83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_3165 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_3165  ThiJ/PfpI domain-containing protein  100 
 
 
191 aa  377  1e-104  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3678  ThiJ/PfpI  44.38 
 
 
196 aa  106  2e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04597  DJ-1/PfpI family  37.85 
 
 
192 aa  103  2e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2564  ThiJ/PfpI domain protein  39.26 
 
 
241 aa  101  8e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.823422 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0353  ThiJ/PfpI family intracellular protease  34.36 
 
 
208 aa  91.3  7e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1843  ThiJ/PfpI domain protein  26.84 
 
 
190 aa  85.9  3e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4040  ThiJ/PfpI domain-containing protein  37.2 
 
 
204 aa  85.1  5e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00474505 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1842  ThiJ/PfpI domain-containing protein  33.13 
 
 
210 aa  85.1  6e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000198171  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2475  thiJ/pfpI family protein  31.52 
 
 
210 aa  84  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0918447  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2657  thiJ/pfpI family protein  31.52 
 
 
210 aa  84  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2402  ThiJ/PfpI family protein  31.52 
 
 
210 aa  84  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.247507  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2674  thiJ/pfpI family protein  31.52 
 
 
210 aa  84.3  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000490961 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2291  ThiJ/PfpI domain-containing protein  30.3 
 
 
210 aa  82.4  0.000000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000168089  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2690  thiJ/pfpI family protein  30.06 
 
 
210 aa  80.9  0.00000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0560939  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2761  intracellular protease, ThiJ/PfpI family  30.06 
 
 
210 aa  78.2  0.00000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000853116 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0808  hypothetical protein  33.56 
 
 
212 aa  78.6  0.00000000000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0613727 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1340  ThiJ/PfpI  33.93 
 
 
208 aa  78.2  0.00000000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0470836 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0569  ThiJ/PfpI domain protein  38.41 
 
 
212 aa  70.9  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2512  ThiJ/PfpI domain-containing protein  35.37 
 
 
210 aa  70.1  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0833  4-methyl-5(B-hydroxyethyl)-thiazole monophosphate biosynthesis protein  26.98 
 
 
196 aa  69.3  0.00000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.0000524755  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4072  ThiJ/PfpI domain protein  34.55 
 
 
202 aa  64.3  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2155  ThiJ/PfpI domain protein  35 
 
 
206 aa  62.8  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.663488 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3715  thiJ/pfpI family protein  29.34 
 
 
190 aa  60.5  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000105676  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3445  thiJ/pfpI family protein  29.34 
 
 
190 aa  60.5  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000555251  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3408  4-methyl-5(B-hydroxyethyl)-thiazole monophosphate biosynthesis enzyme  29.34 
 
 
190 aa  60.1  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000163373  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3357  4-methyl-5(B-hydroxyethyl)-thiazole monophosphate biosynthesis enzyme  28.74 
 
 
186 aa  59.3  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000501015  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3645  ThiJ/PfpI domain protein  33.53 
 
 
210 aa  58.9  0.00000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.415005 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1791  thiJ/pfpI family protein  27.75 
 
 
194 aa  58.2  0.00000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2324  DJ-1 family protein  27.33 
 
 
191 aa  57.8  0.0000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0174784  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3688  thiJ/pfpI family protein  28.74 
 
 
190 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000554437  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3342  ThiJ/PfpI domain-containing protein  28.74 
 
 
190 aa  57.4  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000897289  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0292  DJ-1 family protein  30.18 
 
 
194 aa  57.4  0.0000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00553138  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1648  thiJ/pfpI family protein  27.75 
 
 
194 aa  57.4  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1529  thiJ/pfpI family protein  27.75 
 
 
194 aa  57.4  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.695646  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1501  thiJ/PfpI family protein  27.17 
 
 
194 aa  56.6  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000524776  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2038  DJ-1 family protein  27.33 
 
 
191 aa  56.2  0.0000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3683  thiJ/pfpI family protein  28.14 
 
 
190 aa  55.8  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00698458  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1492  intracellular protease/amidase  27.17 
 
 
194 aa  56.2  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.882955  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1553  thiJ/pfpI family protein  26.26 
 
 
190 aa  53.9  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000454916  normal  0.0345603 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2579  ThiJ/PfpI  34.56 
 
 
202 aa  53.5  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3664  DJ-1/PfpI family protein  30.25 
 
 
151 aa  53.1  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3763  thiJ/pfpI family protein  26.26 
 
 
190 aa  52.4  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00017711  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2921  AraC family transcriptional regulator  29.13 
 
 
317 aa  50.4  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1834  ThiJ/PfpI domain-containing protein  30.2 
 
 
178 aa  49.7  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0104188  normal  0.837868 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0031  ThiJ/PfpI  27.69 
 
 
174 aa  48.9  0.00004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2090  ThiJ/PfpI domain protein  23.7 
 
 
192 aa  49.3  0.00004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.117884  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1009  DJ-1 family protein  30.82 
 
 
183 aa  48.5  0.00005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0047613  normal  0.605199 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2119  metal dependent phosphohydrolase  33.54 
 
 
388 aa  48.5  0.00005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0158071  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3148  ThiJ/PfpI domain protein  29.29 
 
 
229 aa  48.1  0.00007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3997  transcriptional regulator  36.84 
 
 
316 aa  47.4  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.564896  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3735  helix-turn-helix domain-containing protein  37.5 
 
 
343 aa  47  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.43988 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4030  transcriptional regulator, AraC family  37.5 
 
 
343 aa  46.6  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.364388 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0371  DJ-1 family protein  28.57 
 
 
181 aa  46.6  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00995133  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2566  DJ-1 family protein  31.97 
 
 
192 aa  46.6  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.290389  normal  0.0127226 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0803  DJ-1 family protein  29.68 
 
 
182 aa  45.4  0.0005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0946  DJ-1 family protein  27.81 
 
 
187 aa  44.7  0.0008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.892246  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2581  AraC family transcriptional regulator  25.18 
 
 
198 aa  44.7  0.0008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.898766  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1055  PfpI family intracellular peptidase  28.93 
 
 
201 aa  44.7  0.0009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0746176  normal  0.129007 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3990  transcriptional regulator, AraC family  36.25 
 
 
344 aa  44.3  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2562  ThiJ/PfpI domain protein  31.94 
 
 
198 aa  43.5  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2164  ThiJ/PfpI domain protein  23.31 
 
 
202 aa  43.1  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000571514 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1245  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  28.24 
 
 
284 aa  43.5  0.002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0468502  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1159  PfpI family intracellular peptidase  30.71 
 
 
167 aa  42.7  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.123312  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1101  DJ-1 family protein  29.38 
 
 
182 aa  42.7  0.003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2085  ThiJ/PfpI domain protein  29.17 
 
 
185 aa  42.4  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000308575 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1614  transcriptional regulator  28.36 
 
 
332 aa  42.4  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3112  ThiJ/PfpI domain protein  32.31 
 
 
321 aa  42.4  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.226454  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6451  ThiJ/PfpI domain-containing protein  31.61 
 
 
199 aa  42.4  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5062  transcriptional regulator, AraC family  34.52 
 
 
331 aa  42.4  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.652687  normal  0.0215007 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1314  ThiJ/PfpI domain-containing protein  29.17 
 
 
185 aa  42.4  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  2.02067e-17 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4697  transcriptional regulator  27.81 
 
 
331 aa  42  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.207414  normal  0.0598838 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1622  ThiJ/PfpI  37.5 
 
 
179 aa  42.4  0.005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.91793 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1586  transcriptional regulator  33.33 
 
 
333 aa  42  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5042  transcriptional regulator, AraC family  28.24 
 
 
332 aa  42  0.006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.363358  normal  0.505144 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1973  ThiJ/PfpI domain-containing protein  23.39 
 
 
189 aa  41.6  0.006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00863935  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5399  transcriptional regulator  29.25 
 
 
321 aa  41.6  0.007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.654414  hitchhiker  0.00149287 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0723  ThiJ/PfpI domain protein  29.7 
 
 
199 aa  41.6  0.007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00286561  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4536  AraC family transcriptional regulator  31.25 
 
 
334 aa  41.6  0.007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2320  ThiJ/PfpI domain-containing protein  31.25 
 
 
372 aa  41.6  0.007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00685318 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0920  AraC family transcriptional regulator  28.03 
 
 
334 aa  41.2  0.008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1578  PfpI family intracellular peptidase  28.1 
 
 
171 aa  41.6  0.008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.592224  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1523  DJ-1 family protein  28.32 
 
 
190 aa  41.6  0.008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3363  ThiJ/PfpI-family thiamine biogenesis protein  33 
 
 
192 aa  41.2  0.01  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>