38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_18990 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_18990  von Willebrand factor type A-like protein  100 
 
 
340 aa  690    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0912448  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3960  von Willebrand factor type A  43.14 
 
 
343 aa  233  5e-60  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.287249 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35730  von Willebrand factor type A-like protein  44.56 
 
 
369 aa  215  8e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2453  von Willebrand factor type A  39.31 
 
 
349 aa  209  7e-53  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0230971 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3078  von Willebrand factor type A  41.48 
 
 
330 aa  198  1.0000000000000001e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0396917  hitchhiker  0.000000364289 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2371  von Willebrand factor, type A  34.35 
 
 
340 aa  179  4.999999999999999e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1986  Von Willebrand factor type A-like protein  35.1 
 
 
352 aa  172  6.999999999999999e-42  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.421518  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2128  von Willebrand factor type A  32.86 
 
 
333 aa  164  3e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000178489 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0711  von Willebrand factor type A domain protein  32.24 
 
 
378 aa  145  1e-33  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.556532 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1481  von Willebrand factor type A  23.77 
 
 
332 aa  57.8  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.587986  normal  0.160763 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0648  von Willebrand factor, type A  20.7 
 
 
307 aa  50.4  0.00004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1482  von Willebrand factor type A  21.86 
 
 
344 aa  49.7  0.00007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.428182  normal  0.250576 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0073  von Willebrand factor, type A  24.81 
 
 
349 aa  49.3  0.0001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3232  von Willebrand factor type A  26.2 
 
 
334 aa  48.1  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.34963  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1128  von Willebrand factor, type A  24.26 
 
 
282 aa  47.4  0.0004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0959166  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24400  von Willebrand factor type A domain-containing protein  23.48 
 
 
340 aa  47  0.0005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0690216  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0051  von Willebrand factor type A  25.31 
 
 
325 aa  47  0.0005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.901325  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2932  von Willebrand factor, type A  25.19 
 
 
334 aa  46.6  0.0007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.922939  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1886  von Willebrand factor, type A  26.44 
 
 
329 aa  46.2  0.0009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2396  von Willebrand factor type A  24.31 
 
 
377 aa  45.8  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.939741  normal  0.854107 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3211  von Willebrand factor, type A  26.39 
 
 
359 aa  45.8  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.161906 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18800  von Willebrand factor, type A (VWA) domain protein  24.6 
 
 
335 aa  45.4  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00117552  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02345  von Willebrand factor type A domain protein  21.07 
 
 
335 aa  45.1  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2991  von Willebrand factor type A domain-containing protein  23.44 
 
 
364 aa  44.7  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.603006  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0906  von Willebrand factor type A  29.41 
 
 
345 aa  44.7  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.519509  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2603  von Willebrand factor type A  23.81 
 
 
336 aa  44.7  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1680  von Willebrand factor type A  24.43 
 
 
333 aa  43.9  0.004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.233991  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0523  von Willebrand factor type A  32.59 
 
 
344 aa  43.9  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0825  von Willebrand factor type A  23.95 
 
 
339 aa  43.5  0.005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.431264  normal  0.379491 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5162  hypothetical protein  26.84 
 
 
322 aa  43.1  0.006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3116  von Willebrand factor type A domain protein  29.34 
 
 
328 aa  43.1  0.006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0524018  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5251  hypothetical protein  26.84 
 
 
322 aa  43.1  0.006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0430  hypothetical protein  23.48 
 
 
336 aa  43.1  0.007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0791  von Willebrand factor type A  23.48 
 
 
339 aa  43.1  0.007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.719983  normal  0.0260765 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5543  hypothetical protein  26.52 
 
 
322 aa  42.7  0.008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2469  von Willebrand factor type A  26.74 
 
 
325 aa  42.7  0.009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.597694 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2768  hypothetical protein  24.48 
 
 
344 aa  42.7  0.01  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2914  hypothetical protein  24.48 
 
 
344 aa  42.4  0.01  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>