More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_1948 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_1948  coproporphyrinogen III oxidase  100 
 
 
504 aa  1035    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1341  coproporphyrinogen III oxidase  51.51 
 
 
505 aa  488  1e-136  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.996503  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1901  coproporphyrinogen III oxidase  46.94 
 
 
480 aa  377  1e-103  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2190  coproporphyrinogen III oxidase  46.45 
 
 
480 aa  374  1e-102  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0550  coproporphyrinogen III oxidase  48.72 
 
 
491 aa  362  7.0000000000000005e-99  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.790548  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3377  coproporphyrinogen III oxidase  40.54 
 
 
509 aa  355  1e-96  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2881  coproporphyrinogen III oxidase  39.88 
 
 
494 aa  350  5e-95  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.969668  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1445  coproporphyrinogen III oxidase  39.09 
 
 
499 aa  342  1e-92  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3606  coproporphyrinogen III oxidase  41.22 
 
 
518 aa  326  5e-88  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0631  coproporphyrinogen III oxidase  41.85 
 
 
501 aa  324  2e-87  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000100188  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1948  coproporphyrinogen III oxidase  41 
 
 
471 aa  319  7.999999999999999e-86  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0706  coproporphyrinogen III oxidase  37.69 
 
 
495 aa  316  6e-85  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1051  coproporphyrinogen III oxidase  41.15 
 
 
495 aa  313  6.999999999999999e-84  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0831  coproporphyrinogen III oxidase  40.89 
 
 
498 aa  312  7.999999999999999e-84  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0778  coproporphyrinogen III oxidase  40.89 
 
 
498 aa  312  7.999999999999999e-84  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.798816  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0777  coproporphyrinogen III oxidase  40.89 
 
 
498 aa  312  9e-84  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0875  coproporphyrinogen III oxidase  40.89 
 
 
496 aa  312  9e-84  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.737653  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0964  coproporphyrinogen III oxidase  40.89 
 
 
495 aa  312  1e-83  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0926  coproporphyrinogen III oxidase  40.89 
 
 
495 aa  311  2e-83  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.200785  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0964  coproporphyrinogen III oxidase  40.89 
 
 
496 aa  311  2e-83  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4404  coproporphyrinogen III oxidase  40.89 
 
 
495 aa  311  2e-83  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000115186 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0778  coproporphyrinogen III oxidase  39.71 
 
 
496 aa  311  2e-83  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.385529  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4085  Coproporphyrinogen dehydrogenase  41.99 
 
 
468 aa  266  5.999999999999999e-70  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1406  Coproporphyrinogen dehydrogenase  38.52 
 
 
457 aa  252  1e-65  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0315  coproporphyrinogen III oxidase  36.48 
 
 
438 aa  238  1e-61  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2008  coproporphyrinogen III oxidase  31.11 
 
 
377 aa  144  3e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0582  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  29.68 
 
 
388 aa  141  1.9999999999999998e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2293  coproporphyrinogen III oxidase  31.11 
 
 
377 aa  142  1.9999999999999998e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4306  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  31.91 
 
 
375 aa  139  1e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0329595  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2500  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  30.77 
 
 
378 aa  138  2e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000623828  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2314  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  31.7 
 
 
408 aa  139  2e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0256017  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3612  coproporphyrinogen III oxidase  30.16 
 
 
379 aa  137  5e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3455  coproporphyrinogen III oxidase  29.84 
 
 
380 aa  137  6.0000000000000005e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.766268  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1325  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  28.12 
 
 
380 aa  136  9e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3361  coproporphyrinogen III oxidase  29.1 
 
 
380 aa  135  9.999999999999999e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00679793 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0055  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  29.75 
 
 
365 aa  135  9.999999999999999e-31  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.60035 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3535  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  30.79 
 
 
383 aa  136  9.999999999999999e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000160096  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_761  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  28.99 
 
 
378 aa  134  3e-30  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000202557  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4035  coproporphyrinogen III oxidase  29.84 
 
 
379 aa  134  5e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.023291 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3447  coproporphyrinogen III oxidase  29.17 
 
 
378 aa  134  5e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.286445 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0007  coproporphyrinogen III oxidase  29.52 
 
 
391 aa  134  6e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.712639  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0485  coproporphyrinogen III oxidase  30.87 
 
 
384 aa  133  6.999999999999999e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0776  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  28.16 
 
 
378 aa  133  7.999999999999999e-30  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.00749552  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0770  coproporphyrinogen III oxidase  29.51 
 
 
378 aa  133  9e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.261122  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3351  coproporphyrinogen III oxidase  28.76 
 
 
378 aa  132  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.315269 
 
 
-
 
NC_002936  DET0858  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase, putative  29.07 
 
 
378 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0560367  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3343  coproporphyrinogen III oxidase  28.76 
 
 
378 aa  132  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.368838 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3267  coproporphyrinogen III oxidase  28.76 
 
 
378 aa  132  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1999  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  28.96 
 
 
388 aa  131  3e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.865362  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3278  coproporphyrinogen III oxidase  28.76 
 
 
378 aa  131  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.026335 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1363  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  29.54 
 
 
389 aa  130  4.0000000000000003e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02785  coproporphyrinogen III oxidase  28.52 
 
 
378 aa  129  9.000000000000001e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.179359  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02748  hypothetical protein  28.52 
 
 
378 aa  129  9.000000000000001e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.153415  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1151  coproporphyrinogen III oxidase  31.09 
 
 
374 aa  129  1.0000000000000001e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05040  coproporphyrinogen III oxidase  30.67 
 
 
384 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1216  coproporphyrinogen III oxidase  29.89 
 
 
378 aa  129  1.0000000000000001e-28  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4974  coproporphyrinogen III oxidase  30.23 
 
 
391 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0890  coproporphyrinogen III oxidase  28.26 
 
 
376 aa  128  3e-28  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.112069  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1109  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  33.99 
 
 
377 aa  127  4.0000000000000003e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.298913  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4258  coproporphyrinogen III oxidase  28.2 
 
 
378 aa  127  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0740  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  28.1 
 
 
378 aa  127  5e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0536  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  28.25 
 
 
578 aa  127  5e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.448786  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1131  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  28.44 
 
 
379 aa  127  6e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00230562  normal  0.548541 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0110  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase, putative  28.87 
 
 
393 aa  125  1e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000543862  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3387  coproporphyrinogen III oxidase  28.1 
 
 
378 aa  125  1e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1249  coproporphyrinogen III oxidase  28.27 
 
 
379 aa  126  1e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1304  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  29.87 
 
 
381 aa  126  1e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1228  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  34.87 
 
 
380 aa  125  2e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2205  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  26.51 
 
 
484 aa  125  2e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.434843  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1180  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  30.9 
 
 
401 aa  125  2e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.219055  hitchhiker  0.00393596 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2374  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  29.26 
 
 
448 aa  124  3e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1108  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  28.21 
 
 
360 aa  124  4e-27  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0755  coproporphyrinogen III oxidase  29.18 
 
 
379 aa  124  4e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2082  coproporphyrinogen III oxidase  29.56 
 
 
375 aa  124  4e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1980  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  29.54 
 
 
380 aa  123  7e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000136099  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3875  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  27.44 
 
 
406 aa  123  7e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0143  coproporphyrinogen III oxidase  26.89 
 
 
376 aa  123  7e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000483536 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0826  coproporphyrinogen III oxidase  26.89 
 
 
376 aa  123  7e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0825  coproporphyrinogen III oxidase  26.89 
 
 
376 aa  123  7e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.330416  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002450  coproporphyrinogen III oxidase, oxygen-independent  28.08 
 
 
392 aa  123  8e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3097  coproporphyrinogen III oxidase  27.87 
 
 
378 aa  123  9e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000345052 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0759  coproporphyrinogen III oxidase  27.87 
 
 
378 aa  123  9e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000573813 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2783  coproporphyrinogen III oxidase  27.79 
 
 
460 aa  123  9e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.682554  normal  0.601804 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3115  coproporphyrinogen III oxidase  27.87 
 
 
378 aa  123  9e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03000  coproporphyrinogen III oxidase  28.2 
 
 
373 aa  122  9.999999999999999e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2963  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  28.99 
 
 
387 aa  122  9.999999999999999e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.000535992  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1649  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  29.74 
 
 
370 aa  122  9.999999999999999e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.797828  normal  0.0143577 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03584  coproporphyrinogen III oxidase  28.48 
 
 
390 aa  122  9.999999999999999e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1226  coproporphyrinogen dehydrogenase  27.97 
 
 
378 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000226864  normal  0.222132 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3559  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  28.8 
 
 
393 aa  122  1.9999999999999998e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3299  coproporphyrinogen III oxidase  27.78 
 
 
378 aa  122  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3306  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  26.63 
 
 
423 aa  121  3e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.661128  normal  0.0726751 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3351  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  26.01 
 
 
384 aa  120  3.9999999999999996e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3308  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  28.57 
 
 
390 aa  120  3.9999999999999996e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3288  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  27.91 
 
 
396 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0944  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  33.49 
 
 
375 aa  120  4.9999999999999996e-26  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10300  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  28.09 
 
 
372 aa  120  6e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0541623  unclonable  0.00000000192008 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0479  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  34.52 
 
 
385 aa  120  7e-26  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.822373  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1188  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  27.53 
 
 
385 aa  120  7e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1177  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  29.12 
 
 
372 aa  120  7.999999999999999e-26  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>