44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5190 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_5190  protein of unknown function DUF541  100 
 
 		 229 aa  461  1e-129  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0196837  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3856  protein of unknown function DUF541  47.25 
 
 		 235 aa  176  2e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3756  hypothetical protein  46.12 
 
 		 212 aa  169  3e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.919622  normal  0.475727 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4138  hypothetical protein  45.21 
 
 		 214 aa  159  3e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.276184  normal  0.0470778 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2321  hypothetical protein  24.73 
 
 		 251 aa  68.9  0.00000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00571862 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2902  protein of unknown function DUF541  27.62 
 
 		 245 aa  65.9  0.0000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01885  outer membrane protein  26.04 
 
 		 244 aa  62.4  0.000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0217  hypothetical protein  26.99 
 
 		 237 aa  61.2  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.330993  hitchhiker  0.00697303 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2778  hypothetical protein  27.65 
 
 		 240 aa  60.5  0.00000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0418246  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3577  hypothetical protein  26.67 
 
 		 239 aa  58.5  0.00000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0468  outer membrane protein  24.31 
 
 		 242 aa  55.5  0.0000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.36585  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0407  hypothetical protein  23.76 
 
 		 242 aa  53.5  0.000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2216  hypothetical protein  27.68 
 
 		 264 aa  53.9  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.402013  normal  0.52328 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0584  hypothetical protein  24.56 
 
 		 238 aa  53.5  0.000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.443893  hitchhiker  0.00000587785 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1035  hypothetical protein  22.9 
 
 		 243 aa  53.1  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.36378  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0370  hypothetical protein  26.95 
 
 		 236 aa  52.8  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.628731 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1693  hypothetical protein  27.05 
 
 		 251 aa  51.6  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.629234  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4746  hypothetical protein  24.7 
 
 		 244 aa  51.2  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.183465 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2937  protein of unknown function DUF541  26.6 
 
 		 246 aa  50.4  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0249  protein of unknown function DUF541  28.88 
 
 		 232 aa  50.8  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.57933  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0492  protein of unknown function DUF541  33.08 
 
 		 225 aa  50.1  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.513465  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2677  protein of unknown function DUF541  25 
 
 		 245 aa  50.1  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.214154  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1932  hypothetical protein  27.17 
 
 		 281 aa  49.7  0.00004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.828306  normal  0.011783 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1416  protein of unknown function DUF541  25.34 
 
 		 218 aa  49.3  0.00004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.496752  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2333  hypothetical protein  27.65 
 
 		 244 aa  48.9  0.00006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0753305 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1626  protein of unknown function DUF541  20.78 
 
 		 241 aa  48.9  0.00006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000406911  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1713  protein of unknown function DUF541  28.66 
 
 		 240 aa  48.9  0.00006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.383472  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2545  hypothetical protein  25.13 
 
 		 241 aa  48.9  0.00006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.470705 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2220  hypothetical protein  21.99 
 
 		 233 aa  48.9  0.00007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.932217  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4192  hypothetical protein  27.03 
 
 		 223 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0673063  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3445  hypothetical protein  26.82 
 
 		 251 aa  48.1  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.321418  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1804  protein of unknown function DUF541  31.03 
 
 		 242 aa  47.4  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1883  protein of unknown function DUF541  31.48 
 
 		 242 aa  47.4  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1430  immunoreactive 28 kDa outer membrane protein  28.5 
 
 		 234 aa  46.6  0.0003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6970  protein of unknown function DUF541  29.51 
 
 		 221 aa  46.6  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.840918  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2073  hypothetical protein  30.25 
 
 		 242 aa  47  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1475  immunoreactive 28 kDa outer membrane protein  28.5 
 
 		 250 aa  46.2  0.0004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.371426  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2781  hypothetical protein  27.27 
 
 		 223 aa  46.2  0.0005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.018694  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0760  hypothetical protein  22.62 
 
 		 258 aa  45.4  0.0006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2073  hypothetical protein  25.57 
 
 		 242 aa  45.1  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.390893  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3534  hypothetical protein  24.43 
 
 		 245 aa  43.5  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.453851 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0512  hypothetical protein  25.91 
 
 		 241 aa  43.1  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.889697  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1305  hypothetical protein  24.19 
 
 		 251 aa  42.4  0.006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.706284  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2712  hypothetical protein  24.12 
 
 		 235 aa  42  0.009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0375751  normal  0.0258251 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>