More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_1851 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_1851  Cof-like hydrolase  100 
 
 
274 aa  565  1e-160  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.229271  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3074  Cof-like hydrolase  33.33 
 
 
306 aa  131  1.0000000000000001e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0216  Cof-like hydrolase  30.8 
 
 
265 aa  102  6e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0437  Cof-like hydrolase  30.22 
 
 
273 aa  100  3e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000100765  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2017  Cof-like hydrolase  29.46 
 
 
269 aa  100  3e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16120  Cof-like hydrolase  28.96 
 
 
267 aa  99.4  5e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0258  hypothetical protein  29.96 
 
 
268 aa  99  8e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2123  Cof-like hydrolase  29.17 
 
 
266 aa  96.7  4e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000204309  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0795  Cof-like hydrolase  28.1 
 
 
269 aa  94.7  1e-18  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3424  Cof-like hydrolase  28.02 
 
 
271 aa  92.8  5e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.925804  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2182  Cof-like hydrolase  30.42 
 
 
266 aa  92.4  8e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3120  Cof-like hydrolase family protein  26.45 
 
 
272 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0330489  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0534  HAD superfamily hydrolase  26.85 
 
 
273 aa  91.3  2e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0223  Cof-like hydrolase  28.25 
 
 
273 aa  90.5  3e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0606328  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0594  HAD family hydrolase  27.92 
 
 
266 aa  90.5  3e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0583  HAD family hydrolase  29.06 
 
 
266 aa  90.1  3e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000118993  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3785  sugar phosphatase  27.72 
 
 
277 aa  90.5  3e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.892973  normal  0.40835 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4149  sugar phosphatase  28.88 
 
 
269 aa  89.7  4e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.680051  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0036  sugar phosphatase  26.79 
 
 
271 aa  89.7  5e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.148039 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1519  HAD family hydrolase  28.62 
 
 
277 aa  89.7  5e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2207  Cof-like hydrolase  27.88 
 
 
273 aa  89.7  5e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4165  sugar phosphatase  28 
 
 
281 aa  89.4  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.639249  normal  0.797935 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0569  Cof-like hydrolase  25.38 
 
 
271 aa  89.4  6e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.122616  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4116  sugar phosphatase  28 
 
 
281 aa  89.4  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0366  HAD superfamily hydrolase  27 
 
 
271 aa  89.4  7e-17  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4043  sugar phosphatase  28 
 
 
270 aa  89  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3056  Cof-like hydrolase  29.33 
 
 
268 aa  89  7e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01290  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  26.22 
 
 
278 aa  88.6  9e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.384246  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4730  Cof-like hydrolase  25.93 
 
 
270 aa  88.2  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0012  sugar phosphatase  28.3 
 
 
271 aa  88.6  1e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.758679  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0005  sugar phosphatase  28.52 
 
 
269 aa  88.2  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4060  sugar phosphatase  28 
 
 
270 aa  88.2  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5573  hypothetical protein  27.57 
 
 
259 aa  88.2  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4173  sugar phosphatase  28.52 
 
 
269 aa  88.2  1e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.729204  hitchhiker  0.0085653 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4223  sugar phosphatase  28 
 
 
281 aa  88.6  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0140  Cof-like hydrolase  27.27 
 
 
262 aa  87.4  2e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000381708  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1231  Cof-like hydrolase  29.89 
 
 
249 aa  87.4  2e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03580  predicted hydrolase  27.84 
 
 
270 aa  87  3e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0006  Cof-like hydrolase  27.84 
 
 
270 aa  87  3e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03524  hypothetical protein  27.84 
 
 
270 aa  87  3e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4206  sugar phosphatase  27.84 
 
 
270 aa  87  3e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.24952  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5125  sugar phosphatase  27.84 
 
 
270 aa  86.7  3e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.231854 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4062  sugar phosphatase  27.84 
 
 
270 aa  87  3e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3909  sugar phosphatase  27.84 
 
 
270 aa  86.3  5e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1392  Cof-like hydrolase  26.72 
 
 
267 aa  86.3  5e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000626489  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1419  Cof-like hydrolase  26.72 
 
 
267 aa  86.3  5e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00926207  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0006  sugar phosphatase  27.84 
 
 
270 aa  86.3  5e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3925  sugar phosphatase  29.21 
 
 
272 aa  86.3  5e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.679086  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0120  Cof-like hydrolase  27.64 
 
 
274 aa  85.5  8e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2987  Cof protein/HAD-superfamily hydrolase  26.39 
 
 
269 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.50088 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0590  HAD family hydrolase  26.62 
 
 
279 aa  85.1  0.000000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.24971  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0579  HAD family hydrolase  25.18 
 
 
279 aa  85.1  0.000000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.407904  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1309  HAD family hydrolase  27.8 
 
 
277 aa  85.1  0.000000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1541  HAD family hydrolase  25.09 
 
 
276 aa  85.5  0.000000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.145336  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0013  sugar phosphatase  27.92 
 
 
271 aa  84.3  0.000000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0280  Cof-like hydrolase  27.27 
 
 
264 aa  84.7  0.000000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4398  Cof family hydrolase  27.68 
 
 
244 aa  84  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1225  HAD superfamily hydrolase  25.28 
 
 
266 aa  84.3  0.000000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1821  HAD family hydrolase  25.8 
 
 
276 aa  84.3  0.000000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0131582  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2847  phosphotransferase  26.52 
 
 
273 aa  83.6  0.000000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0278  Cof-like hydrolase  27.14 
 
 
268 aa  83.6  0.000000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0153774  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0870  HAD superfamily hydrolase  27.44 
 
 
281 aa  84  0.000000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000525914  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0977  hypothetical protein  29.1 
 
 
273 aa  83.6  0.000000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4220  putative hydrolase  27.65 
 
 
244 aa  84  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4241  hydrolase, Cof family  27.82 
 
 
244 aa  83.2  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4113  sugar phosphatase  27.64 
 
 
279 aa  82.8  0.000000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3056  phosphotransferase  26.94 
 
 
273 aa  83.2  0.000000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.64186  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1545  Cof-like hydrolase  27.59 
 
 
268 aa  82.8  0.000000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0779  Cof-like hydrolase  29.52 
 
 
275 aa  82.4  0.000000000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2032  Cof-like hydrolase  27.17 
 
 
278 aa  82  0.000000000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.201826 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0900  HAD superfamily hydrolase  29 
 
 
268 aa  82  0.000000000000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0005  sugar phosphatase  27.59 
 
 
270 aa  82  0.000000000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1001  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  27.68 
 
 
271 aa  81.6  0.00000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1218  HAD family hydrolase  26.59 
 
 
271 aa  81.3  0.00000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1653  hypothetical protein  25.95 
 
 
407 aa  80.9  0.00000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0410  HAD family hydrolase  29.52 
 
 
274 aa  81.3  0.00000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.661813  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0388  HAD superfamily hydrolase  25.65 
 
 
270 aa  80.5  0.00000000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0719  Cof-like hydrolase  25.58 
 
 
268 aa  80.5  0.00000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1302  Cof-like hydrolase  28.15 
 
 
274 aa  80.5  0.00000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.241456  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1822  Cof-like hydrolase  25.38 
 
 
268 aa  80.5  0.00000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01730  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  24.82 
 
 
311 aa  80.5  0.00000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.330616  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0324  Cof-like hydrolase  29.96 
 
 
275 aa  80.1  0.00000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000119179  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2934  phosphotransferase  26.14 
 
 
273 aa  80.1  0.00000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0869  phosphotransferase  24.82 
 
 
306 aa  78.6  0.00000000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0457  Cof-like hydrolase  26.57 
 
 
282 aa  78.2  0.0000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.287116  normal  0.117356 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1257  phosphotransferase  26.04 
 
 
272 aa  78.6  0.0000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3948  Cof-like hydrolase  24 
 
 
274 aa  78.6  0.0000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0789  phosphotransferase  24.72 
 
 
272 aa  77.8  0.0000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0853  Cof-like hydrolase  26.4 
 
 
265 aa  77.8  0.0000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0793  phosphotransferase  24.72 
 
 
272 aa  77.8  0.0000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1422  phosphotransferase  25.76 
 
 
273 aa  77.8  0.0000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5023  Cof protein  23.48 
 
 
271 aa  77.4  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5111  Cof-like hydrolase  23.48 
 
 
271 aa  77.4  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.569864 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0687  phosphotransferase  24.72 
 
 
272 aa  77.4  0.0000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.028657  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1278  phosphotransferase  25.83 
 
 
273 aa  77  0.0000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.243321  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4408  putative conserved hypothetical protein  24.82 
 
 
287 aa  77  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0949977 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5404  Cof-like hydrolase  23.48 
 
 
271 aa  76.6  0.0000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.365978 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0883  Cof-like hydrolase  23.97 
 
 
269 aa  76.6  0.0000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1274  Cof-like hydrolase  22.51 
 
 
272 aa  76.6  0.0000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.442966  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1028  Cof-like hydrolase  26.94 
 
 
271 aa  76.6  0.0000000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>