123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_0605 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008639  Cpha266_0605  biopolymer transport protein ExbD/TolR  100 
 
 
174 aa  356  9.999999999999999e-98  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.946686  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1961  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  75.43 
 
 
174 aa  279  2e-74  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00643734  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0731  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  74.29 
 
 
174 aa  270  5.000000000000001e-72  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1586  hypothetical protein  70.69 
 
 
174 aa  266  2e-70  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.345573  normal  0.0169562 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0572  hypothetical protein  65.87 
 
 
188 aa  232  2.0000000000000002e-60  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.316463 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0590  hypothetical protein  65.87 
 
 
188 aa  232  3e-60  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.583994  normal  0.972517 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0635  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  68.07 
 
 
182 aa  226  1e-58  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0551  hypothetical protein  36.54 
 
 
179 aa  110  9e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1428  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.02 
 
 
197 aa  90.1  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.770563  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5089  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.94 
 
 
178 aa  88.6  5e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00127684  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0589  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  47.5 
 
 
177 aa  83.6  0.000000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.768385  normal  0.646896 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0730  hypothetical protein  47.3 
 
 
177 aa  80.1  0.00000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1003  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.76 
 
 
176 aa  79.7  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1962  hypothetical protein  47.3 
 
 
177 aa  79.7  0.00000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0548542  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0634  hypothetical protein  47.3 
 
 
177 aa  79.3  0.00000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0571  hypothetical protein  46.25 
 
 
177 aa  78.6  0.00000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.487342 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0604  hypothetical protein  47.14 
 
 
177 aa  77.8  0.00000000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4057  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.68 
 
 
193 aa  77  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000796256  hitchhiker  0.000000255237 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1587  hypothetical protein  48.65 
 
 
177 aa  76.6  0.0000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0166263 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2016  hypothetical protein  31.94 
 
 
175 aa  72.4  0.000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3099  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.06 
 
 
169 aa  69.7  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.422914  normal  0.197974 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0491  hypothetical protein  30.43 
 
 
184 aa  69.3  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.46585  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3753  biopolymer transport exbD protein  29.66 
 
 
133 aa  67.4  0.0000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.677985  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4088  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.14 
 
 
179 aa  65.9  0.0000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0550  hypothetical protein  42.25 
 
 
177 aa  64.3  0.0000000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4056  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.86 
 
 
204 aa  63.9  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.022799  hitchhiker  0.00000194913 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2987  biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.07 
 
 
133 aa  60.8  0.000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.369399  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5088  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.88 
 
 
208 aa  60.5  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00337979  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02811  Biopolymer transport protein  25.37 
 
 
132 aa  57.4  0.0000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0477065  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1435  biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.89 
 
 
137 aa  56.6  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.559612  normal  0.665441 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1522  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  42.62 
 
 
122 aa  55.5  0.0000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1247  biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.27 
 
 
140 aa  55.5  0.0000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2764  hypothetical protein  26.06 
 
 
175 aa  55.1  0.0000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.720369  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1257  biopolymer transport protein ExbD/TolR  23.02 
 
 
134 aa  53.9  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.529196  hitchhiker  0.000136221 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2155  biopolymer transport protein ExbD/TolR  24.26 
 
 
134 aa  52.4  0.000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4089  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.39 
 
 
205 aa  52.8  0.000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2763  hypothetical protein  25.28 
 
 
174 aa  52  0.000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.861823  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1574  biopolymer transport protein ExbD/TolR  23.97 
 
 
134 aa  51.6  0.000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0927503  normal  0.0158805 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1173  biopolymer transport protein ExbD/TolR  23.36 
 
 
140 aa  50.8  0.000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.364458  normal  0.851984 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03432  Biopolymer transport protein  27.05 
 
 
135 aa  50.8  0.000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3973  biopolymer transport exbD protein  37.1 
 
 
136 aa  50.1  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1427  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.11 
 
 
218 aa  50.8  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4648  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  23.46 
 
 
193 aa  50.8  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.030471  normal  0.671776 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0592  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.67 
 
 
141 aa  50.4  0.00001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.127488 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2649  biopolymer transport protein ExbD/TolR  23.4 
 
 
134 aa  50.1  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00438318  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0273  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.14 
 
 
136 aa  49.7  0.00002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1028  biopolymer transport protein ExbD/TolR  23.08 
 
 
138 aa  49.7  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.0000374903  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2422  biopolymer transport protein ExbD/TolR  23.13 
 
 
134 aa  50.1  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00108653  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1063  biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.07 
 
 
135 aa  49.3  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00634  biopolymer transport protein  24.06 
 
 
135 aa  49.7  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0546  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  25.53 
 
 
152 aa  49.7  0.00002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00922706  normal  0.113975 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0388  biopolymer transport protein  25.81 
 
 
145 aa  48.9  0.00004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0352  biopolymer transport protein ExbD/TolR  25.81 
 
 
145 aa  48.9  0.00004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1397  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  21.13 
 
 
140 aa  48.9  0.00004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1742  biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.87 
 
 
141 aa  48.1  0.00007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0506  biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.3 
 
 
148 aa  47.8  0.00007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.492419 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2017  hypothetical protein  33.33 
 
 
201 aa  47.8  0.00008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.991999  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3522  biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.43 
 
 
133 aa  47.8  0.00008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1656  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.41 
 
 
142 aa  47.8  0.00008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.310193  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1506  biopolymer transport protein  36 
 
 
136 aa  47.8  0.00009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000178844  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0846  ExbD2-like biopolymer transport protein  33.9 
 
 
143 aa  47  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.424366  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1847  biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.33 
 
 
130 aa  47  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.730316  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1643  biopolymer transport protein ExbD/TolR  22.45 
 
 
134 aa  47  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.158333  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1628  biopolymer transport protein ExbD/TolR  22.45 
 
 
134 aa  47  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.426629  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2891  biopolymer transport protein ExbD/TolR  25.62 
 
 
135 aa  47.4  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00140985 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1665  biopolymer transport protein ExbD/TolR  22.45 
 
 
134 aa  47  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.283534  normal  0.123341 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00589  biopolymer transport protein  20.42 
 
 
154 aa  47.4  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.265658  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1563  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.1 
 
 
135 aa  47.4  0.0001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1370  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  22.76 
 
 
140 aa  47  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3209  biopolymer transport protein ExbD/TolR  24.62 
 
 
137 aa  46.6  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000537129  normal  0.265512 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2155  biopolymer transport protein (ExbD2)  33.33 
 
 
136 aa  46.2  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1618  biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.38 
 
 
136 aa  46.6  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.272583  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2461  biopolymer transport protein ExbD/TolR  21.77 
 
 
134 aa  46.6  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.086318  hitchhiker  0.000000463213 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2531  biopolymer transport protein ExbD/TolR  21.77 
 
 
134 aa  46.6  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.103764  unclonable  0.0000246582 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2623  biopolymer transport protein ExbD/TolR  21.77 
 
 
134 aa  46.6  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00138445  hitchhiker  0.00000106541 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1520  biopolymer transport protein ExbD/TolR  21.83 
 
 
134 aa  46.2  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0492  hypothetical protein  41.82 
 
 
208 aa  46.2  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.717698  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2715  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  22.45 
 
 
134 aa  46.6  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0091845  hitchhiker  0.0000000699577 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1698  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  43.64 
 
 
250 aa  45.8  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2817  biopolymer transport protein (ExbD2)  22.97 
 
 
135 aa  45.8  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.276974  hitchhiker  0.00000182227 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2991  biopolymer transport protein ExbD/TolR  23.31 
 
 
134 aa  45.8  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.158684  normal  0.0282837 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2623  biopolymer transport protein ExbD/TolR  23.24 
 
 
134 aa  45.4  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00147196  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1730  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  44.19 
 
 
132 aa  45.4  0.0003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0609  biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.37 
 
 
136 aa  45.4  0.0004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000633887  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1719  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  22.82 
 
 
184 aa  45.4  0.0004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00014535  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1303  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.43 
 
 
211 aa  45.4  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3007  biopolymer transport protein ExbD/TolR  24.48 
 
 
143 aa  45.4  0.0004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2151  biopolymer transport protein ExbD/TolR  45.24 
 
 
140 aa  45.4  0.0004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0691787  normal  0.335965 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3076  biopolymer transport protein ExbD/TolR  22.54 
 
 
134 aa  45.4  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000935089  hitchhiker  0.0000153595 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1460  biopolymer transport protein ExbD/TolR  23.7 
 
 
135 aa  45.1  0.0005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2060  GTP cyclohydrolase I  50 
 
 
143 aa  45.1  0.0005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.552907 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4575  biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.74 
 
 
217 aa  44.7  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2278  biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.23 
 
 
141 aa  45.1  0.0006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0502314  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1827  TonB system transport protein ExbD2  21.09 
 
 
134 aa  44.7  0.0007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0439  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.43 
 
 
132 aa  43.5  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.29268  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2674  biopolymer transport protein ExbD/TolR  41.18 
 
 
140 aa  43.5  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2221  biopolymer transport protein ExbD/TolR  24.06 
 
 
134 aa  43.9  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.109447  normal  0.312711 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0355  branched-chain amino acid aminotransferase I  31.43 
 
 
134 aa  43.9  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00931363  normal  0.438435 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2403  biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.57 
 
 
135 aa  43.9  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2475  biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.42 
 
 
134 aa  43.9  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.71842  hitchhiker  0.0000457301 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>