More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_7096 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_7096  Methyltransferase type 11  100 
 
 		 208 aa  417  1e-116  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.517227  normal  0.260224 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2456  methyltransferase type 11  55.45 
 
 		 217 aa  219  1.9999999999999999e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.161151  normal  0.897652 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0502  putative methyltransferase  56 
 
 		 217 aa  214  7e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.925229  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3205  Methyltransferase type 11  50.75 
 
 		 210 aa  182  3e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29120  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  52.75 
 
 		 203 aa  178  4e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4348  hypothetical protein  51.91 
 
 		 220 aa  177  1e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.457106  normal  0.449633 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0174  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  48.51 
 
 		 217 aa  175  4e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1528  Methyltransferase type 11  47.5 
 
 		 209 aa  163  1.0000000000000001e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.309563  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1686  Methyltransferase type 11  42.65 
 
 		 212 aa  152  2e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.776814  normal  0.112952 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2296  Methyltransferase type 11  41.29 
 
 		 209 aa  150  1e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000023308  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4265  Methyltransferase type 11  39.32 
 
 		 215 aa  136  2e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00699595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2989  methyltransferase type 11  46.02 
 
 		 232 aa  132  3e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000030187 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0154  Methyltransferase type 11  43.86 
 
 		 218 aa  131  6.999999999999999e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.733212 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1408  Methyltransferase type 11  41.67 
 
 		 222 aa  124  8.000000000000001e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.464916  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00200  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  42.36 
 
 		 200 aa  117  9e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4405  Methyltransferase type 11  35.61 
 
 		 210 aa  116  1.9999999999999998e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.432448  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4619  methyltransferase type 11  39.39 
 
 		 200 aa  115  5e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.194423  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2718  Methyltransferase type 12  36.67 
 
 		 204 aa  114  1.0000000000000001e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00760  methyltransferase family protein  38.98 
 
 		 200 aa  113  2.0000000000000002e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.226135 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0640  methyltransferase type 11  38.36 
 
 		 197 aa  108  4.0000000000000004e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02230  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  37.5 
 
 		 224 aa  107  1e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0494  Methyltransferase type 11  35.71 
 
 		 228 aa  105  6e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0277441 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2782  hypothetical protein  34.76 
 
 		 400 aa  100  1e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0954  methyltransferase type 11  39.57 
 
 		 219 aa  100  2e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.579245 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0915  Methyltransferase type 12  34.59 
 
 		 222 aa  79  0.00000000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2543  Methyltransferase type 11  38 
 
 		 210 aa  79  0.00000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_87708  predicted protein  38.41 
 
 		 267 aa  76.6  0.0000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0981  Methyltransferase type 11  28.18 
 
 		 221 aa  74.7  0.0000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1232  methyltransferase type 11  36.23 
 
 		 238 aa  73.9  0.000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.976917  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0750  hypothetical protein  42 
 
 		 201 aa  71.6  0.000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3630  Methyltransferase type 11  38.46 
 
 		 291 aa  72  0.000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5571  methyltransferase  35.96 
 
 		 121 aa  71.6  0.000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.766224  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2139  hypothetical protein  42 
 
 		 201 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2262  hypothetical protein  42 
 
 		 201 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.363838  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0718  glycosyl transferase family protein  39.81 
 
 		 1106 aa  71.2  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.411794  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1093  methyltransferase  42 
 
 		 201 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.280373  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0559  hypothetical protein  42 
 
 		 201 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0938  SAM-dependent methyltransferases  42 
 
 		 201 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0942  hypothetical protein  42 
 
 		 201 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2404  Methyltransferase type 11  35.8 
 
 		 226 aa  70.1  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4063  Methyltransferase type 11  39.66 
 
 		 319 aa  69.7  0.00000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.355877 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2959  Methyltransferase type 12  33.1 
 
 		 196 aa  70.1  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0135677 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1164  methyltransferase type 11  43.64 
 
 		 267 aa  68.9  0.00000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.1312  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0032  Methyltransferase type 11  36.03 
 
 		 214 aa  67.8  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2940  methyltransferase type 11  34.75 
 
 		 224 aa  66.6  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4293  Methyltransferase type 11  35.25 
 
 		 305 aa  67  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.943104  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0755  Methyltransferase type 12  25.37 
 
 		 264 aa  66.2  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000828856  normal  0.444973 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3306  Methyltransferase type 12  32.41 
 
 		 196 aa  66.2  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0246311 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1652  Methyltransferase type 11  41.41 
 
 		 262 aa  66.2  0.0000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.500065  normal  0.075168 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3232  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.2 
 
 		 240 aa  65.5  0.0000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.233403  normal  0.0251873 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3026  hypothetical protein  31.03 
 
 		 196 aa  65.5  0.0000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000455995  normal  0.015635 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1589  Methyltransferase type 11  34.29 
 
 		 197 aa  65.1  0.0000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5869  hypothetical protein  33.58 
 
 		 200 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0641287  normal  0.24364 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1978  rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  31.51 
 
 		 270 aa  63.2  0.000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000355132  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3931  Methyltransferase type 11  36.97 
 
 		 271 aa  62.4  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.37046  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2116  methyltransferase  31.03 
 
 		 226 aa  62.8  0.000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1913  methyltransferase  30.34 
 
 		 236 aa  62.4  0.000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1663  methyltransferase type 11  32.89 
 
 		 243 aa  62.4  0.000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.639645  normal  0.0934074 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2586  methyltransferase type 11  38 
 
 		 204 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.322136  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2140  hypothetical protein  30.34 
 
 		 236 aa  62.4  0.000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1937  methyltransferase  30.34 
 
 		 236 aa  61.6  0.000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1566  Methyltransferase type 11  36.54 
 
 		 226 aa  61.6  0.000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2918  Methyltransferase type 11  31.48 
 
 		 248 aa  61.6  0.000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0444641  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0509  methyltransferase type 11  27.27 
 
 		 210 aa  61.6  0.000000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1367  23S rRNA methyltransferase A  31.78 
 
 		 269 aa  61.6  0.000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00000667026  normal  0.0197956 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2049  23S rRNA methyltransferase A  30.23 
 
 		 269 aa  61.6  0.000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000258454  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0864  methyltransferase type 12  34.72 
 
 		 204 aa  61.6  0.000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000143474  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0592  methyltransferase type 11  27.15 
 
 		 221 aa  61.6  0.000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.499783  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1849  methyltransferase type 11  34.23 
 
 		 259 aa  61.2  0.000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1821  rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  31.78 
 
 		 269 aa  60.8  0.00000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000864083  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2087  23S rRNA methyltransferase A  31.78 
 
 		 269 aa  60.8  0.00000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000369097  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1958  hypothetical protein  30.34 
 
 		 236 aa  61.2  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2117  Methyltransferase type 11  35.88 
 
 		 221 aa  60.8  0.00000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1298  Methyltransferase type 11  32.89 
 
 		 210 aa  60.8  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.356445  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1592  methyltransferase type 11  34.75 
 
 		 225 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.367784  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2119  Methyltransferase type 12  33.05 
 
 		 234 aa  61.2  0.00000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.54361  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3198  methyltransferase  30.34 
 
 		 226 aa  60.8  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2200  hypothetical protein  30.34 
 
 		 236 aa  60.8  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.029444  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1912  23S rRNA methyltransferase A  31.78 
 
 		 269 aa  60.8  0.00000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000118014  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3257  Methyltransferase type 11  29.3 
 
 		 551 aa  61.2  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.708921  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1987  UbiE/COQ5 family methlytransferase  36.55 
 
 		 254 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.199411  hitchhiker  0.00854034 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2962  biotin biosynthesis protein BioC  30.07 
 
 		 253 aa  60.1  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0381627  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1951  methyltransferase type 11  30.34 
 
 		 226 aa  60.5  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.319095  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3772  methyltransferase type 11  35.86 
 
 		 254 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07360  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase /demethylmenaquinone methyltransferase  30.32 
 
 		 231 aa  60.1  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.065272 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0757  methyltransferase type 11  37 
 
 		 201 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.137769  normal  0.156895 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0249  Methyltransferase type 11  33.52 
 
 		 244 aa  60.5  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.404751 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2718  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.85 
 
 		 230 aa  60.1  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.566379 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0462  methyltransferase type 11  24.46 
 
 		 215 aa  59.7  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2552  23S rRNA methyltransferase A  31.01 
 
 		 269 aa  60.1  0.00000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000000580084  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02209  Biotin biosynthesis protein BioC  37.14 
 
 		 325 aa  59.7  0.00000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.28779  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4865  Methyltransferase type 11  35.64 
 
 		 218 aa  59.7  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.743669  normal  0.127304 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1507  biotin biosynthesis protein BioC  31.47 
 
 		 253 aa  59.3  0.00000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000063017  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3132  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase / demethylmenaquinone methyltransferase  26.17 
 
 		 258 aa  59.3  0.00000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1518  methyltransferase type 11  36.23 
 
 		 254 aa  58.9  0.00000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.349113  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1186  methyltransferase type 11  29.38 
 
 		 262 aa  58.9  0.00000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.315285  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2098  methyltransferase type 11  34.29 
 
 		 263 aa  58.9  0.00000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1810  23S rRNA methyltransferase A  30.23 
 
 		 269 aa  58.9  0.00000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00511797  normal  0.361683 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2707  Methyltransferase type 12  35.65 
 
 		 201 aa  58.9  0.00000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.821475 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1530  methyltransferase type 11  33.86 
 
 		 263 aa  58.5  0.00000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>