More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_0923 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_0923  UDP-glucose 4-epimerase  100 
 
 		 341 aa  706    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000000616826  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1728  UDP-glucose 4-epimerase  74.85 
 
 		 338 aa  539  9.999999999999999e-153  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.87625  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03925  UDP-glucose 4-epimerase  69.28 
 
 		 340 aa  488  1e-137  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.317311  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3613  UDP-glucose 4-epimerase  59.47 
 
 		 340 aa  429  1e-119  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.965696  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0347  UDP-glucose 4-epimerase  59.94 
 
 		 342 aa  425  1e-118  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0730081 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2894  UDP-glucose 4-epimerase  60.6 
 
 		 339 aa  413  1e-114  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.107811 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0182  UDP-glucose 4-epimerase  54.73 
 
 		 342 aa  379  1e-104  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5839  UDP-glucose 4-epimerase  56.42 
 
 		 343 aa  376  1e-103  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1804  UDP-glucose 4-epimerase  49.85 
 
 		 337 aa  347  1e-94  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0593  UDP-glucose 4-epimerase  49.55 
 
 		 339 aa  337  1.9999999999999998e-91  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03331  UDP-glucose 4-epimerase  47.75 
 
 		 336 aa  337  1.9999999999999998e-91  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2501  UDP-glucose 4-epimerase  49.7 
 
 		 340 aa  336  3.9999999999999995e-91  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1914  UDP-galactose 4-epimerase  49.24 
 
 		 335 aa  335  5.999999999999999e-91  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.810767  normal  0.343621 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07350  UDP-galactose 4-epimerase  49.1 
 
 		 339 aa  335  5.999999999999999e-91  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.141517  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1753  UDP-glucose 4-epimerase  48.81 
 
 		 339 aa  334  1e-90  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0261532  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2676  UDP-galactose 4-epimerase  50.3 
 
 		 337 aa  334  1e-90  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0763555  hitchhiker  0.000468323 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4007  UDP-glucose 4-epimerase  48.19 
 
 		 337 aa  334  2e-90  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.006628  normal  0.348015 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0859  UDP-glucose 4-epimerase  49.4 
 
 		 340 aa  333  2e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002660  UDP-glucose 4-epimerase  47.29 
 
 		 339 aa  333  2e-90  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.342599  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2644  UDP-glucose 4-epimerase  48.65 
 
 		 336 aa  333  2e-90  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3334  UDP-glucose 4-epimerase  48.2 
 
 		 342 aa  333  2e-90  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.618075  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2783  UDP-galactose 4-epimerase  50 
 
 		 337 aa  333  2e-90  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0966218  hitchhiker  0.000208277 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2609  UDP-galactose 4-epimerase  50 
 
 		 337 aa  333  3e-90  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.237323  hitchhiker  0.000000619573 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1075  UDP-glucose 4-epimerase  47.9 
 
 		 342 aa  332  5e-90  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.320061  normal  0.011198 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1563  UDP-glucose 4-epimerase  48.95 
 
 		 337 aa  332  6e-90  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0346  UDP-glucose 4-epimerase  50.6 
 
 		 351 aa  332  8e-90  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2932  UDP-glucose 4-epimerase  51.2 
 
 		 337 aa  331  9e-90  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000357428  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3183  UDP-glucose 4-epimerase  46.39 
 
 		 339 aa  331  1e-89  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.670308 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0410  UDP-glucose 4-epimerase  49.1 
 
 		 340 aa  331  1e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000160  UDP-glucose 4-epimerase  46.99 
 
 		 338 aa  331  1e-89  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0154193  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1125  UDP-glucose 4-epimerase  49.85 
 
 		 337 aa  330  1e-89  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0889  UDP-glucose 4-epimerase  49.1 
 
 		 340 aa  331  1e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.334492  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0768  UDP-glucose 4-epimerase  48.49 
 
 		 340 aa  330  2e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0227  UDP-glucose 4-epimerase  47.4 
 
 		 351 aa  329  4e-89  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0501438  normal  0.38802 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0779  UDP-glucose 4-epimerase  48.19 
 
 		 340 aa  329  4e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1161  UDP-glucose 4-epimerase  46.85 
 
 		 338 aa  328  6e-89  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0299848  hitchhiker  0.000414813 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1664  UDP-glucose 4-epimerase  49.7 
 
 		 337 aa  328  9e-89  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1446  UDP-glucose 4-epimerase  49.85 
 
 		 339 aa  328  9e-89  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000042923  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3986  UDP-galactose 4-epimerase  48.19 
 
 		 340 aa  327  1.0000000000000001e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.205233 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3965  UDP-glucose 4-epimerase  47.73 
 
 		 339 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3477  UDP-glucose 4-epimerase  46.71 
 
 		 340 aa  327  2.0000000000000001e-88  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.350304 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1513  UDP-glucose 4-epimerase  49.4 
 
 		 337 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.282439  normal  0.362537 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2224  UDP-glucose 4-epimerase  48.94 
 
 		 336 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00168227  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2271  UDP-glucose 4-epimerase  49.55 
 
 		 340 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.967584  normal  0.133855 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3395  UDP-glucose 4-epimerase  49.25 
 
 		 338 aa  327  2.0000000000000001e-88  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.349492  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05793  UDP-glucose 4-epimerase  46.25 
 
 		 338 aa  327  2.0000000000000001e-88  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1774  UDP-galactose 4-epimerase  47.15 
 
 		 336 aa  326  3e-88  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2007  UDP-galactose 4-epimerase  48.38 
 
 		 334 aa  326  3e-88  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.5887  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0116  UDP-glucose 4-epimerase  47.29 
 
 		 366 aa  326  3e-88  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2870  UDP-glucose 4-epimerase  48.8 
 
 		 337 aa  326  3e-88  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00371745  hitchhiker  0.000000287874 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0714  UDP-glucose 4-epimerase  46.08 
 
 		 338 aa  326  4.0000000000000003e-88  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.168591  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3676  UDP-glucose 4-epimerase  48.5 
 
 		 339 aa  325  5e-88  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.193812 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44740  UDP-glucose 4-epimerase  48.02 
 
 		 352 aa  325  6e-88  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0816  UDP-glucose 4-epimerase  49.1 
 
 		 337 aa  324  1e-87  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1384  UDP-glucose 4-epimerase  49.1 
 
 		 337 aa  325  1e-87  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2810  UDP-galactose 4-epimerase  48.2 
 
 		 337 aa  324  1e-87  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0626054  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1044  UDP-galactose 4-epimerase  47.76 
 
 		 338 aa  324  2e-87  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4345  UDP-glucose 4-epimerase  47.45 
 
 		 341 aa  324  2e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.697217  normal  0.478622 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4235  UDP-glucose 4-epimerase  47.45 
 
 		 341 aa  324  2e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0862  UDP-galactose-4-epimerase  44.61 
 
 		 338 aa  323  2e-87  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0889309  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1482  UDP-glucose 4-epimerase  48.8 
 
 		 337 aa  324  2e-87  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000762592  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1477  UDP-glucose 4-epimerase  48.8 
 
 		 337 aa  323  2e-87  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000121809  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0916  UDP-glucose 4-epimerase  47.89 
 
 		 340 aa  323  3e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3705  UDP-galactose 4-epimerase  47.89 
 
 		 340 aa  323  3e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1601  UDP-glucose 4-epimerase  46.08 
 
 		 337 aa  322  4e-87  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000383307  normal  0.0692735 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1672  UDP-glucose 4-epimerase  46.43 
 
 		 341 aa  322  6e-87  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3247  UDP-glucose 4-epimerase  45.81 
 
 		 338 aa  322  7e-87  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0786  UDP-galactose-4-epimerase  44.31 
 
 		 338 aa  322  7e-87  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0680  UDP-galactose-4-epimerase  44.31 
 
 		 338 aa  322  7e-87  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0782  UDP-galactose-4-epimerase  44.31 
 
 		 338 aa  322  7e-87  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0812  UDP-galactose-4-epimerase  44.31 
 
 		 338 aa  321  9.000000000000001e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5588  UDP-glucose 4-epimerase  48.34 
 
 		 338 aa  321  9.999999999999999e-87  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5304  UDP-glucose 4-epimerase  46.83 
 
 		 338 aa  321  9.999999999999999e-87  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5595  UDP-galactose 4-epimerase  47.45 
 
 		 339 aa  321  9.999999999999999e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.455346  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5700  UDP-glucose 4-epimerase  46.83 
 
 		 338 aa  321  9.999999999999999e-87  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2883  UDP-glucose 4-epimerase  44.01 
 
 		 338 aa  320  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.330981  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3663  UDP-glucose 4-epimerase  47.02 
 
 		 336 aa  320  1.9999999999999998e-86  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000129816  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0926  UDP-galactose-4-epimerase  44.31 
 
 		 338 aa  320  1.9999999999999998e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0730766 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2591  UDP-galactose 4-epimerase  46.99 
 
 		 337 aa  320  1.9999999999999998e-86  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.496154  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5636  UDP-glucose 4-epimerase  48.34 
 
 		 338 aa  320  1.9999999999999998e-86  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0813  UDP-galactose-4-epimerase  44.01 
 
 		 338 aa  320  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2903  UDP-galactose-4-epimerase  44.01 
 
 		 338 aa  320  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.348521 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0903  UDP-galactose-4-epimerase  44.31 
 
 		 338 aa  320  1.9999999999999998e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0871  UDP-galactose-4-epimerase  44.31 
 
 		 338 aa  320  1.9999999999999998e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1713  UDP-glucose 4-epimerase  49.7 
 
 		 338 aa  319  3.9999999999999996e-86  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0170656  normal  0.546572 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5547  UDP-glucose 4-epimerase  47.48 
 
 		 336 aa  319  3.9999999999999996e-86  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1892  UDP-galactose 4-epimerase  47.89 
 
 		 377 aa  319  3.9999999999999996e-86  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.825064 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0840  UDP-galactose-4-epimerase  44.01 
 
 		 338 aa  319  3.9999999999999996e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3049  uridine diphosphate N-acetylgalactosamine 4-epimerase  47.13 
 
 		 335 aa  319  5e-86  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.200753  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1848  UDP-glucose 4-epimerase  45.97 
 
 		 337 aa  318  6e-86  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5131  UDP-glucose 4-epimerase  46.53 
 
 		 338 aa  318  7e-86  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0518622  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5545  UDP-glucose 4-epimerase  46.53 
 
 		 338 aa  318  7e-86  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0306452 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2886  UDP-galactose-4-epimerase  45.51 
 
 		 338 aa  318  7.999999999999999e-86  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.632321  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5388  UDP-glucose 4-epimerase  47.15 
 
 		 336 aa  318  9e-86  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1101  UDP-glucose 4-epimerase protein  47.15 
 
 		 341 aa  318  1e-85  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.139946  normal  0.0944899 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5146  UDP-glucose 4-epimerase  46.53 
 
 		 338 aa  317  1e-85  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.370805  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0486  UDP-glucose 4-epimerase  47.89 
 
 		 338 aa  317  1e-85  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00171475  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1173  UDP-galactose-4-epimerase  43.71 
 
 		 338 aa  317  2e-85  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1030  UDP-glucose 4-epimerase  47.75 
 
 		 335 aa  317  2e-85  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0734  UDP-galactose 4-epimerase  48.95 
 
 		 339 aa  317  2e-85  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>