35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_2573 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_2573  hypothetical protein  100 
 
 
249 aa  506  9.999999999999999e-143  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2985  hypothetical protein  41.18 
 
 
249 aa  183  3e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0275079  hitchhiker  0.000737309 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2922  hypothetical protein  40.68 
 
 
265 aa  173  2.9999999999999996e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0126105  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3331  hypothetical protein  40.77 
 
 
249 aa  163  3e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1011  hypothetical protein  40.52 
 
 
249 aa  163  3e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.823882  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0690  hypothetical protein  29.07 
 
 
241 aa  95.1  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2061  hypothetical protein  38.41 
 
 
356 aa  70.9  0.00000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000264827  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2157  fibronectin, type III domain-containing protein  30.11 
 
 
1141 aa  64.7  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.445714  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1197  chemotaxis protein histidine kinase  35.35 
 
 
887 aa  53.5  0.000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0132818  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1307  Allergen V5/Tpx-1 family protein  34.65 
 
 
440 aa  52.4  0.000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000813036  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2742  CheC domain protein  30.47 
 
 
288 aa  50.1  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00482165  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0090  type II secretion system protein E  43.94 
 
 
566 aa  50.1  0.00004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0090  type II secretion system protein E  42.42 
 
 
567 aa  49.7  0.00005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000779667  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4206  type II secretion system protein E  49.15 
 
 
621 aa  49.3  0.00006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0372  response regulator receiver protein  32.85 
 
 
340 aa  49.3  0.00006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.463682  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1055  type II secretion system protein E  38.67 
 
 
559 aa  47  0.0003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0268645  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0378  pili biogenesis ATPase  29.47 
 
 
583 aa  47  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1554  type II secretion system protein E  43.94 
 
 
553 aa  46.2  0.0004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.185461 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0508  bacteriophage N4 adsorption protein B  41.67 
 
 
698 aa  45.4  0.0009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.759606  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1571  type II secretion system protein E  42.86 
 
 
587 aa  45.4  0.0009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00763489  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1884  type II secretion system protein E  40.85 
 
 
570 aa  45.1  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000626903  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2570  secretion system protein E  38.46 
 
 
562 aa  43.5  0.003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1696  FHA domain-containing protein  34.85 
 
 
185 aa  43.5  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1455  putative CheA signal transduction histidine kinases  31.46 
 
 
927 aa  43.5  0.003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3397  hypothetical protein  42.86 
 
 
226 aa  43.9  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1620  type II secretion system protein E  44.07 
 
 
616 aa  43.5  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1022  type II secretion system protein E  42.19 
 
 
554 aa  43.5  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0263  type II secretion system protein E  43.75 
 
 
891 aa  42.7  0.005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.198237  normal  0.68743 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2321  FHA domain-containing protein  35.64 
 
 
185 aa  42.4  0.008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.380377 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0949  type II secretion system protein E  34.33 
 
 
885 aa  42  0.008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.14742  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2969  type II secretory pathway ATPase PulE/Tfp pilus assembly pathway ATPase PilB  34.13 
 
 
841 aa  42  0.009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.515104  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0138  type II secretion system protein E  38.46 
 
 
569 aa  42  0.01  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4695  bacteriophage N4 adsorption protein B  40 
 
 
703 aa  42  0.01  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0225348  normal  0.13115 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3618  bacteriophage N4 adsorption protein B  40 
 
 
703 aa  42  0.01  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0888  type II secretion system protein E  41.94 
 
 
553 aa  42  0.01  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>