More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_0343 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_0343  ABC transporter related  100 
 
 		 544 aa  1076    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0501517  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0688  ABC transporter related  31.31 
 
 		 559 aa  258  2e-67  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1046  ABC transporter related  27.8 
 
 		 554 aa  239  1e-61  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0583  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  27.75 
 
 		 586 aa  226  6e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0584  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  27.93 
 
 		 586 aa  226  7e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4793  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  26.98 
 
 		 586 aa  225  1e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.646278  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0532  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  26.94 
 
 		 586 aa  225  2e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.117534  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0439  ABC transporter ATP-binding and permease; multidrug resistance protein  26.75 
 
 		 586 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.214785  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0511  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  26.75 
 
 		 586 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0496  ABC transporter ATP-binding/permease  26.57 
 
 		 586 aa  220  5e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.384636  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0528  ABC transporter permease/ATP-binding protein  26.57 
 
 		 586 aa  220  5e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.249641  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0435  ABC transporter ATP-binding and permease; multidrug resistance protein  26.39 
 
 		 586 aa  219  1e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.290198  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0444  ABC transporter related  26.22 
 
 		 586 aa  217  5e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4991  ABC transporter related  28.1 
 
 		 808 aa  214  4.9999999999999996e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2857  cyclic nucleotide-binding protein  29.69 
 
 		 1038 aa  212  2e-53  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.590453  hitchhiker  0.00593059 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3264  cyclic nucleotide-binding protein  29.69 
 
 		 1038 aa  211  2e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3262  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter related  25.91 
 
 		 764 aa  210  6e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5708  ABC transporter related  28.18 
 
 		 764 aa  207  3e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.920431  normal  0.127768 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2090  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  27.71 
 
 		 581 aa  207  4e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4038  ABC transporter-related protein  27.19 
 
 		 726 aa  207  5e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000838789 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1437  ABC transporter related protein  27.81 
 
 		 552 aa  206  8e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1526  ABC transporter related  26.69 
 
 		 597 aa  203  5e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00462588  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0117  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  28.73 
 
 		 1006 aa  203  7e-51  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.152098  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0450  ABC transporter-related protein  25.68 
 
 		 586 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4383  bacteriocin-processing peptidase  26.13 
 
 		 1011 aa  202  1.9999999999999998e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.443877  normal  0.0633498 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0047  ABC transporter related  27.39 
 
 		 580 aa  202  1.9999999999999998e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00438981  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0475  ABC transporter related  27.02 
 
 		 584 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00181463  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3979  ABC transporter-related protein  27.32 
 
 		 773 aa  201  1.9999999999999998e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2401  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  26.68 
 
 		 598 aa  201  3e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2932  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  26.87 
 
 		 598 aa  201  3e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00230756 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1417  ABC transporter related  26.59 
 
 		 782 aa  201  3.9999999999999996e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.111222 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0084  bacteriocin-processing peptidase  26.85 
 
 		 715 aa  201  3.9999999999999996e-50  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3519  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  27.82 
 
 		 1019 aa  199  7e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2669  ABC transporter related  26.44 
 
 		 637 aa  200  7e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.871518  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0637  ABC transporter related  26.91 
 
 		 770 aa  199  7.999999999999999e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.57887  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1316  ABC transporter related  26.04 
 
 		 784 aa  199  7.999999999999999e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.512065  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0410  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  27.19 
 
 		 908 aa  199  7.999999999999999e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0658  ABC transporter related  26.73 
 
 		 750 aa  199  1.0000000000000001e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6290  ABC transporter related protein  26.93 
 
 		 598 aa  198  2.0000000000000003e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0167  ABC-type bacteriocin transporter family protein  26.9 
 
 		 739 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1954  ABC transporter related  27.95 
 
 		 578 aa  198  2.0000000000000003e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1920  ABC transporter related  27.95 
 
 		 578 aa  198  2.0000000000000003e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0225  bacteriocin-processing peptidase  27.18 
 
 		 908 aa  198  2.0000000000000003e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2250  ABC transporter related  26.68 
 
 		 598 aa  197  3e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0582239  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0649  ABC transporter transmembrane region  27.92 
 
 		 597 aa  197  3e-49  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.564007  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1007  ABC transporter related  26.46 
 
 		 784 aa  197  3e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.29536 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0624  ABC transporter, transmembrane region  27.92 
 
 		 597 aa  197  4.0000000000000005e-49  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1770  ABC transporter related  28.12 
 
 		 610 aa  197  4.0000000000000005e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.686344  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14311  hypothetical protein  24.91 
 
 		 968 aa  197  6e-49  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2193  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  26.76 
 
 		 598 aa  196  1e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0325354  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4067  ABC transporter related  25.75 
 
 		 596 aa  195  1e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00142757  normal  0.169154 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0327  ABC-type bacteriocin transporter  28.26 
 
 		 734 aa  196  1e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2539  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  26.76 
 
 		 598 aa  196  1e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.835968  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4927  toxin secretion ABC transporter protein  26.45 
 
 		 731 aa  194  2e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2475  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  26.76 
 
 		 598 aa  195  2e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00961334  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2460  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  26.76 
 
 		 598 aa  194  4e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2276  ABC transporter ATP-binding/permease  26.76 
 
 		 598 aa  194  4e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.406907  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2236  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  26.76 
 
 		 598 aa  194  4e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0563945  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2584  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter related  25.18 
 
 		 768 aa  194  4e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2444  ABC transporter permease/ATP-binding protein  26.76 
 
 		 598 aa  194  4e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.290529  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3424  cyclic nucleotide-binding protein  26.97 
 
 		 906 aa  193  6e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1885  ABC transporter related protein  29.53 
 
 		 618 aa  193  8e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5995  ABC transporter related  25.36 
 
 		 632 aa  192  9e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.210924  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1403  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  26.23 
 
 		 578 aa  192  1e-47  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1060  ABC transporter related  26.96 
 
 		 760 aa  192  1e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.120719  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0251  ABC-type bacteriocin transporter  28.08 
 
 		 734 aa  192  1e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000911417  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2471  ABC transporter related protein  26.87 
 
 		 600 aa  192  1e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0719  bacteriocin ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  27.07 
 
 		 717 aa  191  2e-47  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00348631  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2680  cyclic nucleotide-binding protein  26.78 
 
 		 906 aa  192  2e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2690  multidrug resistance ABC transporter  28.15 
 
 		 615 aa  192  2e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0586583  normal  0.13127 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1182  ATPase  29.13 
 
 		 982 aa  191  2e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0353  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  23.15 
 
 		 582 aa  192  2e-47  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.693994  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1469  ABC transporter related protein  26.56 
 
 		 586 aa  192  2e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1782  ABC transporter-related protein  26.71 
 
 		 605 aa  191  2e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.563719  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66080  transport protein MsbA  24.59 
 
 		 603 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1379  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  26.9 
 
 		 615 aa  191  2.9999999999999997e-47  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4080  ABC transporter related  25.18 
 
 		 814 aa  191  4e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.256448  normal  0.875845 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3530  ABC transporter, ATP-binding/permease  27.78 
 
 		 590 aa  191  4e-47  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.672415 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0584  ABC transporter transmembrane region  27.05 
 
 		 582 aa  191  4e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.321607  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1224  ATPase  26.53 
 
 		 980 aa  190  5e-47  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.25476  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0389  ABC transporter ATP-binding protein  23.15 
 
 		 582 aa  190  5.999999999999999e-47  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1201  ABC transporter related protein  24.17 
 
 		 594 aa  190  5.999999999999999e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3967  ABC transporter related  25.18 
 
 		 768 aa  190  5.999999999999999e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1227  ABC transporter related  25.84 
 
 		 589 aa  189  8e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.175574 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7144  ABC transporter related  24.95 
 
 		 632 aa  189  8e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0466  ABC transporter related  27.94 
 
 		 588 aa  189  8e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1021  putative ABC transporter  25.73 
 
 		 778 aa  189  9e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.338231  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0838  ABC transporter related  27.24 
 
 		 640 aa  189  1e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5732  transport protein MsbA  24.77 
 
 		 603 aa  189  1e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3376  ABC transporter related  27.05 
 
 		 610 aa  189  1e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2505  ABC transporter related protein  24.55 
 
 		 607 aa  189  1e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.152219  normal  0.502097 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2726  ABC transporter related  27.09 
 
 		 610 aa  189  2e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0247  ABC transporter related  27.47 
 
 		 586 aa  187  3e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.306695  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1275  ABC transporter related protein  26.53 
 
 		 576 aa  187  4e-46  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2181  ABC transporter related  24.46 
 
 		 600 aa  187  4e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2729  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  24.91 
 
 		 582 aa  187  5e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1075  lipid transporter ATP-binding/permease protein  24.91 
 
 		 582 aa  187  5e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.220185  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00925  hypothetical protein  24.91 
 
 		 582 aa  187  5e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.433065  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2527  Type I secretion system ATPase, HlyB  25.44 
 
 		 976 aa  187  5e-46  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.76843 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1021  lipid transporter ATP-binding/permease protein  24.91 
 
 		 582 aa  187  5e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0261521  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>