More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_A3363 on replicon NC_010159
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010465  YPK_0981  ThiJ/PfpI domain-containing protein  99.48 
 
 
192 aa  390  1e-108  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3363  ThiJ/PfpI-family thiamine biogenesis protein  100 
 
 
192 aa  392  1e-108  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0928  DJ-1/PfpI family protein  98.96 
 
 
192 aa  387  1e-107  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2146  ThiJ/PfpI domain-containing protein  50.27 
 
 
185 aa  185  4e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  6.21104e-22 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2085  ThiJ/PfpI domain protein  50.27 
 
 
185 aa  184  5e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000308575 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1314  ThiJ/PfpI domain-containing protein  50.27 
 
 
185 aa  183  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  2.02067e-17 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0083  ThiJ/PfpI domain protein  49.73 
 
 
195 aa  183  2.0000000000000003e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0065  ThiJ/PfpI domain protein  48.66 
 
 
191 aa  182  4.0000000000000006e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1190  ThiJ/PfpI domain protein  49.73 
 
 
185 aa  180  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00457983  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2091  ThiJ/PfpI domain protein  48.89 
 
 
180 aa  178  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.616699  hitchhiker  3.51942e-22 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4150  ThiJ/PfpI domain protein  47.06 
 
 
191 aa  174  5e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4431  ThiJ/PfpI domain protein  47.06 
 
 
191 aa  171  3.9999999999999995e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2477  ThiJ/PfpI domain-containing protein  46.96 
 
 
185 aa  167  8e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0640  putative 4-methyl-5(b-hydroxyethyl)-thiazole monophosphate biosynthesis protein  35 
 
 
184 aa  111  6e-24  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.00127997  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0681  DJ-1 family protein  34.1 
 
 
203 aa  91.3  8e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.728078  normal  0.0428535 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0523  4-methyl-5(B-hydroxyethyl)-thiazole monophosphate biosynthesis enzyme  34.1 
 
 
203 aa  91.3  8e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.017348  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3081  DJ-1 family protein  32.81 
 
 
198 aa  89.7  2e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.713776  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3249  DJ-1 family protein  31.77 
 
 
196 aa  89.4  3e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3107  DJ-1 family protein  31.77 
 
 
196 aa  89.4  3e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2354  DJ-1 family protein  35.26 
 
 
184 aa  88.6  5e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0457203  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11290  DJ-1 family protein  31.03 
 
 
181 aa  87.4  1e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000017657  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3069  DJ-1 family protein  31.25 
 
 
196 aa  86.7  2e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1780  DJ-1  32.6 
 
 
185 aa  85.5  4e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0292  DJ-1 family protein  31.84 
 
 
194 aa  84  0.000000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00553138  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0509  DJ-1 family protein  31.14 
 
 
185 aa  84  0.000000000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2324  DJ-1 family protein  27.54 
 
 
191 aa  84  0.000000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0174784  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1523  DJ-1 family protein  29.79 
 
 
190 aa  83.2  0.000000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0510  DJ-1 family protein  32.74 
 
 
182 aa  83.6  0.000000000000002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  hitchhiker  0.000981591  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2038  DJ-1 family protein  27.54 
 
 
191 aa  82.8  0.000000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1245  4-methyl-5(B-hydroxyethyl)-thiazole monophosphate biosynthesis enzyme  31.33 
 
 
179 aa  83.2  0.000000000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0371  DJ-1 family protein  31.74 
 
 
181 aa  82.8  0.000000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00995133  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2774  DJ-1 family protein  31.55 
 
 
202 aa  82.4  0.000000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.543799 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0029  DJ-1  34.48 
 
 
184 aa  81.6  0.000000000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0946  DJ-1 family protein  32.18 
 
 
187 aa  81.6  0.000000000000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.892246  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0833  DJ-1 family protein  29.59 
 
 
183 aa  81.6  0.000000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.620178  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2034  DJ-1 family protein  31.21 
 
 
184 aa  81.3  0.000000000000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2019  DJ-1 family protein  33.53 
 
 
184 aa  81.3  0.000000000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.236764  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4036  DJ-1 family protein  30.18 
 
 
183 aa  81.3  0.000000000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0966  4-methyl-5(B-hydroxyethyl)-thiazole monophosphate biosynthesis protein  31.98 
 
 
182 aa  81.3  0.000000000000008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000883438  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2890  DJ-1 family protein  32.53 
 
 
196 aa  80.5  0.00000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3290  DJ-1 family protein  33.54 
 
 
184 aa  79.7  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0803  DJ-1 family protein  32.93 
 
 
182 aa  80.5  0.00000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2119  metal dependent phosphohydrolase  30.38 
 
 
388 aa  79.3  0.00000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0158071  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0634  ThiJ/PfpI family protein  30.64 
 
 
181 aa  78.6  0.00000000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.403728 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0891  DJ-1 family protein  29.76 
 
 
197 aa  78.6  0.00000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.915837  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1101  DJ-1 family protein  30.06 
 
 
182 aa  78.2  0.00000000000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1009  DJ-1 family protein  30.73 
 
 
183 aa  77.4  0.0000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0047613  normal  0.605199 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1034  DJ-1 family protein  28.12 
 
 
196 aa  77.4  0.0000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.463185  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3277  DJ-1 family protein  28.65 
 
 
196 aa  77  0.0000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4895  DJ-1  29.76 
 
 
183 aa  76.6  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0481  DJ-1 family protein  30.41 
 
 
183 aa  75.9  0.0000000000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.476054  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2566  DJ-1 family protein  33.15 
 
 
192 aa  75.9  0.0000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.290389  normal  0.0127226 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_32791  predicted protein  29.65 
 
 
191 aa  75.1  0.0000000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0941  protein ThiJ  27.98 
 
 
196 aa  75.5  0.0000000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.963617  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1118  DJ-1 family protein  27.22 
 
 
190 aa  75.1  0.0000000000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1082  DJ-1 family protein  29.48 
 
 
196 aa  73.9  0.000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000871553 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3185  DJ-1 family protein  27.6 
 
 
196 aa  73.9  0.000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.447101  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1057  DJ-1 family protein  28.82 
 
 
183 aa  74.3  0.000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000197778  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3209  DJ-1 family protein  27.6 
 
 
196 aa  73.9  0.000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000549408 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1845  putative protease  30.54 
 
 
181 aa  72.8  0.000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00372  hypothetical protein  27.08 
 
 
196 aa  71.6  0.000000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0456  DJ-1 family protein  27.08 
 
 
196 aa  71.6  0.000000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0460  DJ-1 family protein  27.08 
 
 
196 aa  71.6  0.000000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0496  DJ-1 family protein  27.08 
 
 
196 aa  71.6  0.000000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00376  hypothetical protein  27.08 
 
 
196 aa  71.6  0.000000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0346  DJ-1 family protein  27.08 
 
 
196 aa  71.6  0.000000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0508  DJ-1 family protein  27.08 
 
 
196 aa  71.2  0.000000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.44518  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002695  4-methyl-5(B-hydroxyethyl)-thiazol monophosphate biosynthesis enzyme  27.91 
 
 
199 aa  70.9  0.00000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03289  hypothetical protein  27.98 
 
 
199 aa  70.5  0.00000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1208  DJ-1 family protein  27.91 
 
 
188 aa  70.5  0.00000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl263  putative intracellular protease/amidase  26.01 
 
 
181 aa  69.7  0.00000000002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  1.04249e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2032  intracellular protease, PfpI family  30.13 
 
 
245 aa  69.7  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1574  intracellular protease, PfpI family  30.13 
 
 
241 aa  69.7  0.00000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_127  DJ-1, 4-methyl-5(b-hydroxyethyl)-thiazole monophosphate biosynthesis protein  29.38 
 
 
180 aa  68.9  0.00000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10413  proteinase  26.58 
 
 
193 aa  68.9  0.00000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3012  PfpI family intracellular peptidase  29.68 
 
 
179 aa  68.6  0.00000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.880979 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1633  protein ThiJ  28.07 
 
 
182 aa  67.8  0.00000000009  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0251  DJ-1 family protein  28.3 
 
 
180 aa  67  0.0000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0118  DJ-1 family protein  29.38 
 
 
180 aa  66.2  0.0000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1238  4-methyl-5(beta-hydroxyethyl)-thiazol monophosphate biosynthesis protein-like  33.53 
 
 
189 aa  65.9  0.0000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3029  PfpI family intracellular peptidase  30.32 
 
 
179 aa  65.9  0.0000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0326  4-methyl-5(B-hydroxyethyl)-thiazole monophosphate biosynthesis protein  29.21 
 
 
194 aa  65.5  0.0000000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000260198  hitchhiker  6.98835e-17 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6331  intracellular protease, PfpI family  30.07 
 
 
185 aa  65.1  0.0000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.219565  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2725  protease PfpI  29.68 
 
 
180 aa  64.7  0.0000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4470  intracellular protease, PfpI family  26.11 
 
 
189 aa  63.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0472  DJ-1 family protein  29.17 
 
 
196 aa  64.3  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6335  PfpI family intracellular peptidase  29.87 
 
 
182 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.31961  normal  0.116394 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2603  PfpI family intracellular peptidase  28.39 
 
 
180 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.241839 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3874  DJ-1 family protein  27.37 
 
 
183 aa  62.8  0.000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3430  PfpI family intracellular peptidase  26.58 
 
 
181 aa  62.8  0.000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0843  ThiJ/PfpI domain protein  28.33 
 
 
183 aa  62.4  0.000000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0480  DJ-1 family protein  28.12 
 
 
196 aa  62.4  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.757447  normal  0.338171 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5605  PfpI family intracellular peptidase  29.87 
 
 
182 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.77662 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4290  PfpI family intracellular peptidase  27.5 
 
 
182 aa  62.4  0.000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.266968  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0894  4-methyl-5(beta-hydroxyethyl)-thiazole monophosphate synthesis protein  28.65 
 
 
188 aa  62  0.000000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.022908  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2955  peptidase C56, PfpI  29.49 
 
 
204 aa  62  0.000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0535  DJ-1 family protein  28.57 
 
 
196 aa  61.6  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.865123  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0474  DJ-1 family protein  27.6 
 
 
196 aa  62  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6078  PfpI family intracellular peptidase  28.76 
 
 
182 aa  61.6  0.000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.87309  normal  0.0714327 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1341  peptidase C56, PfpI  28.57 
 
 
182 aa  61.2  0.000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.927736  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>