82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_2316 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_2316  hypothetical protein  100 
 
 
130 aa  255  1e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.865879 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1099  protein of unknown function DUF305  41.05 
 
 
160 aa  67.4  0.00000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.115444  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1027  protein of unknown function DUF305  38.28 
 
 
123 aa  64.3  0.0000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4129  protein of unknown function DUF305  37.4 
 
 
125 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.933838  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6075  protein of unknown function DUF305  37.5 
 
 
137 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.69008  normal  0.152537 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2536  hypothetical protein  38.06 
 
 
133 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.608732  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2575  hypothetical protein  38.35 
 
 
123 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0843755  normal  0.521427 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2299  hypothetical protein  35.94 
 
 
131 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.502645  normal  0.300694 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0179  hypothetical protein  39.33 
 
 
142 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0473864  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5614  protein of unknown function DUF305  39.74 
 
 
135 aa  57  0.00000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0506  protein of unknown function DUF305  35.05 
 
 
119 aa  55.5  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0184859 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5874  protein of unknown function DUF305  40 
 
 
143 aa  55.5  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0461  protein of unknown function DUF305  36.46 
 
 
119 aa  56.2  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.607138  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0541  hypothetical protein  38.67 
 
 
120 aa  55.5  0.0000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2045  hypothetical protein  35.48 
 
 
132 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.928225  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0997  protein of unknown function DUF305  37.66 
 
 
148 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.495486  normal  0.061691 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7165  protein of unknown function DUF305  39.71 
 
 
143 aa  53.5  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.277418  normal  0.663487 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3868  hypothetical protein  31.25 
 
 
134 aa  53.1  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5806  hypothetical protein  34.69 
 
 
122 aa  52  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0926  hypothetical protein  45.28 
 
 
117 aa  50.4  0.000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.984322  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3772  hypothetical protein  41.67 
 
 
100 aa  50.4  0.000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.697679  normal 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0071  hypothetical protein  40.98 
 
 
136 aa  49.7  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.316359 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0057  hypothetical protein  33.04 
 
 
208 aa  50.1  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5736  protein of unknown function DUF305  41.03 
 
 
132 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.470482 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3056  protein of unknown function DUF305  28.57 
 
 
128 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1836  hypothetical protein  42.59 
 
 
246 aa  48.5  0.00003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0521181  normal  0.479841 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6904  protein of unknown function DUF305  39.68 
 
 
237 aa  48.9  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.147564  normal  0.887388 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3242  hypothetical protein  28.68 
 
 
134 aa  48.5  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3430  hypothetical protein  35.78 
 
 
116 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3230  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  32.89 
 
 
517 aa  48.1  0.00004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.476229  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9856  hypothetical protein  45.76 
 
 
142 aa  47.8  0.00005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1535  hypothetical protein  32.86 
 
 
113 aa  47.8  0.00005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.619429  normal  0.733742 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3895  hypothetical protein  40.62 
 
 
134 aa  47.8  0.00005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0137  hypothetical protein  39.22 
 
 
202 aa  47.8  0.00006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0732771 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0156  hypothetical protein  39.22 
 
 
202 aa  47.4  0.00007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.908882  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0147  hypothetical protein  39.22 
 
 
202 aa  47.4  0.00007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.404622  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2947  protein of unknown function DUF305  33.33 
 
 
128 aa  47  0.00008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6297  hypothetical protein  25.78 
 
 
131 aa  46.6  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.21149  normal  0.389023 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2666  hypothetical protein  47.37 
 
 
127 aa  46.2  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.499995 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0261  hypothetical protein  47.37 
 
 
127 aa  46.2  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.188703  normal  0.0101728 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1517  hypothetical protein  40 
 
 
263 aa  46.2  0.0001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0547298  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6564  hypothetical protein  37.5 
 
 
130 aa  46.6  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1338  hypothetical protein  41.1 
 
 
152 aa  46.6  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.031335  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2567  hypothetical protein  29.46 
 
 
206 aa  46.6  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4189  hypothetical protein  39.34 
 
 
195 aa  47  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.314897  normal  0.043987 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3538  protein of unknown function DUF305  30.59 
 
 
205 aa  46.2  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.396776 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0132  protein of unknown function DUF305  36.67 
 
 
192 aa  46.2  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.857037  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6278  hypothetical protein  36.05 
 
 
130 aa  45.4  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00531992 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0108  protein of unknown function DUF305  28.47 
 
 
134 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.937647 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0285  hypothetical protein  37 
 
 
279 aa  45.8  0.0002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6148  hypothetical protein  28.68 
 
 
127 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.137676  normal  0.19662 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2829  hypothetical protein  27.91 
 
 
128 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.137612 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4535  hypothetical protein  44.07 
 
 
98 aa  45.8  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.858749  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3044  protein of unknown function DUF305  45.83 
 
 
230 aa  45.1  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.22024  normal  0.753211 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6259  hypothetical protein  36.21 
 
 
164 aa  44.7  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.510981 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1101  protein of unknown function DUF305  31.43 
 
 
132 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.3981  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1985  hypothetical protein  33.33 
 
 
128 aa  44.7  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.448564  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2059  protein of unknown function DUF305  42 
 
 
208 aa  44.7  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.243739  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4562  hypothetical protein  45.61 
 
 
91 aa  45.1  0.0004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3796  hypothetical protein  30.43 
 
 
151 aa  44.7  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0305  hypothetical protein  35 
 
 
192 aa  44.3  0.0006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3873  hypothetical protein  41.79 
 
 
147 aa  44.3  0.0006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1571  conserved hypothetical protein (DUF305 domain protein)  27.56 
 
 
206 aa  43.9  0.0008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5510  hypothetical protein  35 
 
 
130 aa  42.7  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.563471  normal  0.269299 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0401  hypothetical protein  41.51 
 
 
126 aa  43.5  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0681518 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2580  protein of unknown function DUF305  32.71 
 
 
224 aa  43.5  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5398  hypothetical protein  39.62 
 
 
152 aa  42.7  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4008  hypothetical protein  32.17 
 
 
197 aa  42.4  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4268  protein of unknown function DUF305  38.6 
 
 
227 aa  42.7  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.342211  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2579  hypothetical protein  33.33 
 
 
202 aa  42.7  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0406  hypothetical protein  35 
 
 
141 aa  42  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.1733  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6657  protein of unknown function DUF305  35.71 
 
 
209 aa  41.6  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.50824 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1876  hypothetical protein  35 
 
 
141 aa  41.6  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.257011  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0139  protein of unknown function DUF305  39.53 
 
 
237 aa  41.6  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1967  hypothetical protein  35 
 
 
141 aa  41.6  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.619841  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0092  protein of unknown function DUF305  29.51 
 
 
139 aa  41.6  0.004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.62579 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4586  hypothetical protein  26.5 
 
 
265 aa  40.8  0.006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0312  hypothetical protein  32.58 
 
 
250 aa  40.8  0.006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.153905  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3396  protein of unknown function DUF305  40 
 
 
237 aa  40.8  0.007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.886047  normal  0.773197 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4415  protein of unknown function DUF305  37.66 
 
 
202 aa  40.4  0.007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.126861  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0885  protein of unknown function DUF305  37.25 
 
 
203 aa  40.8  0.007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.309526 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2129  protein of unknown function DUF305  34.78 
 
 
223 aa  40  0.01  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000673647  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>