42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_1919 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_1919  hypothetical protein  100 
 
 
221 aa  416  9.999999999999999e-116  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.90171  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02690  hypothetical protein  53.12 
 
 
224 aa  127  1.0000000000000001e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.1579  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3428  Rieske (2Fe-2S) domain protein  37.36 
 
 
296 aa  102  6e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1038  hypothetical protein  42.68 
 
 
180 aa  100  1e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1112  hypothetical protein  42.24 
 
 
195 aa  100  3e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.900973  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1196  Rieske (2Fe-2S) domain protein  36.14 
 
 
289 aa  97.8  1e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0895  hypothetical protein  37.5 
 
 
315 aa  90.1  2e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0773726  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4000  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  45.04 
 
 
322 aa  85.9  5e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.649548 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2739  hypothetical protein  36.42 
 
 
189 aa  85.9  5e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.504849 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4736  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  44.8 
 
 
293 aa  85.1  8e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4812  Rieske (2Fe-2S) domain protein  43.48 
 
 
304 aa  84.3  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4533  Rieske (2Fe-2S) domain protein  41.26 
 
 
294 aa  84  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.441672  normal  0.86514 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4823  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  41.77 
 
 
285 aa  83.2  0.000000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0232  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.64 
 
 
303 aa  82.8  0.000000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1008  hypothetical protein  35 
 
 
189 aa  80.5  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0250  hypothetical protein  36.13 
 
 
189 aa  75.5  0.0000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.960554 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0270  hypothetical protein  37.41 
 
 
189 aa  74.3  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.156372 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0260  hypothetical protein  37.41 
 
 
189 aa  74.3  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.075822  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0333  Rieske (2Fe-2S) protein  38.24 
 
 
298 aa  73.9  0.000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2871  Rieske (2Fe-2S) region  35.53 
 
 
292 aa  65.1  0.0000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0513  Ferredoxin subunits of nitrite reductase and ring-hydroxylating dioxygenase-like protein  42.86 
 
 
303 aa  62.4  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0722  hypothetical protein  30.26 
 
 
185 aa  60.1  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0736  hypothetical protein  30.26 
 
 
185 aa  60.1  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.141568 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2790  hypothetical protein  33.1 
 
 
173 aa  59.7  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.49529 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0716  hypothetical protein  30.92 
 
 
185 aa  59.3  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.158068  normal  0.475844 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20170  hypothetical protein  34.55 
 
 
176 aa  57.8  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0976183  normal  0.0396109 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2820  membrane protein-like protein  31.34 
 
 
175 aa  57.4  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3979  hypothetical protein  29.45 
 
 
162 aa  56.6  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4131  Protein of unknown function DUF2231, transmembrane  28.57 
 
 
165 aa  53.5  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.159201 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4364  hypothetical protein  29.17 
 
 
168 aa  50.1  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.801295  normal  0.025652 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6294  hypothetical protein  28.37 
 
 
162 aa  49.7  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.47453  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2153  hypothetical protein  29.37 
 
 
153 aa  50.1  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2118  hypothetical protein  32.85 
 
 
173 aa  49.7  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0819  Rieske (2Fe-2S) domain protein  40.57 
 
 
294 aa  49.7  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0125  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.52 
 
 
277 aa  49.3  0.00005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.249783 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2570  membrane protein-like  29.41 
 
 
185 aa  47.8  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00540  hypothetical protein  45.45 
 
 
111 aa  46.2  0.0004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0124  hypothetical protein  31.51 
 
 
171 aa  45.8  0.0006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.658752  normal  0.409828 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3478  hypothetical protein  28.24 
 
 
175 aa  44.3  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1428  hypothetical protein  31.17 
 
 
170 aa  44.3  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.536406 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2915  hypothetical protein  28.68 
 
 
154 aa  42  0.008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.39688 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1387  membrane protein  26.49 
 
 
195 aa  41.6  0.01  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>