54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_1850 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_1850  CAAX amino terminal protease family protein  100 
 
 
263 aa  504  9.999999999999999e-143  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0460286  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05400  CAAX amino terminal protease family  35.66 
 
 
260 aa  182  4.0000000000000006e-45  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.612617  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1150  abortive infection protein  27.48 
 
 
286 aa  74.3  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2217  CAAX amino terminal protease family protein  27.32 
 
 
298 aa  58.9  0.00000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000163275  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2522  CAAX amino terminal protease family protein  26.8 
 
 
298 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000820509  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2441  CAAX amino terminal protease family protein  26.8 
 
 
298 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.129008 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2237  abortive infection protein  27.84 
 
 
298 aa  57.4  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000302843  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4470  abortive infection protein  29.37 
 
 
273 aa  55.5  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0544526  normal  0.221702 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4654  Abortive infection protein  28.97 
 
 
278 aa  53.5  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0863972  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1778  abortive infection protein  27.01 
 
 
295 aa  53.5  0.000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000050408  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1317  Abortive infection protein  35.63 
 
 
251 aa  53.5  0.000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.254651  normal 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5069  abortive infection protein  26.15 
 
 
270 aa  52.8  0.000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1621  Abortive infection protein  25.87 
 
 
281 aa  52.8  0.000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.941047  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2395  abortive infection protein  27.81 
 
 
289 aa  52  0.000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2943  CAAX amino terminal protease family protein  28.06 
 
 
298 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000176394  hitchhiker  0.0000000168434 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4829  abortive infection protein  34.09 
 
 
237 aa  50.8  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5243  CAAX amino terminal protease family protein  30.68 
 
 
227 aa  51.2  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.325917  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3361  Abortive infection protein  28.67 
 
 
278 aa  50.8  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0143226  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5138  CAAX amino terminal protease family protein  30.68 
 
 
288 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.450282  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5109  CAAX amino terminal protease family protein  30.68 
 
 
237 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4872  CAAX amino terminal protease family protein  30.68 
 
 
237 aa  50.8  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.499813  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2388  caax amino protease family  25.77 
 
 
298 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0163342  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2455  CAAX amino terminal protease family protein  25.26 
 
 
260 aa  50.4  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000392228  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13230  Abortive infection protein  23.38 
 
 
326 aa  49.7  0.00005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.497232  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2178  CAAX amino terminal protease family protein  25.26 
 
 
298 aa  49.3  0.00006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000000162291  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2258  CAAX amino terminal protease family protein  25.77 
 
 
233 aa  48.9  0.00007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000399454  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0048  Abortive infection protein  25.27 
 
 
329 aa  48.5  0.0001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0880  Abortive infection protein  28.78 
 
 
288 aa  47  0.0003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.41054  normal  0.151665 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05721  membrane-associated protease  28.69 
 
 
453 aa  47  0.0003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0878  metal-dependent membrane protease  23.38 
 
 
291 aa  47.4  0.0003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000352169  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7417  Abortive infection protein  24.82 
 
 
296 aa  47  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.354862  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0591  Abortive infection protein  32.14 
 
 
287 aa  46.2  0.0006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1503  Abortive infection protein  23.97 
 
 
276 aa  45.8  0.0008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.209578  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1871  hypothetical protein  35.24 
 
 
286 aa  45.4  0.0009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000201815  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3181  hypothetical protein  28.91 
 
 
287 aa  45.4  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.407647  normal  0.680592 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4862  abortive infection protein  26.49 
 
 
278 aa  44.7  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0831973 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0549  abortive infection protein  27.59 
 
 
228 aa  44.3  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1659  Abortive infection protein  24.16 
 
 
301 aa  43.9  0.002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2460  abortive infection protein  26.57 
 
 
278 aa  43.9  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.112668  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0692  CAAX amino terminal protease family protein  26.44 
 
 
228 aa  43.5  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1873  hypothetical protein  32.98 
 
 
288 aa  43.9  0.003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000278939  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1288  CAAX amino terminal protease family protein  31.65 
 
 
292 aa  43.5  0.004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000150846  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0603  CAAX amino terminal protease family protein  27.59 
 
 
228 aa  43.1  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0547  CAAX amino terminal protease family protein  27.59 
 
 
228 aa  43.1  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0547  CAAX amino terminal protease family protein  27.59 
 
 
228 aa  43.5  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0636  CAAX amino terminal protease family protein  27.59 
 
 
228 aa  43.1  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0234  CAAX amino terminal protease family protein  27.27 
 
 
256 aa  43.5  0.004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0603061  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05421  membrane-associated protease  30.33 
 
 
453 aa  43.5  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.83143  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1909  abortive infection protein  24.68 
 
 
295 aa  43.1  0.005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000122916  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1562  Abortive infection protein  31.4 
 
 
269 aa  43.1  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000889795  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_6079  predicted protein  22.09 
 
 
234 aa  42.7  0.005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.392494  normal  0.133963 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4727  CAAX amino terminal protease family protein  31.82 
 
 
237 aa  42.7  0.006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.972237  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4711  CAAX amino terminal protease family protein  31.82 
 
 
237 aa  42.7  0.006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0300594  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1465  protease, putative  27.27 
 
 
306 aa  42.4  0.009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>