  75.94 
 
 
345 aa  475  1e-133  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2098  F0F1 ATP synthase subunit A  76.55 
 
 
341 aa  436  1e-121  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2247  F0F1 ATP synthase subunit A  79.85 
 
 
324 aa  405  1.0000000000000001e-112  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.608191  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2502  F0F1 ATP synthase subunit A  75.19 
 
 
338 aa  384  1e-105  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4487  F0F1 ATP synthase subunit A  45.93 
 
 
406 aa  220  3e-56  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.553444  normal  0.0963007 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5025  ATP synthase F0, A subunit  50 
 
 
364 aa  218  2e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.436472  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4495  F0F1 ATP synthase subunit A  46.36 
 
 
384 aa  211  2e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4340  F0F1 ATP synthase subunit A  45.45 
 
 
381 aa  199  6e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.35318  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4476  F0F1 ATP synthase subunit A  44.37 
 
 
384 aa  194  2e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0392  ATP synthase F0, A subunit  39.84 
 
 
373 aa  194  2e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.726287 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1055  ATP synthase F0, A subunit  43.66 
 
 
391 aa  186  5e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3216  ATP synthase F0, A subunit  38.53 
 
 
373 aa  181  1e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.100229 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0061  ATP synthase F0 subunit A  43.09 
 
 
339 aa  177  3e-43  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0179  ATP synthase, subunit A (H(+)-transporting two-sector ATPase)  37.92 
 
 
376 aa  175  9e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.412196  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1718  ATP synthase F0, A subunit  46.61 
 
 
355 aa  166  4e-40  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0314608  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0311  ATP synthase F0, A subunit  40.5 
 
 
400 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00150281  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03040  putative ATP synthase A chain  43.83 
 
 
361 aa  154  2.9999999999999998e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1644  ATP synthase F0, A subunit  35.96 
 
 
258 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.283093  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1229  ATP synthase F0, A subunit  42.4 
 
 
380 aa  139  8.999999999999999e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.896245 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1973  ATP synthase F0, A subunit  35.52 
 
 
303 aa  137  3.0000000000000003e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000495974  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1039  ATP synthase F0, A subunit  36.25 
 
 
261 aa  131  2.0000000000000002e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0480809 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1515  ATP synthase F0, A subunit  36.36 
 
 
248 aa  130  4.0000000000000003e-29  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000105454 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3674  F0F1 ATP synthase subunit A  34.15 
 
 
268 aa  121  1.9999999999999998e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000787111  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3713  F0F1 ATP synthase subunit A  41.67 
 
 
284 aa  119  4.9999999999999996e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0872  F0F1 ATP synthase subunit A  35.95 
 
 
243 aa  117  3e-25  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.397381  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1304  ATP synthase F0, A subunit  35.02 
 
 
266 aa  112  1.0000000000000001e-23  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.000065102  normal  0.293813 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1066  ATP synthase F0, A subunit  35.09 
 
 
261 aa  110  3e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1086  F0F1 ATP synthase subunit A  33.47 
 
 
243 aa  109  7.000000000000001e-23  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0970  ATP synthase F0, A subunit  32.6 
 
 
207 aa  109  9.000000000000001e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000117673  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3246  F0F1 ATP synthase subunit A  31.97 
 
 
241 aa  108  1e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.911216  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0170  ATP synthase F0, A subunit  42.78 
 
 
339 aa  107  4e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.222204  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1801  ATP synthase F0, A subunit  34.24 
 
 
257 aa  106  7e-22  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.339672  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6142  ATP synthase F0, A subunit  30.93 
 
 
283 aa  105  8e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0697  F0F1 ATP synthase subunit A  30 
 
 
260 aa  105  1e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1780  ATP synthase F0, A subunit  34.05 
 
 
281 aa  104  2e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2795  ATP synthase F0, A subunit  36.4 
 
 
234 aa  104  3e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.073854  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1076  F0F1 ATP synthase subunit A  33.33 
 
 
261 aa  103  3e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0951  ATP synthase F0, A subunit  33.63 
 
 
234 aa  102  1e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.162071  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1500  ATP synthase F0, A subunit  35.64 
 
 
229 aa  101  1e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.872932  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17870  ATP synthase F0, A subunit  31.62 
 
 
216 aa  101  2e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12110  F0F1-type ATP synthase, alpha subunit  28.92 
 
 
263 aa  101  2e-20  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2454  ATP synthase F0, A subunit  31.05 
 
 
272 aa  101  2e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1316  F0F1 ATP synthase subunit A  32.91 
 
 
260 aa  100  4e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3499  F0F1 ATP synthase subunit A  31.08 
 
 
251 aa  100  4e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3175  F0F1 ATP synthase subunit A  31.08 
 
 
251 aa  100  4e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0427  F0F1 ATP synthase subunit A  31.71 
 
 
241 aa  100  5e-20  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0574735  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3370  F0F1 ATP synthase subunit A  31.08 
 
 
251 aa  100  5e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0220561  normal  0.798518 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1018  F0F1 ATP synthase subunit A  31.33 
 
 
295 aa  99  9e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.147129  normal  0.90193 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0894  ATP synthase F0 subunit A  32.05 
 
 
263 aa  99  1e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0015  ATP synthase F0, A subunit  34.87 
 
 
234 aa  99  1e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000326077  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3359  H+-transporting two-sector ATPase, A subunit  32.56 
 
 
229 aa  98.2  2e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000661102  hitchhiker  0.00336377 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0397  F0F1 ATP synthase subunit A  34.64 
 
 
251 aa  98.2  2e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.923861  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1757  ATP synthase F0, A subunit  34.23 
 
 
276 aa  98.6  2e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.731668  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21460  F0F1-type ATP synthase, alpha subunit  29.58 
 
 
267 aa  97.4  3e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0599  ATP synthase F0, A subunit  34.16 
 
 
229 aa  97.4  3e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19190  F0F1-type ATP synthase, alpha subunit  31.62 
 
 
247 aa  97.1  4e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0714  F0F1 ATP synthase subunit A  32.83 
 
 
251 aa  97.1  4e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.211309  normal  0.557455 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1212  F0F1 ATP synthase subunit A  33.33 
 
 
283 aa  96.7  6e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6944  F0F1 ATP synthase subunit A  30 
 
 
251 aa  96.3  7e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0362387 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0396  F0F1 ATP synthase subunit A  31.3 
 
 
243 aa  95.9  9e-19  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0334  ATP synthase F0, A subunit  31.67 
 
 
229 aa  95.9  1e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00388354  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06110  F0F1 ATP synthase subunit A  29.76 
 
 
255 aa  95.5  1e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0743  F0F1 ATP synthase subunit A  32.2 
 
 
253 aa  95.1  1e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.230064  normal  0.396268 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0929  F0F1 ATP synthase subunit A  31.6 
 
 
250 aa  95.5  1e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1665  F0F1 ATP synthase subunit A  30.04 
 
 
263 aa  95.1  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.766695  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4248  ATP synthase F0, A subunit  33.01 
 
 
229 aa  94.4  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000462325  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09970  ATP synthase F0 subcomplex A subunit  31.67 
 
 
294 aa  94  3e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3142  ATP synthase F0, A subunit  32.67 
 
 
230 aa  94  4e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000247619  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4018  ATP synthase F0, A subunit  31.87 
 
 
265 aa  93.6  5e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.457408  decreased coverage  0.0000501156 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0376  F0F1 ATP synthase subunit A  32.8 
 
 
252 aa  93.6  5e-18  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4571  F0F1 ATP synthase subunit A  29.74 
 
 
248 aa  93.2  5e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0500  F0F1 ATP synthase subunit A  31.73 
 
 
249 aa  93.2  5e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.215569  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0877  ATP synthase F0, A subunit  32.83 
 
 
217 aa  93.2  6e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2602  F0F1 ATP synthase subunit A  27.65 
 
 
251 aa  92.8  7e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00882064  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2514  F0F1 ATP synthase subunit A  28.28 
 
 
249 aa  92.4  1e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.733206  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2066  ATP synthase F0, A subunit  32.34 
 
 
233 aa  92.4  1e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.120848 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1310  ATP synthase F0 subunit A  30.11 
 
 
265 aa  91.3  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.146401  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3931  ATP synthase F0, A subunit  32.34 
 
 
229 aa  91.7  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000143086  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7657  F0F1 ATP synthase subunit A  28.45 
 
 
251 aa  91.7  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0416353  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2813  ATP synthase F0, A subunit  30.11 
 
 
249 aa  90.9  3e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0159651  normal  0.290047 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3636  ATP synthase F0, A subunit  29.54 
 
 
259 aa  90.9  3e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.595965  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3209  ATP synthase F0, A subunit  30.11 
 
 
249 aa  90.9  3e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.116746  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0846  F0F1 ATP synthase subunit A  30 
 
 
247 aa  90.5  3e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.372067 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4015  ATP synthase F0, A subunit  31.49 
 
 
229 aa  90.5  4e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.91883e-28 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1388  ATP synthase F0, A subunit  29.24 
 
 
233 aa  90.5  4e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4483  F0F1 ATP synthase subunit A  30.38 
 
 
261 aa  90.1  4e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.639337 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0447  F0F1 ATP synthase subunit A  31.64 
 
 
250 aa  90.5  4e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.726542  normal  0.18577 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1129  F0F1 ATP synthase subunit A  28.92 
 
 
270 aa  90.1  5e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4468  F0F1 ATP synthase subunit A  32.81 
 
 
282 aa  89.7  7e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.0000195299  hitchhiker  0.00000000198513 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0394  F0F1 ATP synthase subunit A  32.79 
 
 
249 aa  89.4  8e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0382  F0F1 ATP synthase subunit A  32.79 
 
 
249 aa  89.4  9e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3922  ATP synthase F0, A subunit  28.33 
 
 
267 aa  88.6  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4624  ATP synthase F0, A subunit  26.55 
 
 
312 aa  89  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2333  F0F1 ATP synthase subunit A  31.02 
 
 
288 aa  88.6  1e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000306591  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0190  F0F1 ATP synthase subunit A  33.19 
 
 
261 aa  88.6  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2699  F0F1 ATP synthase subunit A  33.19 
 
 
261 aa  89  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.911208  normal  0.0328457 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2030  F0F1 ATP synthase subunit A  30.18 
 
 
288 aa  88.6  2e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000175167  normal  0.027211 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1038  F0F1 ATP synthase subunit A  33.19 
 
 
247 aa  88.2  2e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>