More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_4452 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_4452  ABC transporter related  100 
 
 		 253 aa  508  1e-143  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0610  ABC transporter related  69.2 
 
 		 268 aa  331  6e-90  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.376916  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0742  putative ABC transporter, ATP-binding protein  63.37 
 
 		 257 aa  320  9.999999999999999e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.267111  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3976  ABC transporter related  61.22 
 
 		 257 aa  303  1.0000000000000001e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1341  ABC transporter-like  61.51 
 
 		 262 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.359238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1889  ABC transporter related  61.34 
 
 		 257 aa  301  8.000000000000001e-81  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.110075  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3974  ABC transporter  61.51 
 
 		 260 aa  300  2e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.161065  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4240  ABC transporter, ATP-binding protein  60.92 
 
 		 260 aa  298  4e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2684  ABC transporter related protein  59.83 
 
 		 263 aa  298  8e-80  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2397  ABC transporter related  59.83 
 
 		 268 aa  296  2e-79  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1364  ABC transporter related  60.94 
 
 		 289 aa  295  5e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.245091  normal  0.0323343 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1124  ABC transporter  60.89 
 
 		 267 aa  288  7e-77  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6520  ABC transporter related  56.15 
 
 		 276 aa  286  1e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.526333  normal  0.510638 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2499  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  56.97 
 
 		 279 aa  285  4e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0048  ABC transporter related  57.44 
 
 		 259 aa  285  4e-76  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2358  ABC transporter related  58.68 
 
 		 246 aa  285  5e-76  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.869822  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6108  ABC transporter related  55.74 
 
 		 276 aa  283  2.0000000000000002e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.665492 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2603  ABC transporter related  55 
 
 		 256 aa  275  4e-73  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00980266 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1591  ABC transporter related  55.7 
 
 		 263 aa  273  1.0000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.963081  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1225  ABC transporter related  50.8 
 
 		 274 aa  271  1e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.164506  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2185  ABC transporter related  54.01 
 
 		 263 aa  267  1e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.839848  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4534  ABC transporter related  53.59 
 
 		 263 aa  264  1e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.94029 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2730  ABC transporter related  56.96 
 
 		 280 aa  258  6e-68  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3490  ABC transporter related  44.35 
 
 		 303 aa  200  1.9999999999999998e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.411512 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1077  ATPase  46.15 
 
 		 251 aa  187  1e-46  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.096527  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3254  ABC transporter related  43.48 
 
 		 258 aa  186  4e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0994591 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3670  ABC transporter related  50 
 
 		 293 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.206821  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0059  ABC transporter related  41.98 
 
 		 257 aa  179  2.9999999999999997e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0039  ABC transporter related  44.92 
 
 		 276 aa  178  8e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.147558  normal  0.492978 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3345  ABC transporter related  49.5 
 
 		 293 aa  178  9e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6457  ABC transporter ATP-binding protein  48.24 
 
 		 261 aa  177  1e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1475  ABC transporter related  40.57 
 
 		 254 aa  177  1e-43  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1647  ABC transporter related  46.05 
 
 		 330 aa  177  1e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.480345  normal  0.121683 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2105  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  43.3 
 
 		 289 aa  176  2e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2560  ABC transporter related  40.69 
 
 		 271 aa  176  3e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2857  ABC transporter-related protein  45.74 
 
 		 259 aa  176  3e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.99142  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0445  ABC transporter related  40.57 
 
 		 254 aa  176  4e-43  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3450  ABC transporter related  45 
 
 		 384 aa  176  4e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.622564  normal  0.365938 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2643  ABC transporter related  43.75 
 
 		 261 aa  175  5e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.430112  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1090  taurine ABC transporter, ATP-binding protein  42.92 
 
 		 260 aa  174  9.999999999999999e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0079  ABC transporter related  40.69 
 
 		 307 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0392  ABC transporter related  42.08 
 
 		 254 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.238571  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3136  ABC transporter related protein  43.46 
 
 		 261 aa  173  1.9999999999999998e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.257722  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21980  ABC transporter, ATP binding component  44.34 
 
 		 271 aa  174  1.9999999999999998e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3906  ABC transporter related  40.67 
 
 		 315 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.118447  normal  0.091795 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0147  ABC transporter related  46.43 
 
 		 259 aa  172  2.9999999999999996e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.288686 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2718  ABC transporter related  44.39 
 
 		 259 aa  173  2.9999999999999996e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2491  ABC aliphatic sulfonates transporter, ATPase subunit  44.91 
 
 		 261 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.761124 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1321  ABC transporter-like protein  44.02 
 
 		 288 aa  172  5e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.251104 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3188  putative ABC transporter ATP-binding protein  42.4 
 
 		 378 aa  172  5e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04080  ABC-type spermidine/putrescine transport system, ATPase component  38.78 
 
 		 316 aa  172  5.999999999999999e-42  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.716043 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0482  ABC transporter related protein  40.72 
 
 		 255 aa  171  6.999999999999999e-42  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1993  ABC transporter related  41.94 
 
 		 352 aa  171  6.999999999999999e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.218449  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3948  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.1 
 
 		 377 aa  171  9e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0770122  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0467  ABC transporter related  46.23 
 
 		 274 aa  171  9e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0117  ATPase  47.55 
 
 		 312 aa  171  9e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.182044  hitchhiker  0.000782511 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0923  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  43.5 
 
 		 240 aa  171  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0351202  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3817  polyamine ABC transporter ATP-binding protein  45.33 
 
 		 382 aa  171  1e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.217368  normal  0.691578 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0892  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  43.5 
 
 		 240 aa  171  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0239276  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0864  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  43.5 
 
 		 240 aa  171  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0976  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  43.5 
 
 		 240 aa  171  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.345768  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5555  ABC transporter related  44.28 
 
 		 303 aa  171  1e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.356356  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0955  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  43.5 
 
 		 240 aa  171  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.170507  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5920  ABC transporter related  44.28 
 
 		 303 aa  171  1e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6427  ABC transporter related  44.28 
 
 		 303 aa  171  1e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1505  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system ATPase component  44.5 
 
 		 262 aa  170  2e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0234474  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2088  ABC transporter related  45.12 
 
 		 382 aa  170  2e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.619396  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0349  ABC transporter, ATPase subunit  41.47 
 
 		 352 aa  170  2e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4706  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  43.84 
 
 		 319 aa  170  2e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0156  ABC transporter related  42.79 
 
 		 260 aa  170  2e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6201  ABC transporter related  42.38 
 
 		 245 aa  170  2e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.102037 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1857  ABC transporter related  42.29 
 
 		 304 aa  170  2e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6155  ABC transporter related  42.47 
 
 		 286 aa  170  2e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.300039  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3083  ABC transporter related  44.28 
 
 		 306 aa  170  2e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.724622  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3244  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  44.39 
 
 		 384 aa  170  3e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.290922  normal  0.910388 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1746  ABC transporter related  44.24 
 
 		 333 aa  169  3e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0301  putative spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  40.43 
 
 		 355 aa  169  3e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00163011  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1486  ABC transporter related  43.17 
 
 		 319 aa  169  3e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1084  ABC transporter related  43.84 
 
 		 319 aa  169  3e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1645  ABC transporter related  45.23 
 
 		 253 aa  169  3e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1564  ABC transporter related  43.84 
 
 		 319 aa  169  3e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1428  ABC transporter related  45.77 
 
 		 267 aa  169  4e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.250833  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0327  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein, putative  40.43 
 
 		 355 aa  169  4e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.100504  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4886  ABC transporter related  43.28 
 
 		 282 aa  169  4e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.188443  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1465  ABC transporter related  43.17 
 
 		 319 aa  169  4e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.08781  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4184  ABC transporter related  50 
 
 		 283 aa  169  5e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.378272  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3479  sulphate transport system permease protein 1  40.83 
 
 		 343 aa  169  5e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3492  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  40.83 
 
 		 343 aa  169  5e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.993193  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3542  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  40.83 
 
 		 343 aa  169  5e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3670  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  43.58 
 
 		 373 aa  169  6e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2474  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40.37 
 
 		 353 aa  168  6e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4114  ABC transporter related  46 
 
 		 273 aa  168  6e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.406402  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0513  ABC transporter related  38.11 
 
 		 254 aa  168  6e-41  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4252  ABC transporter related  46 
 
 		 273 aa  168  6e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0391855  normal  0.0823186 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0218  ABC transporter related  44 
 
 		 251 aa  168  7e-41  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1952  ABC transporter related  44.65 
 
 		 382 aa  168  8e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.647045 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1788  ABC transporter related  43.43 
 
 		 303 aa  168  9e-41  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1540  ABC transporter related  43.38 
 
 		 318 aa  167  1e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0499832  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1932  ABC transporter related  44.39 
 
 		 382 aa  167  1e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0195576 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2128  ABC transporter related  44.29 
 
 		 284 aa  167  1e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.249776 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>