89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_7417 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_7417  Abortive infection protein  100 
 
 
296 aa  565  1e-160  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.354862  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4654  Abortive infection protein  40.52 
 
 
278 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0863972  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4470  abortive infection protein  43.17 
 
 
273 aa  142  6e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0544526  normal  0.221702 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1621  Abortive infection protein  44.05 
 
 
281 aa  142  8e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.941047  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3361  Abortive infection protein  42.79 
 
 
278 aa  138  1e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0143226  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2601  Abortive infection protein  40.97 
 
 
282 aa  134  1.9999999999999998e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2460  abortive infection protein  42.22 
 
 
278 aa  129  8.000000000000001e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.112668  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2395  abortive infection protein  36.29 
 
 
289 aa  128  1.0000000000000001e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3181  hypothetical protein  33.77 
 
 
287 aa  126  5e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.407647  normal  0.680592 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4219  Abortive infection protein  43.35 
 
 
296 aa  125  9e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.205438  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4862  abortive infection protein  42.11 
 
 
278 aa  124  2e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0831973 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1150  abortive infection protein  28.44 
 
 
286 aa  120  1.9999999999999998e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0281  abortive infection protein  32.88 
 
 
289 aa  119  6e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2782  hypothetical protein  32.1 
 
 
309 aa  90.5  3e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3429  abortive infection protein  32 
 
 
305 aa  84.7  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.489231  normal  0.486694 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0101  abortive infection protein  36.88 
 
 
325 aa  72.8  0.000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2522  CAAX amino terminal protease family protein  27.69 
 
 
298 aa  72  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000820509  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1465  protease, putative  29.67 
 
 
306 aa  70.9  0.00000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2411  abortive infection protein  34.69 
 
 
318 aa  69.3  0.00000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2455  CAAX amino terminal protease family protein  26.03 
 
 
260 aa  69.3  0.00000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000392228  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2237  abortive infection protein  27.27 
 
 
298 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000302843  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2178  CAAX amino terminal protease family protein  26.03 
 
 
298 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000000162291  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0878  metal-dependent membrane protease  29.61 
 
 
291 aa  67.8  0.0000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000352169  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2388  caax amino protease family  26.53 
 
 
298 aa  66.6  0.0000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0163342  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2441  CAAX amino terminal protease family protein  26.45 
 
 
298 aa  66.6  0.0000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.129008 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0048  Abortive infection protein  26.26 
 
 
329 aa  66.2  0.0000000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2943  CAAX amino terminal protease family protein  26.86 
 
 
298 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000176394  hitchhiker  0.0000000168434 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2217  CAAX amino terminal protease family protein  25 
 
 
298 aa  64.7  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000163275  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13230  Abortive infection protein  33.33 
 
 
326 aa  63.9  0.000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.497232  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0880  Abortive infection protein  26.24 
 
 
288 aa  63.5  0.000000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.41054  normal  0.151665 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1065  Abortive infection protein  34.07 
 
 
336 aa  63.5  0.000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.144357  normal  0.178916 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0960  CAAX amino terminal protease family protein  31.98 
 
 
376 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2533  protease family protein  31.98 
 
 
314 aa  63.2  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0226  CAAX amino terminal protease family protein  33.33 
 
 
314 aa  62.8  0.000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1605  CAAX amino terminal protease family protein  33.33 
 
 
311 aa  62.4  0.000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0262  CAAX amino terminal protease family protein  33.33 
 
 
311 aa  62.4  0.000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1886  abortive infection protein  33.99 
 
 
313 aa  62.4  0.000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.384118  normal  0.800288 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2676  protease family protein  31.08 
 
 
351 aa  62.4  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.451283  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1909  abortive infection protein  27.47 
 
 
295 aa  61.6  0.00000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000122916  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1408  CAAX amino terminal protease family protein  33.33 
 
 
282 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1132  Abortive infection protein  29.45 
 
 
324 aa  60.8  0.00000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.349362  hitchhiker  0.0040252 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4601  abortive infection protein  30.58 
 
 
295 aa  58.9  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.786066  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2258  CAAX amino terminal protease family protein  26.79 
 
 
233 aa  58.9  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000399454  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1778  abortive infection protein  26.92 
 
 
295 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000050408  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0021  protease, putative  31.82 
 
 
283 aa  55.1  0.000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2276  Abortive infection protein  29.41 
 
 
325 aa  54.7  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0702247 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1002  protease, putative  31.78 
 
 
292 aa  54.3  0.000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000825875  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05400  CAAX amino terminal protease family  27.56 
 
 
260 aa  53.5  0.000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.612617  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0509  CAAX amino terminal protease family protein  31.82 
 
 
433 aa  52  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1293  abortive infection protein  34.82 
 
 
272 aa  51.2  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1414  CAAX amino terminal protease family protein  39.53 
 
 
272 aa  51.6  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2942  abortive infection protein  39.53 
 
 
272 aa  51.6  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2854  CAAX amino terminal protease family protein  39.53 
 
 
272 aa  51.6  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1317  Abortive infection protein  38.46 
 
 
251 aa  50.4  0.00003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.254651  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0868  Abortive infection protein  35.64 
 
 
219 aa  50.1  0.00004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3430  Abortive infection protein  31.18 
 
 
261 aa  48.9  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000181299  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0340  hypothetical protein  32 
 
 
193 aa  47.8  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.53958  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2417  abortive infection protein  37.11 
 
 
362 aa  47.8  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000014849  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1659  Abortive infection protein  22.87 
 
 
301 aa  47.4  0.0003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007323  GBAA_pXO2_0088  CAAX amino terminal protease family protein  28.74 
 
 
182 aa  47  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3525  abortive infection protein  25.93 
 
 
285 aa  47  0.0004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2176  abortive infection protein  27.27 
 
 
292 aa  46.6  0.0004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.184478  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1122  abortive infection protein  29.7 
 
 
283 aa  46.2  0.0006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.90846  hitchhiker  0.0094242 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1082  abortive infection protein  25 
 
 
346 aa  45.8  0.0008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3149  Abortive infection protein  37.38 
 
 
277 aa  45.1  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2823  Abortive infection protein  32.53 
 
 
297 aa  44.7  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1223  Abortive infection protein  29.2 
 
 
267 aa  43.9  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1174  CAAX amino terminal protease family protein  27.12 
 
 
282 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.715167  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1024  abortive infection protein  26.89 
 
 
284 aa  43.9  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1276  CAAX amino terminal protease family protein  29.32 
 
 
282 aa  43.9  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1019  CAAX amino terminal protease family protein  30.08 
 
 
284 aa  43.5  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2419  abortive infection protein  25.78 
 
 
305 aa  43.1  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5786  Abortive infection protein  40.24 
 
 
269 aa  43.5  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.755126 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_48029  predicted protein  31.07 
 
 
315 aa  43.1  0.005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1219  CAAX amino terminal protease family protein  26.27 
 
 
284 aa  43.1  0.006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.991913  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1018  CAAX amino terminal protease family protein  27.87 
 
 
284 aa  43.1  0.006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.300686  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1896  abortive infection protein  32 
 
 
260 aa  43.1  0.006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.692997  normal  0.154839 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1276  AbrB family transcriptional regulator  27.27 
 
 
337 aa  42.7  0.007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00251818  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1283  abortive infection protein  27.27 
 
 
337 aa  42.7  0.007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00310248  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1378  AbrB family transcriptional regulator  27.27 
 
 
337 aa  42.7  0.007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0239799  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1041  CAAX amino terminal protease family protein  27.12 
 
 
284 aa  42.7  0.008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1199  CAAX amino terminal protease family protein  27.12 
 
 
282 aa  42.7  0.008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.746806 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1248  CAAX amino terminal protease family protein  27.27 
 
 
337 aa  42.7  0.008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000143698  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1120  CAAX amino terminal protease family protein  27.12 
 
 
284 aa  42.7  0.008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1450  transcriptional regulator, AbrB family  27.27 
 
 
337 aa  42.4  0.009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0536732 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4167  CAAX amino terminal protease family protein  27.12 
 
 
282 aa  42.4  0.009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2226  CAAX amino terminal protease family protein  28.57 
 
 
299 aa  42.4  0.009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.161963  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1850  CAAX amino terminal protease family protein  24.48 
 
 
263 aa  42.4  0.009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0460286  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3105  Abortive infection protein  27.17 
 
 
432 aa  42.4  0.009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.439358  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>