21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_3960 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_3960  von Willebrand factor type A  100 
 
 
343 aa  679    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.287249 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35730  von Willebrand factor type A-like protein  49.71 
 
 
369 aa  287  2e-76  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2453  von Willebrand factor type A  41.83 
 
 
349 aa  241  1e-62  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0230971 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18990  von Willebrand factor type A-like protein  40.41 
 
 
340 aa  227  2e-58  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0912448  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3078  von Willebrand factor type A  40.89 
 
 
330 aa  203  3e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0396917  hitchhiker  0.000000364289 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1986  Von Willebrand factor type A-like protein  35.71 
 
 
352 aa  191  1e-47  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.421518  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2128  von Willebrand factor type A  37.42 
 
 
333 aa  171  2e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000178489 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0711  von Willebrand factor type A domain protein  34.47 
 
 
378 aa  166  5.9999999999999996e-40  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.556532 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2371  von Willebrand factor, type A  33.71 
 
 
340 aa  162  8.000000000000001e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2396  von Willebrand factor type A  25.98 
 
 
377 aa  61.2  0.00000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.939741  normal  0.854107 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6107  von Willebrand factor type A  25.38 
 
 
359 aa  57.8  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0719  von Willebrand factor, type A  23.89 
 
 
334 aa  50.8  0.00004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.887647  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0524  hypothetical protein  27.42 
 
 
320 aa  46.6  0.0006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0042  hypothetical protein  25.57 
 
 
318 aa  46.2  0.0009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.524449 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1561  von Willebrand factor type A  24.92 
 
 
358 aa  45.4  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.604958 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4532  hypothetical protein  22.48 
 
 
334 aa  45.8  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.143586 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3116  von Willebrand factor type A domain protein  23.05 
 
 
328 aa  44.7  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0524018  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2603  von Willebrand factor type A  23.9 
 
 
336 aa  43.5  0.006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3085  batB protein, putative  26.82 
 
 
328 aa  43.5  0.006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3232  von Willebrand factor type A  25.9 
 
 
334 aa  43.5  0.006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.34963  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3713  von Willebrand factor, type A  23.95 
 
 
358 aa  42.7  0.009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.512513  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>