More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5179 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_5179  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 		 352 aa  703    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9264  transcriptional regulator, AraC family with amidase-like domain  67.09 
 
 		 328 aa  410  1e-113  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.341665 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3202  transcriptional regulator, AraC family  58.49 
 
 		 330 aa  375  1e-103  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.125903  unclonable  0.000000000016632 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2289  transcriptional regulator, AraC family  57.81 
 
 		 332 aa  365  1e-100  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0296172  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2471  transcriptional regulator, AraC family  65.42 
 
 		 327 aa  360  2e-98  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.117682  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4725  AraC family transcriptional regulator  56.83 
 
 		 332 aa  358  6e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4046  transcriptional regulator, AraC family  54.57 
 
 		 327 aa  346  3e-94  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.188489  normal  0.0112256 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3843  transcriptional regulator, AraC family  57.14 
 
 		 339 aa  338  9.999999999999999e-92  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.295718  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3549  transcriptional regulator, AraC family  56.88 
 
 		 337 aa  333  2e-90  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.757715  normal  0.622262 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3631  transcriptional regulator, AraC family  54.06 
 
 		 327 aa  329  4e-89  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6224  AraC family transcriptional regulator  64 
 
 		 367 aa  306  3e-82  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1058  transcriptional regulator, AraC family  55 
 
 		 322 aa  294  2e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.787566  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4079  transcriptional regulator, AraC family  50 
 
 		 321 aa  291  9e-78  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0276978  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2856  AraC family transcriptional regulator  50 
 
 		 314 aa  285  7e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4080  transcriptional regulator  47.98 
 
 		 348 aa  276  5e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4142  transcriptional regulator, AraC family  47.34 
 
 		 318 aa  272  5.000000000000001e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00637596  normal  0.887483 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3109  AraC family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 320 aa  271  9e-72  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.59349 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2133  transcriptional regulator, AraC family  48.28 
 
 		 321 aa  271  1e-71  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.205913  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5349  AraC family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 325 aa  271  1e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0923  AraC family transcriptional regulator  46.58 
 
 		 331 aa  270  4e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.147864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2003  AraC family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 342 aa  268  1e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0833293 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4495  AraC family transcriptional regulator  47.02 
 
 		 340 aa  266  2.9999999999999995e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1437  AraC family transcriptional regulator  45.08 
 
 		 326 aa  266  2.9999999999999995e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.424387 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0282  AraC family transcriptional regulator  46.08 
 
 		 342 aa  266  4e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0431  transcriptional regulator, AraC family  45.6 
 
 		 320 aa  264  2e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3344  transcriptional regulator, AraC family  44.41 
 
 		 306 aa  261  1e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.107128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4748  transcriptional regulator  45.6 
 
 		 326 aa  261  1e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.760248  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4834  transcriptional regulator  45.6 
 
 		 326 aa  261  1e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5134  transcriptional regulator  45.94 
 
 		 326 aa  260  2e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.479216  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5407  transcriptional regulator, AraC family  47.34 
 
 		 313 aa  260  2e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.439375  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6692  transcriptional regulator, AraC family  46.58 
 
 		 313 aa  260  3e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.178977 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2157  AraC family transcriptional regulator  45.25 
 
 		 346 aa  259  4e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.256833  hitchhiker  0.00609835 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5328  transcriptional activator FtrA  44.83 
 
 		 324 aa  259  5.0000000000000005e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.417039 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7121  transcriptional activator FtrA  45.17 
 
 		 328 aa  258  1e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0749123  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0488  AraC family transcriptional regulator  43.71 
 
 		 335 aa  258  1e-67  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2855  AraC family transcriptional regulator  62.12 
 
 		 258 aa  257  2e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3963  AraC family transcriptional regulator  43.53 
 
 		 335 aa  257  2e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3836  AraC family transcriptional regulator  43.71 
 
 		 335 aa  257  3e-67  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1218  transcriptional regulator, AraC family  45.62 
 
 		 323 aa  256  4e-67  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6340  transcriptional regulator, AraC family  45.43 
 
 		 326 aa  256  4e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000351976 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6166  transcriptional regulator, AraC family  47.65 
 
 		 362 aa  254  2.0000000000000002e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0220245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4355  AraC family transcriptional regulator  48.95 
 
 		 356 aa  253  3e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3780  transcriptional regulator, AraC family  43.4 
 
 		 335 aa  253  3e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0475  AraC family transcriptional regulator  45.15 
 
 		 350 aa  253  3e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.625315  normal  0.0311111 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4339  transcriptional regulator, AraC family  46.6 
 
 		 334 aa  251  2e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.400268 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5345  AraC family transcriptional regulator  49.84 
 
 		 318 aa  250  3e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2659  AraC family transcriptional regulator  43.26 
 
 		 333 aa  249  5e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0500  ThiJ/PfpI domain protein  41.81 
 
 		 346 aa  248  9e-65  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.262887  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0527  transcriptional regulator, AraC family  44.21 
 
 		 318 aa  247  2e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8035  AraC family transcriptional regulator  46.69 
 
 		 333 aa  247  2e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.511507  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1097  ThiJ/PfpI domain protein  42.15 
 
 		 350 aa  246  3e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0266562  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0489  transcriptional regulator, AraC family  47.96 
 
 		 325 aa  246  6e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3394  transcriptional regulator  44.75 
 
 		 320 aa  245  6.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.482598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3383  transcriptional regulator  44.75 
 
 		 320 aa  245  6.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.690138  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3445  transcriptional regulator  44.75 
 
 		 320 aa  245  6.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.68449 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1693  AraC family transcriptional regulator  41.98 
 
 		 321 aa  245  6.999999999999999e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.69841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4747  AraC family transcriptional regulator  44.94 
 
 		 320 aa  244  9.999999999999999e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000169446 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1334  putative transcriptional regulator  44.2 
 
 		 317 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5151  AraC family transcriptional regulator  43.79 
 
 		 316 aa  243  3e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.479428  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3031  transcriptional activator FtrA  43.85 
 
 		 333 aa  242  6e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00937108  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3284  transcriptional activator FtrA  43.08 
 
 		 333 aa  242  7.999999999999999e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.059892 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1531  transcriptional regulator, AraC family  49.38 
 
 		 316 aa  241  1e-62  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.608485 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1857  transcriptional regulator, AraC family  45.6 
 
 		 342 aa  241  2e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.114565  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5943  transcriptional regulator  42.54 
 
 		 338 aa  241  2e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.295801 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2532  AraC family transcriptional regulator  43.17 
 
 		 333 aa  241  2e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.607958 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2002  AraC family transcriptional regulator  42.54 
 
 		 341 aa  239  5e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.513633  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2612  AraC family transcriptional regulator  42.54 
 
 		 341 aa  239  5e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2641  AraC family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 338 aa  239  5e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5890  transcriptional activator FtrA  42.14 
 
 		 321 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0230  transcriptional regulator  45.26 
 
 		 315 aa  238  8e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.964133 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5440  AraC family transcriptional regulator  44.38 
 
 		 315 aa  238  8e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5422  AraC family transcriptional regulator  44.38 
 
 		 315 aa  238  8e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0424919  normal  0.013013 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1680  transcriptional regulator, AraC family  44.97 
 
 		 319 aa  238  9e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00886314  normal  0.186042 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4847  AraC family transcriptional regulator  44.38 
 
 		 315 aa  238  9e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15150  putative transcriptional regulator  43.26 
 
 		 317 aa  238  1e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.414846  hitchhiker  0.0000298096 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2740  transcriptional activator FtrA  39.5 
 
 		 317 aa  237  2e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.187912 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2364  transcriptional regulator, AraC family  41.88 
 
 		 322 aa  238  2e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000189765 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2955  transcriptional regulator, AraC family  40.19 
 
 		 317 aa  237  3e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.012422  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2875  ThiJ/PfpI domain-containing protein  41.51 
 
 		 330 aa  236  6e-61  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.276432  normal  0.168058 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5233  AraC family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 349 aa  235  7e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.896357  normal  0.182047 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3587  transcriptional activator FtrA  41.96 
 
 		 329 aa  235  9e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.116485  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4403  transcriptional activator FtrA  42.41 
 
 		 333 aa  235  1.0000000000000001e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2087  transcriptional activator FtrA  41.82 
 
 		 321 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.31788  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4763  AraC family transcriptional regulator  44.06 
 
 		 315 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.316833  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0049  transcriptional regulator, AraC family  42.01 
 
 		 322 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1215  transcriptional regulator, AraC family  43.04 
 
 		 356 aa  234  2.0000000000000002e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.836684  normal  0.0161998 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0705  AraC family transcriptional regulator  45.62 
 
 		 331 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0056  transcriptional activator FtrA  41.59 
 
 		 326 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2641  transcriptional activator FtrA  41.88 
 
 		 322 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0835  transcriptional activator FtrA  41.43 
 
 		 318 aa  233  3e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4426  transcriptional activator FtrA  41.19 
 
 		 331 aa  233  3e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2062  transcriptional activator FtrA  41.3 
 
 		 329 aa  233  3e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0872  transcriptional activator FtrA  41.43 
 
 		 318 aa  233  3e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.637455  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1565  transcriptional activator FtrA  41.43 
 
 		 318 aa  233  3e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0715182  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0055  transcriptional activator FtrA  41.43 
 
 		 318 aa  233  3e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00213604  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4737  transcriptional activator FtrA  42.14 
 
 		 321 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.196215 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2214  transcriptional activator FtrA  41.43 
 
 		 318 aa  232  6e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00591748  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0964  transcriptional activator FtrA  41.12 
 
 		 318 aa  232  9e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.368238  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2631  transcriptional regulator  40.38 
 
 		 347 aa  230  3e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0133443  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3261  transcriptional regulator, AraC family  44.89 
 
 		 337 aa  229  4e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.127584  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>