More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_1939 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_1939  alanine dehydrogenase/PNT domain protein  100 
 
 		 390 aa  795    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10273  alanine dehydrogenase  51.66 
 
 		 399 aa  445  1.0000000000000001e-124  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2909  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  53.35 
 
 		 399 aa  433  1e-120  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.499459  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1259  Alanine dehydrogenase  44.94 
 
 		 405 aa  350  4e-95  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2994  alanine dehydrogenase/PNT domain protein  43.7 
 
 		 403 aa  338  7e-92  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0579773  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4962  Alanine dehydrogenase  44.22 
 
 		 408 aa  338  9.999999999999999e-92  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.699914 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4284  alanine dehydrogenase/PNT domain protein  43.8 
 
 		 408 aa  335  1e-90  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.626941  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2439  pyridine nucleotide transhydrogenase, alpha subunit  44.3 
 
 		 382 aa  327  3e-88  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0465  alanine dehydrogenase  41.9 
 
 		 406 aa  303  3.0000000000000004e-81  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0875  L-alanine dehydrogenase  35.58 
 
 		 406 aa  226  7e-58  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0761  alanine dehydrogenase/PNT domain protein  33.77 
 
 		 406 aa  223  3e-57  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.716267 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0627  alanine dehydrogenase  35.84 
 
 		 411 aa  223  7e-57  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0767  alanine dehydrogenase/PNT domain protein  34.03 
 
 		 403 aa  216  5.9999999999999996e-55  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1878  alanine dehydrogenase  36.27 
 
 		 377 aa  215  9.999999999999999e-55  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1700  alanine dehydrogenase/PNT domain protein  33.07 
 
 		 406 aa  207  2e-52  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000678625 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2150  Alanine dehydrogenase  34.2 
 
 		 406 aa  207  3e-52  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0104  alanine dehydrogenase  33.88 
 
 		 374 aa  200  3.9999999999999996e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1765  alanine dehydrogenase  33.06 
 
 		 372 aa  198  1.0000000000000001e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0984  alanine dehydrogenase  34.23 
 
 		 370 aa  199  1.0000000000000001e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0509355  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1800  alanine dehydrogenase  33.06 
 
 		 372 aa  198  1.0000000000000001e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0906  L-alanine dehydrogenase  34.62 
 
 		 367 aa  190  5e-47  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3174  L-alanine dehydrogenase  32.41 
 
 		 361 aa  189  9e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.18262  normal  0.22537 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1770  alanine dehydrogenase  33.97 
 
 		 370 aa  189  9e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000379801  normal  0.0234483 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1049  alanine dehydrogenase  30.98 
 
 		 374 aa  188  1e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0663  alanine dehydrogenase and pyridine nucleotide transhydrogenase  32.23 
 
 		 367 aa  187  2e-46  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0662308 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2698  alanine dehydrogenase  32.24 
 
 		 373 aa  187  2e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2109  L-alanine dehydrogenase  33.42 
 
 		 370 aa  186  6e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1058  L-alanine dehydrogenase  33.7 
 
 		 371 aa  185  1.0000000000000001e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0315596  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2068  alanine dehydrogenase  32.88 
 
 		 371 aa  185  1.0000000000000001e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000347962  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2048  L-alanine dehydrogenase  34.05 
 
 		 371 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000213241  hitchhiker  0.00195154 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1767  alanine dehydrogenase  33.42 
 
 		 370 aa  184  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1847  alanine dehydrogenase  33.15 
 
 		 370 aa  184  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1961  L-alanine dehydrogenase  33.78 
 
 		 371 aa  184  3e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000331426  normal  0.759568 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2015  L-alanine dehydrogenase  33.78 
 
 		 371 aa  184  3e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000641536  normal  0.0233457 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0509  alanine dehydrogenase  31.34 
 
 		 377 aa  184  3e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.153171  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2154  alanine dehydrogenase  33.24 
 
 		 371 aa  184  3e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000415402  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0505  alanine dehydrogenase (L-alanine dehydrogenase) (NAD-linked alanine dehydrogenase)  31.34 
 
 		 377 aa  183  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0484986  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2630  alanine dehydrogenase  32.97 
 
 		 370 aa  183  4.0000000000000006e-45  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0012805  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2189  alanine dehydrogenase  33.24 
 
 		 371 aa  183  5.0000000000000004e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000553576  normal  0.0277936 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3512  alanine dehydrogenase  32.24 
 
 		 377 aa  183  5.0000000000000004e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0416  alanine dehydrogenase  31.97 
 
 		 390 aa  182  6e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.533057  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0666  alanine dehydrogenase  32.97 
 
 		 372 aa  182  6e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1609  alanine dehydrogenase  33.52 
 
 		 363 aa  182  7e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1635  alanine dehydrogenase  33.52 
 
 		 363 aa  182  7e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.348616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1155  alanine dehydrogenase  32.09 
 
 		 373 aa  182  9.000000000000001e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0320425  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0506  alanine dehydrogenase  31.34 
 
 		 377 aa  182  9.000000000000001e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0659  alanine dehydrogenase  31.06 
 
 		 377 aa  182  1e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0561  alanine dehydrogenase  31.06 
 
 		 377 aa  182  1e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0503  alanine dehydrogenase (L-alanine dehydrogenase) (NAD-linked alanine dehydrogenase)  31.06 
 
 		 377 aa  182  1e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0649  alanine dehydrogenase  31.06 
 
 		 377 aa  182  1e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000197457 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0720  alanine dehydrogenase  31.06 
 
 		 377 aa  182  1e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2325  alanine dehydrogenase  32.97 
 
 		 371 aa  181  1e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000753672  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0592  alanine dehydrogenase  31.06 
 
 		 377 aa  182  1e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4707  alanine dehydrogenase  31.06 
 
 		 377 aa  181  2e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.394656 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2747  alanine dehydrogenase  35.08 
 
 		 367 aa  181  2e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.339433  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2355  alanine dehydrogenase  30.87 
 
 		 371 aa  180  4e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00470205 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1272  alanine dehydrogenase  31.23 
 
 		 371 aa  179  4.999999999999999e-44  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2217  alanine dehydrogenase  32.7 
 
 		 371 aa  179  7e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000174643  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3605  alanine dehydrogenase  31.4 
 
 		 371 aa  179  8e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2013  alanine dehydrogenase  32.16 
 
 		 371 aa  179  1e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000175382  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2087  L-alanine dehydrogenase  30.96 
 
 		 371 aa  178  1e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.193129 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0630  alanine dehydrogenase  30.79 
 
 		 377 aa  179  1e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.936299  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4758  alanine dehydrogenase  30.05 
 
 		 377 aa  177  2e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4521  alanine dehydrogenase  30.05 
 
 		 377 aa  177  2e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.693738  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4357  alanine dehydrogenase  30.05 
 
 		 377 aa  177  2e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4368  alanine dehydrogenase  30.05 
 
 		 377 aa  177  2e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.103175  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4752  alanine dehydrogenase  30.05 
 
 		 377 aa  177  2e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000212885  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4873  alanine dehydrogenase  30.05 
 
 		 377 aa  177  2e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0504  alanine dehydrogenase  30.05 
 
 		 377 aa  177  2e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2104  L-alanine dehydrogenase  30.96 
 
 		 371 aa  177  2e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.364817  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2150  L-alanine dehydrogenase  30.96 
 
 		 371 aa  177  2e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.093949 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4731  alanine dehydrogenase  30.05 
 
 		 377 aa  177  3e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1760  L-alanine dehydrogenase  32.69 
 
 		 363 aa  177  4e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3299  alanine dehydrogenase  30.05 
 
 		 377 aa  177  4e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0203  alanine dehydrogenase  30.38 
 
 		 370 aa  176  5e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.193787  normal  0.15922 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1995  L-alanine dehydrogenase  31.86 
 
 		 371 aa  176  5e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.226361 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0765  alanine dehydrogenase  30.11 
 
 		 372 aa  176  5e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1445  L-alanine dehydrogenase  32.34 
 
 		 377 aa  176  6e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0104165  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1368  alanine dehydrogenase  33.15 
 
 		 372 aa  176  6e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4741  alanine dehydrogenase  30.05 
 
 		 377 aa  176  7e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5593  alanine dehydrogenase  32.71 
 
 		 377 aa  176  8e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.74173  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4453  alanine dehydrogenase  29.78 
 
 		 377 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0857625  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1176  alanine dehydrogenase  32.61 
 
 		 371 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1485  alanine dehydrogenase  31.25 
 
 		 370 aa  174  2.9999999999999996e-42  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.775902  hitchhiker  0.0000000116767 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2908  L-alanine dehydrogenase  31.34 
 
 		 374 aa  174  3.9999999999999995e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2235  alanine dehydrogenase  33.33 
 
 		 371 aa  173  5e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000122217  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0055  L-alanine dehydrogenase  31.51 
 
 		 373 aa  173  5e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.161285  normal  0.147991 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05750  alanine dehydrogenase  31.61 
 
 		 373 aa  172  6.999999999999999e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.747804  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4283  alanine dehydrogenase  33.24 
 
 		 362 aa  172  1e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2902  alanine dehydrogenase  30.66 
 
 		 376 aa  172  1e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.877105  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3804  alanine dehydrogenase  29.95 
 
 		 366 aa  172  1e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2170  alanine dehydrogenase  31.59 
 
 		 369 aa  171  2e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.443019  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4356  alanine dehydrogenase  31.02 
 
 		 379 aa  171  3e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.80752  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2462  alanine dehydrogenase  32.97 
 
 		 376 aa  170  3e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000220592  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3380  alanine dehydrogenase  31.61 
 
 		 377 aa  171  3e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.748696  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1557  alanine dehydrogenase  31.69 
 
 		 372 aa  170  4e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1654  alanine dehydrogenase  32.86 
 
 		 367 aa  170  4e-41  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0022  alanine dehydrogenase  28.93 
 
 		 372 aa  170  4e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1131  alanine dehydrogenase  30.98 
 
 		 370 aa  170  4e-41  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3009  alanine dehydrogenase  33.24 
 
 		 368 aa  169  5e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.40821  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>