50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA2185 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA2185  putative lipoprotein  100 
 
 		 128 aa  269  1e-71  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0948  cytochrome c family protein  38.14 
 
 		 123 aa  81.3  0.000000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2181  cytochrome c family protein  40.19 
 
 		 270 aa  77.4  0.00000000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.60708  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0170  cytochrome c, class I  37.18 
 
 		 145 aa  55.5  0.0000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2493  cytochrome c(mono-heme type)  32.38 
 
 		 120 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0117122  normal  0.45598 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0605  cytochrome c, class I  30.86 
 
 		 216 aa  49.3  0.00002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00227735  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1715  hypothetical protein  32.17 
 
 		 120 aa  49.3  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0128981  normal  0.195089 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0093  cytochrome c  36.84 
 
 		 135 aa  48.9  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0144946  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3877  cytochrome c, class I  28.21 
 
 		 147 aa  48.5  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0459  cytochrome c, class I  29.73 
 
 		 225 aa  48.5  0.00003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0133127  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0425  cytochrome C, class I  28.95 
 
 		 223 aa  48.1  0.00004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.501458  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0146  cytochrome c5  32.89 
 
 		 266 aa  47.8  0.00005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.821024 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1443  cytochrome c-555, membrane-bound  33.71 
 
 		 116 aa  47.4  0.00007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000000888982  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0461  cytochrome c, class I  34.67 
 
 		 137 aa  47  0.00009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.943206  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2000  cytochrome c, class I  24.72 
 
 		 192 aa  46.6  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0804521  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0153  cytochrome c-555, membrane-bound  29.27 
 
 		 131 aa  46.6  0.0001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000000170393  normal  0.590725 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0214  cytochrome c class I  30.95 
 
 		 144 aa  46.6  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00484  cb-type cytochrome oxidase subunit III  33.33 
 
 		 131 aa  46.6  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0654  cytochrome c class I  30.86 
 
 		 148 aa  45.1  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2556  cytochrome c5  31.08 
 
 		 135 aa  45.4  0.0003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000740682  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2318  cytochrome c family protein  29.63 
 
 		 164 aa  45.4  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001977  cytochrome c5  32.43 
 
 		 137 aa  44.3  0.0005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000375428  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3091  cytochrome c class I  38.6 
 
 		 273 aa  44.3  0.0006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.994793  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0988  cytochrome c family protein  30.38 
 
 		 164 aa  44.3  0.0006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.219411  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2262  cytochrome c family protein  30.38 
 
 		 164 aa  43.9  0.0007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2122  cytochrome c family protein  30.38 
 
 		 164 aa  43.9  0.0007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2067  cytochrome c family protein  30.38 
 
 		 164 aa  43.9  0.0007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.272994  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1247  Caa(3)-type oxidase, subunit IV  27.72 
 
 		 230 aa  43.1  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0213  hypothetical protein  26.67 
 
 		 173 aa  43.5  0.001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000412444  hitchhiker  0.00201322 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2463  cytochrome c, class I  30.49 
 
 		 140 aa  43.5  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.480155  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0183  cellulose binding, type IV  33.33 
 
 		 134 aa  43.1  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.314607  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0147  cytochrome c class I  30.58 
 
 		 297 aa  42  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.206313  normal  0.547254 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0164  cytochrome c class I  29.55 
 
 		 295 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0150  cytochrome c class I  30.58 
 
 		 302 aa  42.7  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0149  cytochrome c class I  37.14 
 
 		 287 aa  42.4  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.481052  normal  0.118184 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0151  cytochrome c, class I  29.55 
 
 		 295 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0138  cytochrome c, class I  30.58 
 
 		 302 aa  42.7  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2904  cytochrome c, class I  29.55 
 
 		 295 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0233  cytochrome c, class I  27.78 
 
 		 171 aa  42.7  0.002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0215738  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3859  cytochrome c5  31.08 
 
 		 206 aa  42.7  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00000764521  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70340  putative cytochrome c(mono-heme type)  33.8 
 
 		 129 aa  41.6  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0050  cytochrome c class I  32.93 
 
 		 232 aa  40.8  0.006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0205  cytochrome c, class I  33.82 
 
 		 185 aa  40.8  0.006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.641753  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3330  cytochrome c, class I  32.53 
 
 		 296 aa  40.8  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.606623  normal  0.724551 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4058  cytochrome c class I  30 
 
 		 140 aa  40.4  0.008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.435905  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1398  putative cytochrome c-type protein  30.38 
 
 		 161 aa  40.4  0.008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0906233  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4170  cytochrome c class I  30 
 
 		 140 aa  40.4  0.008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0180  cytochrome c, class I  29.33 
 
 		 97 aa  40.4  0.009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.245077  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02091  lipoprotein  30 
 
 		 135 aa  40.4  0.009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0246  cytochrome c  29.33 
 
 		 97 aa  40  0.01  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00117918  normal  0.0109237 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>