More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_1089 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012039  Cla_1089  guanylate kinase  100 
 
 		 204 aa  416  9.999999999999999e-116  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.350405  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1311  guanylate kinase  61.95 
 
 		 205 aa  256  2e-67  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0545  guanylate kinase  62 
 
 		 203 aa  256  2e-67  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.071067  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1256  guanylate kinase  63 
 
 		 203 aa  256  2e-67  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1192  guanylate kinase  61.46 
 
 		 207 aa  254  6e-67  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0552  guanylate kinase  61.46 
 
 		 205 aa  253  2.0000000000000002e-66  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.713895  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1436  guanylate kinase  59.7 
 
 		 203 aa  250  1e-65  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1251  guanylate kinase  58.5 
 
 		 202 aa  240  1e-62  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0411  guanylate kinase  52 
 
 		 204 aa  191  6e-48  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1796  guanylate kinase  48.74 
 
 		 206 aa  191  8e-48  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2318  guanylate kinase  43.08 
 
 		 198 aa  172  1.9999999999999998e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000195285  hitchhiker  0.00462206 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0985  guanylate kinase  41.45 
 
 		 207 aa  166  2e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00175631  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0785  guanylate kinase  44.81 
 
 		 201 aa  166  2e-40  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000101008  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1145  guanylate kinase  40.93 
 
 		 207 aa  166  2.9999999999999998e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.49439  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3877  guanylate kinase  44.68 
 
 		 210 aa  165  4e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1406  Guanylate kinase  45.5 
 
 		 202 aa  164  8e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.77411  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0099  guanylate kinase  44.74 
 
 		 204 aa  164  9e-40  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.261524  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2692  guanylate kinase  42.55 
 
 		 225 aa  164  9e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2787  guanylate kinase  42.55 
 
 		 225 aa  164  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2606  guanylate kinase  42.55 
 
 		 226 aa  163  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.100354  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1597  guanylate kinase  39.68 
 
 		 197 aa  164  1.0000000000000001e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00198885  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1845  guanylate kinase  41.49 
 
 		 230 aa  164  1.0000000000000001e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2946  guanylate kinase  46.96 
 
 		 181 aa  162  2.0000000000000002e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.641883  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2444  guanylate kinase  40.11 
 
 		 203 aa  161  6e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.337517 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2277  guanylate kinase  42.63 
 
 		 223 aa  161  7e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.140709  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2000  guanylate kinase  42.63 
 
 		 223 aa  161  7e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0607745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2093  guanylate kinase  43.48 
 
 		 223 aa  161  7e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.353708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3354  guanylate kinase  44.94 
 
 		 212 aa  160  1e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1700  guanylate kinase  40.41 
 
 		 200 aa  160  1e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0976  guanylate kinase  42.86 
 
 		 211 aa  160  1e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.194665  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1763  guanylate kinase  42.02 
 
 		 218 aa  160  1e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.201865  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2001  guanylate kinase  41.62 
 
 		 216 aa  160  1e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1719  guanylate kinase  41.62 
 
 		 216 aa  160  1e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0808  guanylate kinase  43.65 
 
 		 192 aa  159  2e-38  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.116088  normal  0.89906 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1220  guanylate kinase  41.8 
 
 		 218 aa  159  2e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.289802 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2523  guanylate kinase  38.83 
 
 		 214 aa  158  4e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0988  guanylate kinase  42.33 
 
 		 234 aa  159  4e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0107524 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1953  guanylate kinase  42.63 
 
 		 223 aa  158  5e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.217119  normal  0.0786696 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09810  Guanylate kinase  41.15 
 
 		 194 aa  158  5e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1910  guanylate kinase  42.11 
 
 		 210 aa  158  5e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000116154  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2573  guanylate kinase  42.46 
 
 		 223 aa  157  9e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0392077 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5842  guanylate kinase  43.02 
 
 		 259 aa  157  1e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.509377 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3623  guanylate kinase  44.33 
 
 		 207 aa  157  1e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4019  guanylate kinase  40.53 
 
 		 204 aa  156  2e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.565127  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1266  guanylate kinase  41.94 
 
 		 217 aa  156  2e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.979121  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3613  guanylate kinase  44.32 
 
 		 207 aa  156  2e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0330  guanylate kinase  43.92 
 
 		 224 aa  156  2e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0351596  normal  0.331396 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3894  guanylate kinase  38.92 
 
 		 200 aa  155  3e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000112061  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1529  guanylate kinase  38.38 
 
 		 217 aa  155  3e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.2579 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2714  guanylate kinase  40.43 
 
 		 213 aa  155  3e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3845  guanylate kinase  41.4 
 
 		 202 aa  155  4e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1761  guanylate kinase  41.8 
 
 		 207 aa  155  4e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2472  guanylate kinase  39.68 
 
 		 220 aa  155  5.0000000000000005e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3810  guanylate kinase  44.32 
 
 		 207 aa  155  5.0000000000000005e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.18291  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3497  guanylate kinase  44.32 
 
 		 207 aa  154  7e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0843  guanylate kinase  40.64 
 
 		 204 aa  154  7e-37  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4581  guanylate kinase  44.15 
 
 		 207 aa  154  8e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.877029  unclonable  0.0000000250462 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0840  guanylate kinase  38.81 
 
 		 202 aa  154  9e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3155  guanylate kinase  40.74 
 
 		 220 aa  154  9e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1457  guanylate kinase  45.45 
 
 		 212 aa  154  9e-37  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0336  guanylate kinase  45.41 
 
 		 207 aa  153  1e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.57704 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0266  guanylate kinase  42.7 
 
 		 207 aa  154  1e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5296  guanylate kinase  43.24 
 
 		 206 aa  152  2e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0446222  normal  0.471806 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5344  guanylate kinase  43.24 
 
 		 206 aa  153  2e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0394211 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0756  guanylate kinase  41.18 
 
 		 204 aa  153  2e-36  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2084  guanylate kinase  45 
 
 		 207 aa  153  2e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.338387  decreased coverage  0.00871463 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2138  guanylate kinase  43.16 
 
 		 205 aa  153  2e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.585915  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0045  guanylate kinase  44.44 
 
 		 207 aa  153  2e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2974  guanylate kinase  39.15 
 
 		 219 aa  153  2e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.291122 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4176  guanylate kinase  44.44 
 
 		 207 aa  153  2e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0297777  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5204  guanylate kinase  43.78 
 
 		 206 aa  153  2e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.952406  normal  0.288026 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0041  guanylate kinase  44.44 
 
 		 207 aa  153  2e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0361  guanylate kinase  43.78 
 
 		 207 aa  152  2.9999999999999998e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1683  guanylate kinase  39.46 
 
 		 219 aa  152  2.9999999999999998e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1677  guanylate kinase  42.16 
 
 		 217 aa  152  2.9999999999999998e-36  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4145  guanylate kinase  41.03 
 
 		 207 aa  152  2.9999999999999998e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2578  guanylate kinase  42.37 
 
 		 202 aa  152  2.9999999999999998e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0638633  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0251  guanylate kinase  42.47 
 
 		 207 aa  152  2.9999999999999998e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000337673  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001862  guanylate kinase  42.56 
 
 		 207 aa  152  2.9999999999999998e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3630  guanylate kinase  42.86 
 
 		 224 aa  152  4e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.09026  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0294  guanylate kinase  43.65 
 
 		 212 aa  151  5e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1104  guanylate kinase  40.86 
 
 		 211 aa  151  5.9999999999999996e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.631702  normal  0.011032 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0177  guanylate kinase  43.39 
 
 		 206 aa  151  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000695034 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1138  Guanylate kinase  43.01 
 
 		 209 aa  151  5.9999999999999996e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5020  guanylate kinase  42.11 
 
 		 207 aa  151  7e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3948  guanylate kinase  41.54 
 
 		 207 aa  151  7e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.498976  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3936  guanylate kinase  37.17 
 
 		 212 aa  151  7e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3479  guanylate kinase  38.1 
 
 		 220 aa  151  8e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1285  guanylate kinase  39.51 
 
 		 210 aa  151  8e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000194386  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2305  guanylate kinase  40 
 
 		 219 aa  151  8e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00214709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1447  guanylate kinase  38.3 
 
 		 193 aa  151  8e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.373553  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03505  guanylate kinase  42.11 
 
 		 207 aa  150  8.999999999999999e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0057  Guanylate kinase  42.11 
 
 		 207 aa  150  8.999999999999999e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03457  hypothetical protein  42.11 
 
 		 207 aa  150  8.999999999999999e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3859  guanylate kinase  42.11 
 
 		 207 aa  150  8.999999999999999e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0063  guanylate kinase  42.11 
 
 		 207 aa  150  8.999999999999999e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000240109 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4099  guanylate kinase  42.11 
 
 		 207 aa  150  8.999999999999999e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3983  guanylate kinase  42.11 
 
 		 207 aa  150  8.999999999999999e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1176  guanylate kinase  39.68 
 
 		 206 aa  150  8.999999999999999e-36  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000749098  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4151  guanylate kinase  42.11 
 
 		 207 aa  150  8.999999999999999e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>