16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_0711 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_0711  von Willebrand factor type A domain protein  100 
 
 		 378 aa  780    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.556532 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1986  Von Willebrand factor type A-like protein  52.33 
 
 		 352 aa  380  1e-104  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.421518  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35730  von Willebrand factor type A-like protein  37.59 
 
 		 369 aa  166  5e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3960  von Willebrand factor type A  34.81 
 
 		 343 aa  165  1.0000000000000001e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.287249 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2453  von Willebrand factor type A  33.95 
 
 		 349 aa  143  5e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0230971 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3078  von Willebrand factor type A  34.02 
 
 		 330 aa  141  1.9999999999999998e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0396917  hitchhiker  0.000000364289 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18990  von Willebrand factor type A-like protein  33.46 
 
 		 340 aa  139  6e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0912448  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2128  von Willebrand factor type A  34.55 
 
 		 333 aa  136  5e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000178489 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2371  von Willebrand factor, type A  31.65 
 
 		 340 aa  128  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2396  von Willebrand factor type A  32.43 
 
 		 377 aa  48.5  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.939741  normal  0.854107 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1481  von Willebrand factor type A  31 
 
 		 332 aa  46.6  0.0008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.587986  normal  0.160763 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0430  hypothetical protein  35.9 
 
 		 336 aa  46.6  0.0008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3085  batB protein, putative  36.7 
 
 		 328 aa  45.1  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0051  von Willebrand factor type A  26.2 
 
 		 325 aa  45.1  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.901325  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18800  von Willebrand factor, type A (VWA) domain protein  31.34 
 
 		 335 aa  45.1  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00117552  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0719  von Willebrand factor, type A  27.78 
 
 		 334 aa  44.7  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.887647  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>