26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_2453 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013174  Jden_2453  von Willebrand factor type A  100 
 
 
349 aa  699    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0230971 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35730  von Willebrand factor type A-like protein  52.11 
 
 
369 aa  336  3.9999999999999995e-91  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3960  von Willebrand factor type A  41.83 
 
 
343 aa  243  3e-63  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.287249 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18990  von Willebrand factor type A-like protein  40.32 
 
 
340 aa  209  5e-53  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0912448  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3078  von Willebrand factor type A  46.07 
 
 
330 aa  199  3.9999999999999996e-50  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0396917  hitchhiker  0.000000364289 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1986  Von Willebrand factor type A-like protein  36.29 
 
 
352 aa  183  5.0000000000000004e-45  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.421518  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2128  von Willebrand factor type A  39.13 
 
 
333 aa  171  2e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000178489 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2371  von Willebrand factor, type A  34.78 
 
 
340 aa  157  2e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0711  von Willebrand factor type A domain protein  32.88 
 
 
378 aa  151  1e-35  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.556532 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0073  von Willebrand factor, type A  28.41 
 
 
349 aa  52.4  0.00001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2395  von Willebrand factor type A  32.48 
 
 
611 aa  50.4  0.00004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.850853  normal  0.642372 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3116  von Willebrand factor type A domain protein  23.99 
 
 
328 aa  50.4  0.00005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0524018  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24400  von Willebrand factor type A domain-containing protein  28 
 
 
340 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0690216  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2888  von Willebrand factor, type A  24.51 
 
 
340 aa  47.4  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18800  von Willebrand factor, type A (VWA) domain protein  28.16 
 
 
335 aa  47  0.0005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00117552  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3713  von Willebrand factor, type A  25 
 
 
358 aa  45.8  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.512513  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2029  von Willebrand factor type A domain-containing protein  25 
 
 
358 aa  45.4  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.34439  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1561  von Willebrand factor type A  25 
 
 
358 aa  45.8  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.604958 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2438  von Willebrand factor type A  39.74 
 
 
315 aa  44.3  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0430  hypothetical protein  32.43 
 
 
336 aa  43.5  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0906  von Willebrand factor type A  39.71 
 
 
345 aa  43.5  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.519509  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1812  von Willebrand factor type A  35.53 
 
 
318 aa  43.1  0.008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0523  von Willebrand factor type A  25.68 
 
 
344 aa  43.1  0.008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2067  hypothetical protein  24.58 
 
 
337 aa  43.1  0.008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1364  von Willebrand factor type A  27.67 
 
 
1188 aa  42.7  0.009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000145336  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02345  von Willebrand factor type A domain protein  25.55 
 
 
335 aa  42.7  0.009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>