More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0704 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012039  Cla_0704  putative camphor resistance protein CrcB  100 
 
 		 122 aa  234  3e-61  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0545  crcB protein  65.57 
 
 		 122 aa  157  4e-38  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0472858  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0624  hypothetical protein  63.93 
 
 		 122 aa  153  7e-37  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0950  CrcB protein  55 
 
 		 128 aa  110  8.000000000000001e-24  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.238115  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2480  camphor resistance protein CrcB  49.12 
 
 		 124 aa  100  5e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000701119  hitchhiker  0.00000263281 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2320  camphor resistance protein CrcB  45.69 
 
 		 124 aa  100  9e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000583526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2212  camphor resistance protein CrcB  45.69 
 
 		 124 aa  100  9e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000881037  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1966  camphor resistance protein CrcB  44.83 
 
 		 124 aa  100  1e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000505957  normal  0.854467 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2010  camphor resistance protein CrcB  44.83 
 
 		 124 aa  100  1e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000369188  hitchhiker  0.000296247 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2053  camphor resistance protein CrcB  44.83 
 
 		 124 aa  100  1e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0174627  hitchhiker  0.00029045 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2008  camphor resistance protein CrcB  45.61 
 
 		 124 aa  99.8  1e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00493999  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2194  camphor resistance protein CrcB  45.69 
 
 		 124 aa  99  2e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000253648  normal  0.211581 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2309  camphor resistance protein CrcB  44.83 
 
 		 124 aa  99  2e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2159  camphor resistance protein CrcB  45.69 
 
 		 124 aa  99  2e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0154034  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2021  camphor resistance protein CrcB  46.36 
 
 		 124 aa  98.6  3e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000176643  hitchhiker  0.000131067 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00367  camphor resistance protein CrcB  45.54 
 
 		 127 aa  96.3  1e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2130  camphor resistance protein CrcB  46.55 
 
 		 124 aa  96.7  1e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000104865  normal  0.0132896 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1798  camphor resistance protein CrcB  46.9 
 
 		 124 aa  96.3  1e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00100672  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2453  camphor resistance protein CrcB  42.86 
 
 		 126 aa  92.4  2e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002071  CrbC-like protein  44.64 
 
 		 127 aa  92.4  2e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1746  camphor resistance protein CrcB  42.98 
 
 		 124 aa  92  3e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00274275  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2599  camphor resistance protein CrcB  44.55 
 
 		 126 aa  91.7  3e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1775  camphor resistance protein CrcB  43.86 
 
 		 124 aa  90.5  7e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00911899  hitchhiker  0.00720449 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2981  camphor resistance protein CrcB  42.24 
 
 		 126 aa  89.7  1e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0486  camphor resistance CrcB protein  46.03 
 
 		 130 aa  87.8  4e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1665  camphor resistance protein CrcB  44.44 
 
 		 128 aa  86.7  9e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0623118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1007  CrcB protein  44.07 
 
 		 126 aa  86.3  1e-16  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.83695  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2457  CrcB protein  42.24 
 
 		 127 aa  86.3  1e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000828061  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0503  camphor resistance protein CrcB  38.52 
 
 		 140 aa  85.5  2e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0767  crcB protein  44.74 
 
 		 132 aa  85.1  3e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0701738  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1673  camphor resistance protein CrcB  41.38 
 
 		 123 aa  85.1  3e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.180087 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4547  camphor resistance protein CrcB  36.75 
 
 		 132 aa  83.6  9e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.73644  normal  0.557218 
 
 
-
 
NC_002936  DET1498  camphor resistance protein CrcB  46.08 
 
 		 130 aa  83.2  0.000000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0432518  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0493  camphor resistance protein CrcB  41.53 
 
 		 122 aa  83.2  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1288  camphor resistance protein CrcB  46.08 
 
 		 130 aa  83.2  0.000000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3016  camphor resistance protein CrcB  35.25 
 
 		 124 aa  82  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.120468  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1873  CrcB protein  39.84 
 
 		 130 aa  82.4  0.000000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0714  camphor resistance protein CrcB  37.5 
 
 		 124 aa  80.9  0.000000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.51179e-22 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0702  camphor resistance protein CrcB  37.5 
 
 		 124 aa  80.9  0.000000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0834947  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0395  CrcB protein  39.32 
 
 		 124 aa  80.5  0.000000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.259615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0524  camphor resistance protein CrcB  47.9 
 
 		 122 aa  80.1  0.00000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.184364  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1395  camphor resistance protein CrcB  48.74 
 
 		 122 aa  79.7  0.00000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.283613  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20960  CrcB protein  42.86 
 
 		 122 aa  79.7  0.00000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000428043  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1273  camphor resistance-like protein  44.12 
 
 		 130 aa  79  0.00000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00180552  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0574  camphor resistance protein CrcB  40.16 
 
 		 134 aa  77.8  0.00000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1038  CrcB family protein  39.09 
 
 		 124 aa  78.2  0.00000000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0550  camphor resistance protein CrcB  39.37 
 
 		 134 aa  77.4  0.00000000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1973  crcB protein domain-containing protein  41.3 
 
 		 228 aa  77.4  0.00000000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3454  hypothetical protein  38.46 
 
 		 136 aa  76.3  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.767422  normal  0.0839513 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0975  camphor resistance protein CrcB  36.28 
 
 		 131 aa  75.9  0.0000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00880668 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0313  camphor resistance protein CrcB  47.9 
 
 		 122 aa  75.9  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2292  CrcB protein  40.98 
 
 		 117 aa  75.9  0.0000000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1258  camphor resistance protein CrcB  35.83 
 
 		 124 aa  74.7  0.0000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.415853  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0954  camphor resistance protein CrcB  34.86 
 
 		 125 aa  74.7  0.0000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2230  camphor resistance protein CrcB  41.23 
 
 		 124 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00947563  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2720  CrcB protein  40.87 
 
 		 123 aa  74.3  0.0000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.177615 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1711  CrcB protein  38.71 
 
 		 126 aa  74.3  0.0000000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00823549  normal  0.187821 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0815  CrcB protein  33.91 
 
 		 116 aa  73.9  0.0000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1284  camphor resistance protein CrcB  44.25 
 
 		 128 aa  73.9  0.0000000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0693229  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0821  camphor resistance protein CrcB  43.64 
 
 		 119 aa  73.6  0.0000000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000515091  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2973  CrcB protein  44.33 
 
 		 127 aa  72.8  0.000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0130018  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0835  camphor resistance protein CrcB  33.94 
 
 		 129 aa  73.2  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.320485  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2756  camphor resistance protein CrcB  45.05 
 
 		 133 aa  72.4  0.000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1553  CrcB protein  38.05 
 
 		 123 aa  72  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4479  CrcB protein  32.5 
 
 		 143 aa  72.4  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.29462  normal  0.278154 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02112  camphor resistance protein CrcB  36.13 
 
 		 127 aa  70.9  0.000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00000584991  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3567  camphor resistance protein CrcB  33.61 
 
 		 126 aa  70.9  0.000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.366637  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0036  CrcB protein  38.39 
 
 		 134 aa  70.9  0.000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000868029  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2802  camphor resistance protein CrcB  37.19 
 
 		 127 aa  70.5  0.000000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.963327  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1916  Camphor resistance CrcB protein  33.61 
 
 		 122 aa  70.5  0.000000000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00228129 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0423  CrcB protein  33.91 
 
 		 123 aa  70.1  0.00000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1535  CrcB protein  35.14 
 
 		 124 aa  69.7  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.235581  normal  0.972453 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00594  camphor resistance protein CrcB  38.02 
 
 		 127 aa  68.9  0.00000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.243224  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3020  camphor resistance protein CrcB  38.02 
 
 		 127 aa  68.6  0.00000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00755665  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0713  camphor resistance protein CrcB  38.02 
 
 		 127 aa  68.9  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000937309  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0236  camphor resistance protein CrcB  34.75 
 
 		 129 aa  69.3  0.00000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.966722  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00583  hypothetical protein  38.02 
 
 		 127 aa  68.9  0.00000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.208023  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0676  camphor resistance protein CrcB  38.02 
 
 		 127 aa  68.9  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000462452  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06970  hypothetical protein  43.96 
 
 		 124 aa  69.3  0.00000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0649  camphor resistance protein CrcB  38.02 
 
 		 127 aa  68.9  0.00000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00715235  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0645  camphor resistance protein CrcB  38.02 
 
 		 127 aa  68.9  0.00000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0119753  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1434  CrcB protein  43.96 
 
 		 126 aa  68.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0539  camphor resistance protein CrcB  38.02 
 
 		 127 aa  68.6  0.00000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2473  CrcB protein  32.74 
 
 		 124 aa  69.3  0.00000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1029  CrcB protein  35.29 
 
 		 124 aa  68.9  0.00000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0154206  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1460  CrcB protein  43.96 
 
 		 126 aa  69.3  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3001  CrcB protein  38.02 
 
 		 127 aa  68.2  0.00000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0511618  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0590  camphor resistance protein CrcB  39.13 
 
 		 122 aa  68.2  0.00000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0812  camphor resistance protein CrcB  40.66 
 
 		 123 aa  68.6  0.00000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00673919  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0745  camphor resistance protein CrcB  36.89 
 
 		 127 aa  67.8  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.311218  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0671  camphor resistance protein CrcB  36.89 
 
 		 127 aa  67.8  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00156465  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0731  camphor resistance protein CrcB  36.89 
 
 		 127 aa  67.8  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0685  camphor resistance protein CrcB  36.89 
 
 		 127 aa  67.8  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0789  camphor resistance protein CrcB  36.89 
 
 		 127 aa  67.8  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.136709  normal  0.909292 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28190  camphor resistance protein CrcB  37.4 
 
 		 124 aa  67.8  0.00000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.152767  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0591  CrcB protein  33.93 
 
 		 118 aa  67.4  0.00000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000269  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1283  camphor resistance protein CrcB  38.14 
 
 		 120 aa  67.4  0.00000000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000139326  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1636  CrcB protein  37.4 
 
 		 124 aa  67.4  0.00000000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1023  camphor resistance protein CrcB  33.9 
 
 		 124 aa  67  0.00000000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0520  CrcB protein  34.78 
 
 		 118 aa  67  0.00000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>