More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_1533 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008639  Cpha266_1533  phosphomethylpyrimidine kinase  100 
 
 		 271 aa  551  1e-156  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.847174  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1501  phosphomethylpyrimidine kinase  56.09 
 
 		 271 aa  290  1e-77  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1407  phosphomethylpyrimidine kinase  55.6 
 
 		 267 aa  278  9e-74  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1004  phosphomethylpyrimidine kinase  54.85 
 
 		 275 aa  258  1e-67  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0817  phosphomethylpyrimidine kinase  53.7 
 
 		 275 aa  256  2e-67  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.237614  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1281  phosphomethylpyrimidine kinase  51.85 
 
 		 273 aa  239  2.9999999999999997e-62  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0223947  normal  0.790704 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0957  phosphomethylpyrimidine kinase  50.95 
 
 		 269 aa  234  1.0000000000000001e-60  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.297451  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4984  phosphomethylpyrimidine kinase  47.35 
 
 		 268 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.702252  normal  0.243702 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4934  phosphomethylpyrimidine kinase  46.97 
 
 		 268 aa  218  8.999999999999998e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.566917  normal  0.666851 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4470  phosphomethylpyrimidine kinase  46.59 
 
 		 268 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.668119  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0125  phosphomethylpyrimidine kinase  46.01 
 
 		 285 aa  213  1.9999999999999998e-54  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.713324 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2522  phosphomethylpyrimidine kinase  46.84 
 
 		 262 aa  213  1.9999999999999998e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2331  phosphomethylpyrimidine kinase  46.97 
 
 		 288 aa  210  2e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0918  phosphomethylpyrimidine kinase  42.59 
 
 		 269 aa  208  9e-53  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0071  phosphomethylpyrimidine kinase  45.39 
 
 		 267 aa  207  1e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1338  phosphomethylpyrimidine kinase  44.66 
 
 		 264 aa  206  3e-52  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00019728  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2517  phosphomethylpyrimidine kinase  46.3 
 
 		 260 aa  206  4e-52  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3018  phosphomethylpyrimidine kinase  46.79 
 
 		 270 aa  204  2e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2289  phosphomethylpyrimidine kinase  43.82 
 
 		 266 aa  202  3e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.426705  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2490  phosphomethylpyrimidine kinase  43.82 
 
 		 266 aa  202  3e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4453  phosphomethylpyrimidine kinase  43.7 
 
 		 270 aa  203  3e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.800707  normal  0.352817 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2382  phosphomethylpyrimidine kinase  43.82 
 
 		 266 aa  203  3e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.779831 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1176  phosphomethylpyrimidine kinase  44.87 
 
 		 267 aa  202  4e-51  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.82174  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2711  phosphomethylpyrimidine kinase  42.8 
 
 		 267 aa  202  5e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.725967  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2378  phosphomethylpyrimidine kinase  43.82 
 
 		 266 aa  202  5e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.305846  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2333  phosphomethylpyrimidine kinase  43.45 
 
 		 266 aa  202  5e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2710  phosphomethylpyrimidine kinase  41.95 
 
 		 266 aa  199  3e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.227545  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1545  phosphomethylpyrimidine kinase  43.89 
 
 		 264 aa  199  3e-50  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.104036  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2979  phosphomethylpyrimidine kinase  42.21 
 
 		 267 aa  199  3e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1992  phosphomethylpyrimidine kinase  45.08 
 
 		 270 aa  199  3e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1554  phosphomethylpyrimidine kinase  42.32 
 
 		 266 aa  199  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1544  phosphomethylpyrimidine kinase  42.32 
 
 		 266 aa  199  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2239  phosphomethylpyrimidine kinase  42.32 
 
 		 266 aa  199  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0961  phosphomethylpyrimidine kinase  42.32 
 
 		 266 aa  199  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2391  phosphomethylpyrimidine kinase  42.32 
 
 		 266 aa  199  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1443  phosphomethylpyrimidine kinase  46.56 
 
 		 269 aa  199  3.9999999999999996e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.600581  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3091  phosphomethylpyrimidine kinase  42.75 
 
 		 266 aa  199  3.9999999999999996e-50  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0488797  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1135  phosphomethylpyrimidine kinase  42.32 
 
 		 266 aa  199  3.9999999999999996e-50  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.878652  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5600  hydroxy-methylpyrimidine kinase /hydroxy-phosphomethylpyrimidine kinase  43.77 
 
 		 266 aa  199  6e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.429432  normal  0.105983 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3082  phosphomethylpyrimidine kinase  42.32 
 
 		 266 aa  199  6e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.190737 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02031  phosphomethylpyrimidine kinase  41.95 
 
 		 266 aa  198  7e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01995  hypothetical protein  41.95 
 
 		 266 aa  198  7e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4315  phosphomethylpyrimidine kinase  46.62 
 
 		 297 aa  198  7e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.319953  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1321  phosphomethylpyrimidine kinase  42.75 
 
 		 266 aa  198  7.999999999999999e-50  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1301  phosphomethylpyrimidine kinase  42.21 
 
 		 267 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.185406  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2250  phosphomethylpyrimidine kinase  42.64 
 
 		 268 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.660572  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1082  phosphomethylpyrimidine kinase  45.42 
 
 		 271 aa  197  2.0000000000000003e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.457786 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2046  phosphomethylpyrimidine kinase  46.12 
 
 		 266 aa  197  2.0000000000000003e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1203  phosphomethylpyrimidine kinase  42.37 
 
 		 266 aa  196  3e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.564031  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1305  phosphomethylpyrimidine kinase  41.76 
 
 		 323 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.279698  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0853  phosphomethylpyrimidine kinase  41.79 
 
 		 288 aa  195  8.000000000000001e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.114242  normal  0.0282488 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0997  phosphomethylpyrimidine kinase  41.79 
 
 		 288 aa  195  8.000000000000001e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00609101  normal  0.106083 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0285  phosphomethylpyrimidine kinase  46.22 
 
 		 295 aa  194  9e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3496  phosphomethylpyrimidine kinase  44.81 
 
 		 268 aa  194  1e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.828772  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0649  phosphomethylpyrimidine kinase  39.54 
 
 		 267 aa  193  3e-48  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0890915  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0928  phosphomethylpyrimidine kinase  46.18 
 
 		 271 aa  191  9e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0346056  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1361  phosphomethylpyrimidine kinase  44.44 
 
 		 268 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.628466  normal  0.92591 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0639  phosphomethylpyrimidine kinase  41.52 
 
 		 290 aa  189  4e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.784703  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3577  phosphomethylpyrimidine kinase  41.6 
 
 		 266 aa  189  5.999999999999999e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.385467 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0372  phosphomethylpyrimidine kinase  40.52 
 
 		 285 aa  188  7e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.591258  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6681  phosphomethylpyrimidine kinase  42.64 
 
 		 269 aa  188  8e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.432529 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2435  phosphomethylpyrimidine kinase  46.79 
 
 		 285 aa  187  1e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.884635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2470  phosphomethylpyrimidine kinase  45.35 
 
 		 280 aa  187  1e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.176006  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1561  phosphomethylpyrimidine kinase  41.18 
 
 		 335 aa  188  1e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0366  phosphomethylpyrimidine kinase  42.53 
 
 		 266 aa  187  2e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.437548 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03000  hydroxymethylpyrimidine kinase/phosphomethylpyrimidine kinase  41.67 
 
 		 265 aa  187  2e-46  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1191  phosphomethylpyrimidine kinase  41.29 
 
 		 267 aa  187  2e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.16328  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0042  phosphomethylpyrimidine kinase  44.91 
 
 		 284 aa  187  2e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0834315  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0060  phosphomethylpyrimidine kinase  41.18 
 
 		 335 aa  186  3e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.422645  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3133  phosphomethylpyrimidine kinase  39.13 
 
 		 277 aa  186  3e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1473  phosphomethylpyrimidine kinase  41.18 
 
 		 336 aa  186  5e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.021769  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1658  phosphomethylpyrimidine kinase  44.44 
 
 		 268 aa  185  7e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0210202 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0209  phosphomethylpyrimidine kinase  45.08 
 
 		 304 aa  184  1.0000000000000001e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.606568  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1670  phosphomethylpyrimidine kinase  46.21 
 
 		 260 aa  184  1.0000000000000001e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.42362 
 
 
-
 
NC_004310  BR0218  phosphomethylpyrimidine kinase  45.08 
 
 		 291 aa  183  2.0000000000000003e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.940459  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3167  phosphomethylpyrimidine kinase  45.66 
 
 		 263 aa  183  3e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.17923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2479  phosphomethylpyrimidine kinase  44.07 
 
 		 268 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0351011  hitchhiker  0.000627669 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1628  phosphomethylpyrimidine kinase  41.98 
 
 		 266 aa  182  7e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.522982  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1310  phosphomethylpyrimidine kinase  44.32 
 
 		 268 aa  182  7e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6036  phosphomethylpyrimidine kinase type-2  43.64 
 
 		 269 aa  181  9.000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.190496  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2041  phosphomethylpyrimidine kinase  43.64 
 
 		 269 aa  181  9.000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2060  phosphomethylpyrimidine kinase  43.64 
 
 		 269 aa  181  9.000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.373143 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2073  phosphomethylpyrimidine kinase  44 
 
 		 269 aa  181  1e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1942  phosphomethylpyrimidine kinase  44 
 
 		 269 aa  181  1e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.719295  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1935  phosphomethylpyrimidine kinase  44.74 
 
 		 283 aa  181  2e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5350  phosphomethylpyrimidine kinase  44 
 
 		 269 aa  180  2e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.120967 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1583  phosphomethylpyrimidine kinase  39.15 
 
 		 264 aa  180  2e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.152097  normal  0.0340338 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3649  phosphomethylpyrimidine kinase type-2  44.49 
 
 		 267 aa  180  2.9999999999999997e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1124  phosphomethylpyrimidine kinase  41.98 
 
 		 270 aa  179  4.999999999999999e-44  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1787  phosphomethylpyrimidine kinase  44.74 
 
 		 308 aa  179  5.999999999999999e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0361  phosphomethylpyrimidine kinase  39.85 
 
 		 262 aa  178  8e-44  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000143367  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1225  phosphomethylpyrimidine kinase  41.22 
 
 		 270 aa  177  1e-43  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1236  phosphomethylpyrimidine kinase  43.27 
 
 		 269 aa  177  1e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.174718  normal  0.252768 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0641  phosphomethylpyrimidine kinase  41.6 
 
 		 270 aa  177  1e-43  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.328033  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1153  phosphomethylpyrimidine kinase  40.53 
 
 		 272 aa  177  1e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0935315  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1577  phosphomethylpyrimidine kinase  45.39 
 
 		 269 aa  177  2e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.299671  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3232  phosphomethylpyrimidine kinase  45.39 
 
 		 269 aa  177  2e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5777  phosphomethylpyrimidine kinase  41.18 
 
 		 277 aa  177  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.269735  normal  0.0629461 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1813  phosphomethylpyrimidine kinase  38.55 
 
 		 275 aa  177  2e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.319911  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2080  phosphomethylpyrimidine kinase  45.39 
 
 		 269 aa  177  2e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.446951  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>