More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_1628 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_2091  NADH dehydrogenase (quinone)  81.82 
 
 
374 aa  647    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2992  NADH dehydrogenase (quinone)  81.28 
 
 
374 aa  648    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1628  NADH dehydrogenase I, D subunit  100 
 
 
369 aa  750    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.963572  normal  0.66391 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4983  NADH dehydrogenase (quinone)  74.59 
 
 
370 aa  593  1e-168  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0173613  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0926  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, D subunit  59.24 
 
 
367 aa  470  1.0000000000000001e-131  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_797  NADH:quinone oxidoreductase 49 kD subunit 7  59.24 
 
 
367 aa  471  1.0000000000000001e-131  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0810  NADH dehydrogenase I, D subunit  59.24 
 
 
367 aa  468  1.0000000000000001e-131  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1208  NADH dehydrogenase subunit D  52.45 
 
 
367 aa  397  1e-109  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000066562  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0980  NADH dehydrogenase subunit D  52.72 
 
 
371 aa  393  1e-108  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2043  NADH dehydrogenase subunit D  51.5 
 
 
366 aa  387  1e-106  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.004112  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1541  NADH dehydrogenase I, D subunit  48.21 
 
 
400 aa  371  1e-102  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1745  NADH dehydrogenase subunit D  44.98 
 
 
417 aa  372  1e-102  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5147  NADH dehydrogenase subunit D  47.55 
 
 
366 aa  368  1e-101  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1145  NADH dehydrogenase subunit D  45.69 
 
 
417 aa  371  1e-101  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0197205  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5388  NADH dehydrogenase subunit D  47.55 
 
 
366 aa  368  1e-101  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.9747399999999995e-20 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5539  NADH dehydrogenase subunit D  47.55 
 
 
366 aa  368  1e-101  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1266  NADH dehydrogenase subunit D  44.98 
 
 
417 aa  368  1e-101  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.26222 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5422  NADH dehydrogenase subunit D  48.27 
 
 
366 aa  366  1e-100  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4979  NADH dehydrogenase subunit D  48 
 
 
366 aa  365  1e-100  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4241  NADH dehydrogenase I, D subunit  45.27 
 
 
390 aa  367  1e-100  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0411944  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5095  NADH dehydrogenase subunit D  46.74 
 
 
366 aa  365  1e-100  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5532  NADH dehydrogenase subunit D  48.27 
 
 
366 aa  367  1e-100  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00277354 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1496  NADH dehydrogenase subunit D  45.22 
 
 
417 aa  365  1e-100  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.709173  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2058  NADH dehydrogenase subunit D  45.45 
 
 
417 aa  368  1e-100  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3816  NADH dehydrogenase subunit D  47.01 
 
 
366 aa  367  1e-100  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1961  NADH dehydrogenase I, D subunit  45.69 
 
 
417 aa  366  1e-100  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00447389  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5473  NADH dehydrogenase subunit D  48.27 
 
 
366 aa  367  1e-100  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5418  NADH dehydrogenase subunit D  48.27 
 
 
366 aa  367  1e-100  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1504  NADH dehydrogenase subunit D  45.45 
 
 
417 aa  365  1e-100  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00434712 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2059  NADH dehydrogenase subunit D  45.45 
 
 
417 aa  364  1e-99  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.102892  normal  0.0817308 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5177  NADH dehydrogenase subunit D  44.74 
 
 
417 aa  364  1e-99  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.752973  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1064  NADH dehydrogenase subunit D  45.45 
 
 
417 aa  364  1e-99  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.240648  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4997  NADH dehydrogenase subunit D  48 
 
 
366 aa  364  2e-99  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0820  NADH dehydrogenase subunit D  44.74 
 
 
417 aa  363  2e-99  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.205502  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1406  NADH dehydrogenase subunit D  44.98 
 
 
417 aa  363  2e-99  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.564759  normal  0.621774 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2211  NADH dehydrogenase subunit D  44.98 
 
 
417 aa  363  3e-99  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.518232 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2284  NADH dehydrogenase subunit D  45.93 
 
 
417 aa  363  3e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0248166  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1888  NADH dehydrogenase subunit D  44.98 
 
 
417 aa  363  3e-99  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.187802  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5574  NADH dehydrogenase subunit D  45.69 
 
 
417 aa  363  4e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0121919  normal  0.276957 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0875  NADH dehydrogenase subunit D  44.74 
 
 
417 aa  362  4e-99  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.334972  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1634  NADH dehydrogenase subunit D  45.69 
 
 
417 aa  362  4e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.166476  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2246  NADH dehydrogenase subunit D  45.69 
 
 
417 aa  362  4e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.105278  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0960  NADH dehydrogenase subunit D  44.74 
 
 
417 aa  362  4e-99  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000966275 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1046  NADH dehydrogenase I, D subunit  46.43 
 
 
411 aa  362  5.0000000000000005e-99  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1280  NADH dehydrogenase I, D subunit  46.31 
 
 
414 aa  362  5.0000000000000005e-99  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.658271  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3507  NADH dehydrogenase subunit D  44.26 
 
 
417 aa  362  6e-99  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0416  NADH dehydrogenase subunit D  45.22 
 
 
417 aa  361  1e-98  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1302  NADH dehydrogenase subunit D  45.22 
 
 
417 aa  361  1e-98  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1826  NADH dehydrogenase subunit D  45.22 
 
 
417 aa  361  1e-98  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1438  NADH dehydrogenase subunit D  45.22 
 
 
417 aa  361  1e-98  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.09225  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0734  NADH dehydrogenase subunit D  45.22 
 
 
417 aa  361  1e-98  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.301756  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2163  NADH dehydrogenase subunit D  45.69 
 
 
417 aa  361  1e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.549103  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2810  NADH dehydrogenase subunit D  44.74 
 
 
417 aa  361  1e-98  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.299965 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1293  NADH dehydrogenase subunit D  45.22 
 
 
417 aa  361  1e-98  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1133  NADH dehydrogenase subunit D  45.22 
 
 
417 aa  361  1e-98  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.154075  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1031  NADH dehydrogenase subunit D  45.69 
 
 
417 aa  360  2e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0235722  normal  0.1717 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0924  NADH dehydrogenase subunit D  47.26 
 
 
406 aa  359  3e-98  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2270  NADH dehydrogenase subunit D  45.45 
 
 
417 aa  360  3e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0316798  normal  0.103385 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0930  NADH dehydrogenase subunit D  44.26 
 
 
417 aa  360  3e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.156514  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0560  NADH dehydrogenase subunit D  44.76 
 
 
390 aa  359  5e-98  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3923  NADH dehydrogenase I, D subunit  44.78 
 
 
389 aa  358  6e-98  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.587069  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3632  NADH dehydrogenase subunit D  47.03 
 
 
397 aa  358  6e-98  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.638594 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1346  NADH dehydrogenase subunit D  44.74 
 
 
417 aa  358  7e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00313693  hitchhiker  0.00709586 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3620  NADH dehydrogenase I, D subunit  46.8 
 
 
404 aa  358  7e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.761398  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2254  NADH dehydrogenase subunit D  43.78 
 
 
417 aa  358  8e-98  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000154911 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0711  NADH dehydrogenase I, D subunit  46.17 
 
 
417 aa  358  8e-98  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.577358  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0964  NADH dehydrogenase subunit D  44.74 
 
 
417 aa  358  8e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.389115  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2627  NADH dehydrogenase subunit D  43.78 
 
 
417 aa  358  8e-98  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3223  NADH dehydrogenase I, D subunit  46.56 
 
 
392 aa  358  8e-98  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0966966  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3253  NADH dehydrogenase subunit D  44.02 
 
 
417 aa  358  8e-98  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.626895  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3211  NADH dehydrogenase subunit D  44.5 
 
 
417 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3298  NADH dehydrogenase subunit D  47.83 
 
 
366 aa  357  1.9999999999999998e-97  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4007  NADH dehydrogenase I, D subunit  44.27 
 
 
389 aa  356  2.9999999999999997e-97  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.2044e-27 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2833  NADH dehydrogenase subunit D  45.22 
 
 
417 aa  356  2.9999999999999997e-97  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1615  NADH dehydrogenase subunit D  45.45 
 
 
417 aa  356  2.9999999999999997e-97  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0833647  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1094  NADH dehydrogenase subunit D  44.26 
 
 
417 aa  356  2.9999999999999997e-97  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.402289  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3748  NADH dehydrogenase (quinone)  48.09 
 
 
370 aa  356  3.9999999999999996e-97  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000362019  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2004  NADH dehydrogenase subunit D  45.13 
 
 
402 aa  355  5.999999999999999e-97  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.639359  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0548  NADH dehydrogenase subunit D  45.45 
 
 
424 aa  355  5.999999999999999e-97  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.899987  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1427  NADH dehydrogenase subunit D  43.3 
 
 
417 aa  355  5.999999999999999e-97  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.448612  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1289  NADH dehydrogenase I, D subunit  47.43 
 
 
381 aa  355  6.999999999999999e-97  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.950756 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2702  NADH dehydrogenase subunit D  44.26 
 
 
417 aa  355  8.999999999999999e-97  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4393  NADH dehydrogenase I, D subunit  45.78 
 
 
396 aa  355  8.999999999999999e-97  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0182447  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2006  NADH dehydrogenase subunit D  44.98 
 
 
417 aa  355  8.999999999999999e-97  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000196393  normal  0.17064 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1870  NADH dehydrogenase (quinone)  48.14 
 
 
400 aa  355  8.999999999999999e-97  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2515  NADH dehydrogenase subunit D  45.13 
 
 
404 aa  354  1e-96  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0746  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  47.59 
 
 
395 aa  354  1e-96  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.946717 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1177  NADH dehydrogenase subunit D  45.13 
 
 
402 aa  354  1e-96  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.250747  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3331  NADH dehydrogenase subunit D  45.95 
 
 
416 aa  354  2e-96  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.150101  normal  0.101451 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1173  NADH dehydrogenase subunit D  44.1 
 
 
412 aa  353  2.9999999999999997e-96  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.313794  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0847  NADH dehydrogenase (quinone)  47.59 
 
 
395 aa  353  2.9999999999999997e-96  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3410  NADH dehydrogenase subunit D  47.83 
 
 
367 aa  352  4e-96  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4129  NADH dehydrogenase I, D subunit  45.01 
 
 
396 aa  352  5e-96  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1967  NADH dehydrogenase subunit D  44.26 
 
 
417 aa  352  5e-96  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0788296 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1048  NADH dehydrogenase subunit D  43.54 
 
 
417 aa  352  5.9999999999999994e-96  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4560  NADH dehydrogenase subunit D  45.78 
 
 
398 aa  352  7e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.17714 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0637  NADH dehydrogenase I, 49 kDa subunit  46.79 
 
 
400 aa  352  7e-96  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.447467  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3135  NADH dehydrogenase I, D subunit  44.5 
 
 
390 aa  351  1e-95  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0132145  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1558  NADH dehydrogenase subunit D  44.53 
 
 
392 aa  351  1e-95  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.970995  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0616  NADH dehydrogenase subunit D  44.16 
 
 
393 aa  351  1e-95  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0389154  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>