60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_3078 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_3078  von Willebrand factor type A  100 
 
 
330 aa  629  1e-179  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0396917  hitchhiker  0.000000364289 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35730  von Willebrand factor type A-like protein  48.98 
 
 
369 aa  239  6.999999999999999e-62  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3960  von Willebrand factor type A  42.77 
 
 
343 aa  223  3e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.287249 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2453  von Willebrand factor type A  44.16 
 
 
349 aa  213  2.9999999999999995e-54  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0230971 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18990  von Willebrand factor type A-like protein  41.48 
 
 
340 aa  209  4e-53  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0912448  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1986  Von Willebrand factor type A-like protein  37.64 
 
 
352 aa  179  4e-44  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.421518  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2128  von Willebrand factor type A  42.76 
 
 
333 aa  179  7e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000178489 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2371  von Willebrand factor, type A  43.14 
 
 
340 aa  166  5e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0711  von Willebrand factor type A domain protein  29.81 
 
 
378 aa  154  2.9999999999999998e-36  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.556532 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6107  von Willebrand factor type A  24.56 
 
 
359 aa  61.6  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4532  hypothetical protein  31.28 
 
 
334 aa  59.3  0.00000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.143586 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2396  von Willebrand factor type A  26.79 
 
 
377 aa  56.2  0.0000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.939741  normal  0.854107 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0442  von Willebrand factor type A  29.2 
 
 
329 aa  53.5  0.000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.570722  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0051  von Willebrand factor type A  31.06 
 
 
325 aa  53.1  0.000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.901325  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18800  von Willebrand factor, type A (VWA) domain protein  29.6 
 
 
335 aa  52.4  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00117552  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1220  von Willebrand factor, type A  24.72 
 
 
337 aa  52  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.356622  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2888  von Willebrand factor, type A  28.49 
 
 
340 aa  51.6  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5138  von Willebrand factor type A  27.56 
 
 
329 aa  51.2  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.585465 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2932  von Willebrand factor, type A  28.29 
 
 
334 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.922939  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02705  von Willebrand factor, type A  24.68 
 
 
349 aa  49.3  0.00009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4901  hypothetical protein  27.56 
 
 
330 aa  49.3  0.00009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.908989  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0567  von Willebrand factor, type A  25.54 
 
 
335 aa  47.8  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3232  von Willebrand factor type A  27.83 
 
 
334 aa  48.1  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.34963  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1812  von Willebrand factor type A  31.73 
 
 
318 aa  48.1  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3846  von Willebrand factor type A  26.77 
 
 
339 aa  48.5  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.341342  normal  0.622551 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3386  von Willebrand factor, type A  25.54 
 
 
335 aa  47.4  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.384724 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1123  von Willebrand factor type A  26.09 
 
 
373 aa  47.4  0.0003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1744  BatB protein, putative  27.78 
 
 
341 aa  47.4  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2768  hypothetical protein  26 
 
 
344 aa  47  0.0004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3556  von Willebrand factor, type A  25.54 
 
 
335 aa  47.4  0.0004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.697589 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2067  hypothetical protein  27.91 
 
 
337 aa  46.6  0.0005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0052  von Willebrand factor type A  33.93 
 
 
589 aa  47  0.0005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.649054  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2914  hypothetical protein  26 
 
 
344 aa  46.6  0.0005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3211  von Willebrand factor, type A  29.18 
 
 
359 aa  46.6  0.0005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.161906 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1204  von Willebrand factor type A  25 
 
 
342 aa  46.6  0.0006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000306  protein BatA  24.66 
 
 
356 aa  45.8  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3093  von Willebrand factor type A domain-containing protein  28.83 
 
 
338 aa  44.7  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0524  hypothetical protein  24.77 
 
 
320 aa  44.7  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02345  von Willebrand factor type A domain protein  29.49 
 
 
335 aa  44.7  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0073  von Willebrand factor, type A  24.91 
 
 
349 aa  44.7  0.002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2603  von Willebrand factor type A  27.67 
 
 
336 aa  45.1  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2395  von Willebrand factor type A  34.67 
 
 
611 aa  44.3  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.850853  normal  0.642372 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0852  von Willebrand factor type A  27.72 
 
 
345 aa  43.9  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.591496  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1468  von Willebrand factor, type A  28.22 
 
 
338 aa  44.3  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00210714 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1456  von Willebrand factor, type A  26.36 
 
 
338 aa  44.3  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000144994 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3801  von Willebrand factor type A  27.23 
 
 
334 aa  43.9  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.142641  normal  0.822741 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4011  von Willebrand factor, type A  30.57 
 
 
328 aa  43.9  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.204351  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3085  batB protein, putative  27.27 
 
 
328 aa  43.1  0.006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1659  von Willebrand factor, type A  22.69 
 
 
343 aa  43.5  0.006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.863974  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24400  von Willebrand factor type A domain-containing protein  26.98 
 
 
340 aa  43.1  0.006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0690216  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2430  von Willebrand factor, type A  26.88 
 
 
339 aa  43.5  0.006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0141267 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1733  von Willebrand factor type A  22.42 
 
 
342 aa  43.1  0.006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.818001  normal  0.561199 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1561  von Willebrand factor type A  28.16 
 
 
358 aa  43.1  0.006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.604958 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0459  von Willebrand factor type A  30.65 
 
 
320 aa  43.1  0.007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1593  von Willebrand factor type A  27.83 
 
 
340 aa  43.1  0.007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000650656 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3278  von Willebrand factor domain-containing protein  30.05 
 
 
328 aa  42.7  0.008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.173273  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0430  hypothetical protein  27.12 
 
 
336 aa  42.7  0.009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1128  von Willebrand factor, type A  28.87 
 
 
282 aa  42.7  0.009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0959166  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18980  von Willebrand factor type A-like protein  29.73 
 
 
331 aa  42.4  0.01  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.136451  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1482  von Willebrand factor type A  24.07 
 
 
344 aa  42.4  0.01  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.428182  normal  0.250576 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>