48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_35730 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_35730  von Willebrand factor type A-like protein  100 
 
 		 369 aa  738    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2453  von Willebrand factor type A  52.14 
 
 		 349 aa  341  1e-92  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0230971 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3960  von Willebrand factor type A  51.08 
 
 		 343 aa  291  1e-77  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.287249 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3078  von Willebrand factor type A  47.9 
 
 		 330 aa  221  9.999999999999999e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0396917  hitchhiker  0.000000364289 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18990  von Willebrand factor type A-like protein  43.87 
 
 		 340 aa  215  9.999999999999999e-55  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0912448  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1986  Von Willebrand factor type A-like protein  36.93 
 
 		 352 aa  211  1e-53  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.421518  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2128  von Willebrand factor type A  41.72 
 
 		 333 aa  178  2e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000178489 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2371  von Willebrand factor, type A  37.08 
 
 		 340 aa  171  2e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0711  von Willebrand factor type A domain protein  35.84 
 
 		 378 aa  168  1e-40  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.556532 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2396  von Willebrand factor type A  25.99 
 
 		 377 aa  58.5  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.939741  normal  0.854107 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3093  von Willebrand factor type A domain-containing protein  25.52 
 
 		 338 aa  55.8  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24400  von Willebrand factor type A domain-containing protein  29.58 
 
 		 340 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0690216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2067  hypothetical protein  27.96 
 
 		 337 aa  54.7  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1589  von Willebrand factor type A  29.11 
 
 		 358 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.327037  hitchhiker  0.00013363 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1561  von Willebrand factor type A  28.8 
 
 		 358 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.604958 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3232  von Willebrand factor type A  29.28 
 
 		 334 aa  52.4  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.34963  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18800  von Willebrand factor, type A (VWA) domain protein  24.85 
 
 		 335 aa  51.6  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00117552  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1456  von Willebrand factor, type A  24.21 
 
 		 338 aa  50.8  0.00004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000144994 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3211  von Willebrand factor, type A  25.43 
 
 		 359 aa  50.4  0.00004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.161906 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1468  von Willebrand factor, type A  24.18 
 
 		 338 aa  50.4  0.00005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00210714 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0051  von Willebrand factor type A  27.56 
 
 		 325 aa  50.4  0.00005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.901325  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2888  von Willebrand factor, type A  25.1 
 
 		 340 aa  50.1  0.00006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2029  von Willebrand factor type A domain-containing protein  29.15 
 
 		 358 aa  50.1  0.00006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.34439  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3713  von Willebrand factor, type A  29.15 
 
 		 358 aa  50.1  0.00007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.512513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0042  hypothetical protein  23.93 
 
 		 318 aa  49.7  0.00009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.524449 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1593  von Willebrand factor type A  23.79 
 
 		 340 aa  49.3  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000650656 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02345  von Willebrand factor type A domain protein  25.73 
 
 		 335 aa  49.3  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1624  von Willebrand factor, type A  23.24 
 
 		 330 aa  48.9  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000050495 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3116  von Willebrand factor type A domain protein  23.28 
 
 		 328 aa  47.8  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0524018  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4532  hypothetical protein  26.92 
 
 		 334 aa  47.8  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.143586 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1106  hypothetical protein  34.17 
 
 		 318 aa  47.4  0.0004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1403  von Willebrand factor, type A  24.18 
 
 		 338 aa  47.4  0.0004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.520734  hitchhiker  0.0000232326 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2603  von Willebrand factor type A  24.15 
 
 		 336 aa  45.8  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2785  von Willebrand factor type A  23.1 
 
 		 340 aa  45.8  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2765  von Willebrand factor type A  23.1 
 
 		 339 aa  45.8  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.644793  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2860  von Willebrand factor type A  23.1 
 
 		 339 aa  46.2  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.140424  normal  0.0110983 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0430  hypothetical protein  36.49 
 
 		 336 aa  45.8  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0073  von Willebrand factor, type A  19.58 
 
 		 349 aa  45.8  0.001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2464  von Willebrand factor, type A  23.13 
 
 		 339 aa  45.1  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0524  hypothetical protein  24.32 
 
 		 320 aa  44.3  0.004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1718  von Willebrand factor, type A  26.19 
 
 		 352 aa  44.3  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.060135  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1680  von Willebrand factor type A  23.14 
 
 		 333 aa  43.1  0.007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.233991  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02150  aerotolerance-related membrane protein  25.33 
 
 		 334 aa  42.7  0.009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6107  von Willebrand factor type A  30.52 
 
 		 359 aa  42.7  0.009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1948  von Willebrand factor, type A  27.39 
 
 		 339 aa  42.7  0.009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3278  von Willebrand factor domain-containing protein  29.08 
 
 		 328 aa  42.7  0.01  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.173273  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2138  hypothetical protein  25.88 
 
 		 337 aa  42.7  0.01  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.401823  decreased coverage  0.00313955 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2438  von Willebrand factor type A  38.57 
 
 		 315 aa  42.7  0.01  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>