More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_2585 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008639  Cpha266_2585  ribosomal protein L11 methyltransferase  100 
 
 
289 aa  587  1e-167  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.188755  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2421  ribosomal protein L11 methyltransferase  76.57 
 
 
293 aa  459  9.999999999999999e-129  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2820  ribosomal protein L11 methyltransferase  73.17 
 
 
288 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2061  ribosomal protein L11 methyltransferase  69.5 
 
 
286 aa  402  1e-111  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2021  ribosomal protein L11 methyltransferase  63.86 
 
 
288 aa  384  1e-105  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2179  ribosomal protein L11 methyltransferase  64.91 
 
 
290 aa  379  1e-104  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2447  ribosomal protein L11 methyltransferase  63.86 
 
 
287 aa  348  6e-95  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2327  ribosomal L11 methyltransferase  37.55 
 
 
285 aa  143  4e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1993  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.81 
 
 
278 aa  140  1.9999999999999998e-32  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5617  ribosomal L11 methyltransferase  32.74 
 
 
276 aa  139  7e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.395097 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6514  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.85 
 
 
285 aa  138  1e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.210209  normal  0.104822 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3738  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.94 
 
 
312 aa  133  3.9999999999999996e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.71543 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3507  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.25 
 
 
293 aa  129  4.0000000000000003e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.340912  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0635  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.87 
 
 
311 aa  123  4e-27  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.312814 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0573  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  32.54 
 
 
318 aa  121  9.999999999999999e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3276  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.17 
 
 
279 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2455  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.71 
 
 
302 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000737706  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13478  putative ribosomal protein L11 methyltransferase  36.89 
 
 
276 aa  114  2.0000000000000002e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.248729  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0996  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.71 
 
 
305 aa  112  6e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1569  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.67 
 
 
278 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.641228  normal  0.177131 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0528  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.49 
 
 
295 aa  110  2.0000000000000002e-23  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0113889  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15141  ribosomal protein L11 methyltransferase  28.52 
 
 
300 aa  110  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0855  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.86 
 
 
315 aa  110  2.0000000000000002e-23  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000257486  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1724  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.27 
 
 
327 aa  109  6e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1576  ribosomal protein L11 methyltransferase-like protein  29.53 
 
 
307 aa  109  7.000000000000001e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0767269  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0465  ribosomal L11 methyltransferase  25.78 
 
 
292 aa  108  1e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4163  ribosomal protein L11 methyltransferase  29.06 
 
 
312 aa  108  1e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000153463  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2494  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.2 
 
 
308 aa  107  2e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00440175  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3897  ribosomal protein L11 methyltransferase  28.99 
 
 
290 aa  107  2e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.147825 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4297  ribosomal protein L11 methyltransferase  38.29 
 
 
312 aa  107  3e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000247915  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3219  ribosomal protein L11 methyltransferase  28.57 
 
 
307 aa  106  4e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000607744  hitchhiker  0.0000170628 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3447  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.35 
 
 
300 aa  106  4e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.801921  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2959  ribosomal protein L11 methyltransferase  29.52 
 
 
309 aa  106  6e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000148567  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3386  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  30 
 
 
299 aa  105  8e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0387461  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0225  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.93 
 
 
306 aa  105  8e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4431  ribosomal protein L11 methyltransferase  28.9 
 
 
312 aa  105  9e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00225658  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4393  ribosomal protein L11 methyltransferase  28.9 
 
 
312 aa  104  1e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000946748  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4445  ribosomal protein L11 methyltransferase  28.9 
 
 
312 aa  105  1e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000232951  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0447  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.33 
 
 
299 aa  103  2e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4211  ribosomal protein L11 methyltransferase  28.52 
 
 
312 aa  104  2e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000228671  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4049  ribosomal protein L11 methyltransferase  28.52 
 
 
312 aa  104  2e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0005166  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4059  ribosomal protein L11 methyltransferase  28.52 
 
 
312 aa  104  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000479623  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0805  ribosomal protein L11 methyltransferase  28.52 
 
 
312 aa  104  2e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000461178  decreased coverage  1.14716e-22 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4537  ribosomal protein L11 methyltransferase  28.52 
 
 
312 aa  104  2e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0104704  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4334  ribosomal protein L11 methyltransferase  28.52 
 
 
312 aa  104  2e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.10013e-48 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0241  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.78 
 
 
306 aa  102  5e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000356795  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2691  ribosomal protein L11 methyltransferase  29.96 
 
 
303 aa  102  6e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000606205  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05251  ribosomal protein L11 methyltransferase  28.23 
 
 
301 aa  101  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3038  ribosomal protein L11 methyltransferase  29.67 
 
 
312 aa  99.8  5e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000244532  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1146  ribosomal protein L11 methyltransferase  26.77 
 
 
312 aa  99  9e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1500  ribosomal protein L11 methyltransferase  25.6 
 
 
299 aa  99  9e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4290  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.39 
 
 
315 aa  98.6  1e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000135815  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0718  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.08 
 
 
319 aa  98.2  1e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000247625  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3686  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.79 
 
 
300 aa  97.4  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1320  ribosomal protein L11 methyltransferase  29.95 
 
 
313 aa  97.1  3e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.740107  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2435  ribosomal protein L11 methyltransferase  27.59 
 
 
315 aa  97.1  3e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0183971  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15391  ribosomal protein L11 methyltransferase  28.2 
 
 
303 aa  96.7  4e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2284  ribosomal protein L11 methyltransferase  27.76 
 
 
313 aa  96.7  4e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0446  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.68 
 
 
293 aa  95.9  6e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.119875  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2427  ribosomal protein L11 methyltransferase  28.77 
 
 
296 aa  95.5  8e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.493009  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2376  ribosomal protein L11 methyltransferase  29.11 
 
 
296 aa  95.9  8e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1999  ribosomal protein L11 methyltransferase  27.4 
 
 
313 aa  95.5  9e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0096  ribosomal L11 methyltransferase  31.16 
 
 
303 aa  95.1  1e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0267  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.23 
 
 
287 aa  95.1  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0167166  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0256  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.23 
 
 
287 aa  95.1  1e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.204257  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00173  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.77 
 
 
295 aa  94.4  2e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0529  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.76 
 
 
300 aa  94.4  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.579214  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0505  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.76 
 
 
300 aa  94.4  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1549  ribosomal protein L11 methyltransferase  29 
 
 
304 aa  93.6  3e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1994  ribosomal protein L11 methyltransferase  25.6 
 
 
316 aa  93.6  3e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.467353  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1852  ribosomal L11 methyltransferase  28.67 
 
 
282 aa  94  3e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.524439  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2077  ribosomal protein L11 methyltransferase  27.97 
 
 
308 aa  94  3e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2286  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  31.89 
 
 
299 aa  93.6  3e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2837  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.71 
 
 
294 aa  93.6  4e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.104112  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3442  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.86 
 
 
293 aa  93.2  4e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.116345  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0506  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.78 
 
 
293 aa  93.2  4e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0662184  hitchhiker  0.00329443 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3963  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.43 
 
 
293 aa  93.2  4e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00574631  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2149  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.57 
 
 
295 aa  92.8  5e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.346367  normal  0.238348 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002195  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.2 
 
 
295 aa  92.8  6e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00271176  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2055  ribosomal protein L11 methyltransferase  28.26 
 
 
286 aa  92.8  6e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0246  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  34.44 
 
 
287 aa  92.8  6e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0486812  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2573  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.01 
 
 
292 aa  92.4  7e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.316492  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4117  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.95 
 
 
293 aa  92.4  7e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0350894  hitchhiker  0.000425949 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17811  ribosomal protein L11 methyltransferase  27.11 
 
 
311 aa  92.4  7e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.578713  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1015  ribosomal protein L11 methyltransferase  27.63 
 
 
312 aa  92.4  8e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0120  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.76 
 
 
300 aa  92.4  8e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1188  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.99 
 
 
296 aa  92.4  8e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.158292  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0603  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.76 
 
 
300 aa  92.4  8e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3938  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.69 
 
 
293 aa  91.7  1e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000797733  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2834  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.3 
 
 
292 aa  91.7  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.180106  normal  0.0556009 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3109  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.92 
 
 
321 aa  92  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00713701  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2781  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.18 
 
 
300 aa  90.9  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1451  ribosomal protein L11 methyltransferase  28.57 
 
 
303 aa  91.3  2e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.279923  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0092  ribosomal protein L11 methyltransferase  27.48 
 
 
292 aa  90.9  2e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0572  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.18 
 
 
300 aa  90.5  3e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000573675 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3428  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.79 
 
 
300 aa  90.5  3e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.244966  normal  0.0610073 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4079  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.29 
 
 
293 aa  90.1  3e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0139274  normal  0.0416888 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0401  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.71 
 
 
293 aa  90.5  3e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0130632  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3624  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.71 
 
 
293 aa  90.5  3e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000162524  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0400  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.71 
 
 
293 aa  90.5  3e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0151894  normal  0.0533338 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>