146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_1715 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_1715  hypothetical protein  100 
 
 		 120 aa  241  1.9999999999999999e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0128981  normal  0.195089 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2493  cytochrome c(mono-heme type)  43.24 
 
 		 120 aa  102  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0117122  normal  0.45598 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70340  putative cytochrome c(mono-heme type)  48.78 
 
 		 129 aa  89.4  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1741  cytochrome c  51.76 
 
 		 123 aa  87  9e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0095  cytochrome c family protein  42.86 
 
 		 129 aa  84  7e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6104  putative cytochrome c(mono-heme type)  43.48 
 
 		 127 aa  80.9  0.000000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.415894  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00484  cb-type cytochrome oxidase subunit III  50 
 
 		 131 aa  74.3  0.0000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5103  cytochrome c-type protein  46.67 
 
 		 100 aa  72.8  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.100412 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0180  cytochrome c, class I  42.25 
 
 		 97 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.245077  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3726  cytochrome c, class I  42.25 
 
 		 99 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.334938  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0461  cytochrome c, class I  38.54 
 
 		 137 aa  70.9  0.000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.943206  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0140  cytochrome c-type protein  44.59 
 
 		 100 aa  70.5  0.000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0125  cytochrome c-type protein  44.59 
 
 		 100 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0350268  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0170  cytochrome c, class I  38.64 
 
 		 145 aa  69.7  0.00000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0142  cytochrome c5-like protein  44.59 
 
 		 100 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.228578  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0229  cytochrome c class I  40.85 
 
 		 99 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000537114  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3568  cytochrome c, class I  41.43 
 
 		 97 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.199847  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4023  cytochrome c class I  40.85 
 
 		 99 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000136046  hitchhiker  0.0000237935 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0229  cytochrome c class I  40.85 
 
 		 99 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000024603  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0216  cytochrome c class I  39.44 
 
 		 97 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0309264  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0246  cytochrome c  40.85 
 
 		 97 aa  68.2  0.00000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00117918  normal  0.0109237 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0191  cytochrome c, class I  42.25 
 
 		 97 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000235852  hitchhiker  0.00582407 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3332  cytochrome c-type protein  40.96 
 
 		 96 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001977  cytochrome c5  44.87 
 
 		 137 aa  68.2  0.00000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000375428  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0232  cytochrome c, class I  39.44 
 
 		 99 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00113447  unclonable  0.0000000000238576 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0227  cytochrome c, class I  39.44 
 
 		 99 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.495989  hitchhiker  0.00493696 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0232  cytochrome c, class I  39.44 
 
 		 99 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0199425  unclonable  0.0000000000331566 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0232  cytochrome c class I  39.44 
 
 		 99 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000496502  normal  0.108907 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2556  cytochrome c5  44.3 
 
 		 135 aa  68.2  0.00000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000740682  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0264  cytochrome c  39.44 
 
 		 99 aa  67.4  0.00000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4286  cytochrome c, class I  42.25 
 
 		 97 aa  67.4  0.00000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000419984 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4658  cytochrome c, class I  40.85 
 
 		 97 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000774786 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0093  cytochrome c  41.03 
 
 		 135 aa  65.1  0.0000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0144946  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0054  cytochrome c-type protein  42.25 
 
 		 90 aa  63.5  0.0000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.293458 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2849  cytochrome c family protein  39.44 
 
 		 95 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.0000128252  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0205  cytochrome c, class I  41.1 
 
 		 185 aa  61.6  0.000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.641753  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0183  cellulose binding, type IV  40 
 
 		 134 aa  61.2  0.000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.314607  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3197  cytochrome c, class I  41.46 
 
 		 128 aa  60.5  0.000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.657316  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0156  cytochrome c5-like protein  38.57 
 
 		 96 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3650  cytochrome c class I  39.13 
 
 		 112 aa  58.9  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6290  putative cytochrome  36.99 
 
 		 97 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.594105  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1398  putative cytochrome c-type protein  41.1 
 
 		 161 aa  58.5  0.00000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0906233  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72470  putative cytochrome  36.99 
 
 		 97 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.240625  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6074  cytochrome c5  39.73 
 
 		 142 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1247  Caa(3)-type oxidase, subunit IV  28.57 
 
 		 230 aa  57.8  0.00000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1062  cytochrome c class I  38.75 
 
 		 159 aa  57.8  0.00000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69970  cytochrome c5  39.73 
 
 		 136 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1141  cytochrome c, class I  38.75 
 
 		 159 aa  57.8  0.00000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.828692  normal  0.616371 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2000  cytochrome c, class I  37.68 
 
 		 192 aa  57  0.00000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0804521  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2981  cytochrome c-type protein  37.8 
 
 		 95 aa  57  0.00000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0260  cytochrome c, class I  37.33 
 
 		 111 aa  56.6  0.0000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0072  cytochrome c, class I  35.71 
 
 		 136 aa  56.2  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.663637  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0146  cytochrome c5  37.14 
 
 		 266 aa  55.5  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.821024 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0214  cytochrome c class I  37.5 
 
 		 144 aa  55.8  0.0000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3091  cytochrome c class I  38.67 
 
 		 273 aa  55.5  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.994793  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0941  hypothetical protein  33.67 
 
 		 135 aa  54.3  0.0000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0654  cytochrome c class I  36.36 
 
 		 148 aa  54.3  0.0000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0459  cytochrome c, class I  36.99 
 
 		 225 aa  53.9  0.0000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0133127  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0971  hypothetical protein  32.65 
 
 		 135 aa  53.5  0.0000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0286  putative cytochrome c, class I  38.36 
 
 		 111 aa  53.1  0.000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.721199 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2963  hypothetical protein  33.75 
 
 		 537 aa  52.8  0.000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2812  hypothetical protein  33.75 
 
 		 537 aa  52.8  0.000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0425  cytochrome C, class I  45.28 
 
 		 223 aa  52.4  0.000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.501458  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3859  cytochrome c5  36.23 
 
 		 206 aa  52.8  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00000764521  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00078  cytochrome c5  37.14 
 
 		 135 aa  52.4  0.000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4918  putative cytochrome c family protein  37.04 
 
 		 137 aa  52.4  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.840892  hitchhiker  0.00914524 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0605  cytochrome c, class I  43.75 
 
 		 216 aa  52.8  0.000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00227735  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5319  cytochrome c5  36.99 
 
 		 140 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.241325 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0203  cytochrome c5  38.36 
 
 		 140 aa  52  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.768078  hitchhiker  0.00155687 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0106  cytochrome c5  37.14 
 
 		 107 aa  51.2  0.000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02091  lipoprotein  40.26 
 
 		 135 aa  50.8  0.000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2463  cytochrome c, class I  36.47 
 
 		 140 aa  50.4  0.000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.480155  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0249  cytochrome c5-like protein  36.99 
 
 		 136 aa  50.1  0.000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47940  cytochrome c5 protein  42.65 
 
 		 134 aa  50.1  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3367  cytochrome c class I  43.33 
 
 		 297 aa  49.7  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3020  cytochrome c class I  43.33 
 
 		 298 aa  50.1  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.731004 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4834  cytochrome c class I  46.97 
 
 		 202 aa  50.1  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.62683  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5177  cytochrome c5  35.62 
 
 		 140 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.129919  normal  0.155967 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0362  cytochrome c5-like protein  36.23 
 
 		 195 aa  50.1  0.00001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000104978  hitchhiker  0.00044408 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5267  cytochrome c5  35.62 
 
 		 121 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2185  putative lipoprotein  32.17 
 
 		 128 aa  49.3  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0239  cytochrome c5  36.76 
 
 		 107 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0153  cytochrome c-555, membrane-bound  33.33 
 
 		 131 aa  48.5  0.00003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000000170393  normal  0.590725 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0233  cytochrome c, class I  36.62 
 
 		 171 aa  48.5  0.00003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0215738  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5522  cytochrome c5  34.25 
 
 		 138 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.224479 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2786  hypothetical protein  34.29 
 
 		 142 aa  47.8  0.00005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2655  hypothetical protein  34.29 
 
 		 142 aa  47.8  0.00005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1443  cytochrome c-555, membrane-bound  33.33 
 
 		 116 aa  47.4  0.00006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000000888982  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1890  hypothetical protein  35.9 
 
 		 102 aa  47.4  0.00006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0213  hypothetical protein  35.21 
 
 		 173 aa  47.4  0.00007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000412444  hitchhiker  0.00201322 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3877  cytochrome c, class I  42.59 
 
 		 147 aa  47.4  0.00007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3876  cytochrome c class I  37.14 
 
 		 300 aa  47  0.00008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0996  cytochrome c class I  37.14 
 
 		 103 aa  47.4  0.00008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2304  cytochrome c class I  32.43 
 
 		 107 aa  47.4  0.00008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000896467  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2059  diheme cytochrome c SoxD  30.43 
 
 		 382 aa  47  0.00009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173988  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3084  hypothetical protein  40 
 
 		 294 aa  46.6  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.286797  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2318  cytochrome c family protein  29.27 
 
 		 164 aa  46.2  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0213  cytochrome c class I  34.25 
 
 		 111 aa  46.6  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2262  cytochrome c family protein  29.27 
 
 		 164 aa  46.2  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2122  cytochrome c family protein  29.27 
 
 		 164 aa  46.2  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>