287 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_1108 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013162  Coch_1108  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
337 aa  695    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0755  glycosyl transferase, group 1  27.33 
 
 
344 aa  114  3e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0491  glycosyl transferase, group 1  27.84 
 
 
381 aa  68.9  0.0000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3447  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.98 
 
 
369 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0388  glycosyltransferase  26.34 
 
 
373 aa  68.2  0.0000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.230246  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0853  glycosyl transferase group 1  25.61 
 
 
393 aa  66.2  0.0000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0347  glycosyl transferase group 1  26.46 
 
 
369 aa  66.2  0.0000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0476  glycosyl transferase group 1  26.82 
 
 
361 aa  65.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2365  glycosyl transferase group 1  27.73 
 
 
364 aa  65.1  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.230735  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1702  mannosyltransferase  29.75 
 
 
846 aa  64.3  0.000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.529704  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2313  glycosyl transferase group 1  27.73 
 
 
364 aa  63.5  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1631  glycosyl transferase group 1  29.58 
 
 
846 aa  63.2  0.000000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.343672  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5204  group 1 glycosyl transferase  27.46 
 
 
364 aa  60.8  0.00000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0758  glycosyl transferase, group 1  26.67 
 
 
1241 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1073  glycosyl transferase, group 1  29.01 
 
 
1261 aa  60.1  0.00000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.328377  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2579  glycosyl transferase group 1  27.85 
 
 
609 aa  59.7  0.00000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4314  glycosyl transferase group 1  29.2 
 
 
370 aa  59.7  0.00000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.712653  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21071  hypothetical protein  27.97 
 
 
1232 aa  59.7  0.00000008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3566  glycosyl transferase group 1  23.75 
 
 
390 aa  59.3  0.00000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0715685  normal  0.505955 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4402  glycosyl transferase group 1  21.12 
 
 
359 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0769  glycosyl transferase group 1  26.51 
 
 
1241 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.507904  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3799  glycosyl transferase, group 1  29.03 
 
 
386 aa  58.5  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2967  glycosyl transferase, group 1  27.85 
 
 
1915 aa  58.5  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3229  glycosyl transferase, group 1  25.52 
 
 
371 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.453901  normal  0.382919 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3332  glycosyl transferase, group 1  29.32 
 
 
370 aa  57.8  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.231973 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3360  glycosyl transferase, group 1  29.2 
 
 
355 aa  58.2  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.730903 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2862  glycosyl transferase group 1  30.37 
 
 
343 aa  58.2  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1956  glycosyl transferase group 1  30.22 
 
 
382 aa  58.5  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1035  glycosyl transferase, group 1  26.05 
 
 
366 aa  57.4  0.0000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.788925  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2028  glycosyltransferase  28.48 
 
 
353 aa  57  0.0000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.949426  normal  0.904409 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0228  glycosyl transferase, group 1  27.66 
 
 
1089 aa  57  0.0000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2303  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.78 
 
 
507 aa  57  0.0000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.500428  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1229  putative glycosyltransferase  35.9 
 
 
1219 aa  57  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.197488  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3298  WcbE  26.78 
 
 
507 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00149764  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3285  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.78 
 
 
507 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.754197  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1110  glycosyl transferase, group 1  26.42 
 
 
419 aa  57  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1074  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.78 
 
 
507 aa  57  0.0000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.109997  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2181  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.78 
 
 
507 aa  57  0.0000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3250  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.78 
 
 
507 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0525  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.78 
 
 
507 aa  57  0.0000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.317265  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0920  glycosyl transferase, group 1  28.26 
 
 
831 aa  56.2  0.0000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6239  glycosyltransferase WbpX  29.69 
 
 
460 aa  55.8  0.0000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0761  glycosyl transferase, group 1  22.83 
 
 
349 aa  56.2  0.0000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.082681  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2265  second mannosyl transferase  34.52 
 
 
336 aa  55.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000285845 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0296  glycosyl transferase, group 1  31.43 
 
 
346 aa  55.5  0.000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4100  glycosyl transferase group 1  22.67 
 
 
358 aa  55.8  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.17338  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0645  glycosyl transferase group 1  31.3 
 
 
389 aa  55.8  0.000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.924062 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3625  glycosyl transferase, group 1  21.03 
 
 
358 aa  55.8  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0744  glycosyl transferase, group 1  23.66 
 
 
384 aa  55.1  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.348162  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3369  glycosyl transferase, group 1  26.04 
 
 
417 aa  55.1  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00689338 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71930  glycosyltransferase WbpX  29.01 
 
 
460 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0738  glycosyl transferase group 1  21.4 
 
 
361 aa  54.3  0.000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0456  glycosyl transferase group 1  27.66 
 
 
366 aa  54.3  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1385  glycosyl transferase group 1  24.6 
 
 
398 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.106503  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0016  glycosyl transferase group 1  23.84 
 
 
361 aa  54.3  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4438  glycosyl transferase group 1  22.55 
 
 
381 aa  53.5  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2683  glycosyl transferase group 1  24.12 
 
 
390 aa  53.5  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0529  mannosyltransferase, putative  28.26 
 
 
372 aa  53.5  0.000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.142302  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0139  glycosyl transferase group 1  22.27 
 
 
384 aa  53.5  0.000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00161479 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1729  glycosyl transferase, group 1  30.15 
 
 
838 aa  53.5  0.000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0358  glycosyl transferase, group 1  29.12 
 
 
382 aa  53.5  0.000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.348726  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0533  putative mannosyltransferase  28.26 
 
 
372 aa  53.5  0.000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0758  glycosyl transferase group 1  24.53 
 
 
1028 aa  53.5  0.000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1652  glycosyl transferase group 1  22.66 
 
 
382 aa  53.1  0.000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0368  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.21 
 
 
380 aa  53.1  0.000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.31592  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1265  glycosyl transferase, group 1  23.6 
 
 
376 aa  52.8  0.000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1492  glycosyl transferase, group 1  26.67 
 
 
395 aa  53.1  0.000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2369  glycosyl transferase, group 1  32.18 
 
 
770 aa  52.8  0.000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.87241  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1171  glycosyl transferase group 1  26.76 
 
 
366 aa  52.8  0.000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.059053 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0357  glycosyl transferase, group 1  27.52 
 
 
389 aa  52.8  0.000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.137349  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2167  mannosyltransferase B  28.87 
 
 
381 aa  52.8  0.000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5201  group 1 glycosyl transferase  26.67 
 
 
430 aa  52.8  0.000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.131899  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0051  glycosyl transferase group 1  23.83 
 
 
366 aa  52.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0239  mannosyltransferase  27.91 
 
 
351 aa  52  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.205695  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1007  glycosyl transferase, group 1  31.87 
 
 
416 aa  52.4  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.643015  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0851  a-glycosyltransferase  26.95 
 
 
389 aa  52  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0398981  normal  0.216121 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0017  glycosyl transferase group 1  30.94 
 
 
356 aa  52.4  0.00001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.689138  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0049  glycosyl transferase group 1  23.83 
 
 
366 aa  52.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1456  glycosyl transferase group 1  25.98 
 
 
384 aa  52.4  0.00001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.550034  hitchhiker  0.000088456 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1544  mannosyltransferase, putative  27.37 
 
 
370 aa  51.6  0.00002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0741  glycosyl transferase group 1  29.25 
 
 
435 aa  51.2  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1615  capsular polysaccharide biosynthesis glycosyltransferase WcbB, putative  25.6 
 
 
447 aa  52  0.00002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.921217  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4513  glycosyl transferase family protein  27.74 
 
 
380 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3860  glycosyl transferase, group 1  23.45 
 
 
442 aa  52  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.185874 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3312  glycosyl transferase group 1  21.55 
 
 
359 aa  51.6  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4872  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.21 
 
 
380 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0752  glycosyl transferase, group 1  21.86 
 
 
423 aa  51.6  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0120  glycosyl transferase, group 1  37.29 
 
 
325 aa  51.2  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1273  glycosyl transferase, group 1  21.99 
 
 
380 aa  51.6  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00681714 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0744  glycosyl transferase group 1  26.22 
 
 
363 aa  52  0.00002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.299994  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4162  glycosyl transferase, group 1  21.55 
 
 
359 aa  51.6  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2193  glycosyltransferase  23.08 
 
 
375 aa  52  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00106475  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4204  glycosyl transferase, group 1  21.55 
 
 
359 aa  51.6  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.369966 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1676  glycosyl transferase, group 1  33.72 
 
 
322 aa  51.6  0.00002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1590  glycosyl transferase group 1  25.55 
 
 
385 aa  50.8  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.591641  normal  0.0531102 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3057  glycosyl transferase, group 1  24.66 
 
 
409 aa  50.8  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4271  glycosyl transferase group 1  20.64 
 
 
400 aa  51.2  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.614702 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2892  glycosyl transferase group 1  31.3 
 
 
354 aa  50.8  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1539  glycosyl transferase, group 1  27.71 
 
 
360 aa  51.2  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.29057 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0448  glycosyl transferase, group 1  23.27 
 
 
364 aa  50.8  0.00003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.717217 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>