122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_3775 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_3775  NADPH-dependent FMN reductase  100 
 
 
182 aa  348  2e-95  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.436385  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4209  NADPH-dependent FMN reductase  54.37 
 
 
160 aa  164  5.9999999999999996e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4899  NADPH-dependent FMN reductase  50.33 
 
 
153 aa  134  7.000000000000001e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4988  NADPH-dependent FMN reductase  50.33 
 
 
153 aa  134  7.000000000000001e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5267  NADPH-dependent FMN reductase  49.67 
 
 
153 aa  134  9e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.466048 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6432  NADPH-dependent FMN reductase  45.62 
 
 
224 aa  118  3.9999999999999996e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0448793  normal  0.066752 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8273  NAD(P)H-dependent FMN reductase, sulfate starvation-induced protein  44.25 
 
 
173 aa  106  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.122887 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7216  NADPH-dependent FMN reductase  41.57 
 
 
197 aa  104  7e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1978  NADPH-dependent FMN reductase  45.75 
 
 
196 aa  100  1e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.789371  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2918  NADPH-dependent FMN reductase  49.7 
 
 
189 aa  99.4  3e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.148799  normal  0.384277 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0471  NADPH-dependent FMN reductase  47.14 
 
 
170 aa  98.6  4e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0427  NADPH-dependent FMN reductase  40.61 
 
 
184 aa  98.6  4e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4350  NADPH-dependent FMN reductase  44.59 
 
 
205 aa  92.4  3e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1606  NADPH-dependent FMN reductase  46.1 
 
 
170 aa  90.1  1e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2834  NADPH-dependent FMN reductase  40.78 
 
 
217 aa  87  1e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.324715  normal  0.692541 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1499  hypothetical protein  42.58 
 
 
180 aa  85.9  3e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.411901  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1328  hypothetical protein  40.79 
 
 
192 aa  83.6  0.000000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.35673  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4303  NADPH-dependent FMN reductase  44.2 
 
 
212 aa  75.1  0.0000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0468815  hitchhiker  0.00179271 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1830  NADPH-dependent FMN reductase  41.49 
 
 
197 aa  71.2  0.000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.85801  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3713  NADPH-dependent FMN reductase  39.46 
 
 
171 aa  68.6  0.00000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2849  FMN reductase  41.76 
 
 
181 aa  68.2  0.00000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2421  NADPH-dependent FMN reductase  37.78 
 
 
199 aa  67.8  0.00000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.578118  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2980  NADPH-dependent FMN reductase  44.25 
 
 
172 aa  66.2  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4324  NAD(P)H-dependent FMN reductase  34.87 
 
 
197 aa  63.5  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.269642 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4346  NADPH-dependent FMN reductase  39.2 
 
 
407 aa  62.8  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2764  NADH-dependent FMN reductase MsuE  35 
 
 
186 aa  62  0.000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.880509  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2990  FMN reductase  35 
 
 
186 aa  61.6  0.000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.907159  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1780  NADPH-dependent FMN reductase  36.13 
 
 
196 aa  61.6  0.000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1214  NADPH-dependent FMN reductase  32.89 
 
 
188 aa  61.2  0.000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.370713  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2620  NADPH-dependent FMN reductase  29.08 
 
 
177 aa  61.2  0.000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000508292  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3233  NAD(P)H-dependent FMN reductase  31.76 
 
 
193 aa  61.2  0.000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.659372  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1275  NADPH-dependent FMN reductase  32.7 
 
 
207 aa  60.5  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.199782 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1212  NADPH-dependent FMN reductase  32.08 
 
 
207 aa  58.5  0.00000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.15525  normal  0.0454424 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1569  NADPH-dependent FMN reductase  31.74 
 
 
184 aa  58.2  0.00000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00531651  hitchhiker  0.0000218303 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2148  putative NADPH-dependent FMN reductase oxidoreductase protein  40 
 
 
195 aa  58.2  0.00000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.728186 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3404  NADPH-dependent FMN reductase  33.11 
 
 
189 aa  57.4  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.378679  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3713  NADPH-dependent FMN reductase  33.11 
 
 
189 aa  57.4  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0095822 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19530  NAD(P)H-dependent FMN reductase  40.22 
 
 
197 aa  55.8  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3597  NADPH-dependent FMN reductase  33.12 
 
 
195 aa  56.2  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.686994  normal  0.227288 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1902  FMN reductase  30.77 
 
 
192 aa  55.8  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30520  FMN reductase  38.04 
 
 
197 aa  55.5  0.0000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.742978  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1456  NAD(P)H-dependent FMN reductase  33.85 
 
 
191 aa  54.3  0.0000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.108076  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3451  FMN reductase, NADH-dependent  31.21 
 
 
193 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0771  NADPH-dependent FMN reductase  36.84 
 
 
187 aa  53.9  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4212  NADPH-dependent FMN reductase  30 
 
 
185 aa  53.9  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.812339  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1681  NAD(P)H-dependent FMN reductase  37.5 
 
 
197 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6110  NADPH-dependent FMN reductase  35.8 
 
 
176 aa  53.1  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0256323  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00941  NAD(P)H-dependent FMN reductase  47.62 
 
 
191 aa  52.4  0.000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.659723  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2706  FMN reductase  47.62 
 
 
191 aa  52.4  0.000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.529701  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5790  FMN reductase  36.97 
 
 
186 aa  52.8  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3727  NADPH-dependent FMN reductase  36.08 
 
 
224 aa  52.8  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6155  FMN reductase  36.97 
 
 
186 aa  52.8  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.547698  normal  0.634329 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0352  NAD(P)H-dependent FMN reductase  38.37 
 
 
193 aa  52.8  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1046  NAD(P)H-dependent FMN reductase  47.62 
 
 
191 aa  52.4  0.000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1052  NAD(P)H-dependent FMN reductase  47.62 
 
 
191 aa  52.4  0.000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.547438  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2659  NAD(P)H-dependent FMN reductase  47.62 
 
 
191 aa  52.4  0.000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.724178  hitchhiker  0.00966888 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2381  NAD(P)H-dependent FMN reductase  47.62 
 
 
191 aa  52.4  0.000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1099  NAD(P)H-dependent FMN reductase  47.62 
 
 
191 aa  52.4  0.000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0524065  normal  0.428105 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00948  hypothetical protein  47.62 
 
 
191 aa  52.4  0.000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.658927  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1739  NAD(P)H-dependent FMN reductase  40 
 
 
171 aa  52  0.000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.118437  normal  0.0421419 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4976  NAD(P)H-dependent FMN reductase  37.5 
 
 
197 aa  51.6  0.000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0000541054  normal  0.0799227 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3585  NADPH-dependent FMN reductase  32.92 
 
 
205 aa  51.6  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00310961  normal  0.451104 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0879  NADPH-dependent FMN reductase  32.03 
 
 
194 aa  51.2  0.000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.227459  normal  0.535167 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6635  FMN reductase  36.36 
 
 
186 aa  51.2  0.000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0882  NADPH-dependent FMN reductase  36.59 
 
 
181 aa  51.2  0.000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0236  NAD(P)H-dependent FMN reductase  36.25 
 
 
197 aa  51.2  0.000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.219354  hitchhiker  0.00210167 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2781  NADPH-dependent FMN reductase  33.09 
 
 
193 aa  50.8  0.000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.412739  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0251  NAD(P)H-dependent FMN reductase  36.25 
 
 
197 aa  51.2  0.000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0228616  normal  0.253969 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1335  NADPH-dependent FMN reductase  30.47 
 
 
190 aa  51.2  0.000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0105242 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1337  NADPH-dependent FMN reductase oxidoreductase protein  33.71 
 
 
214 aa  50.8  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6104  FMN reductase  39.77 
 
 
189 aa  50.8  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.141165  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2182  NAD(P)H-dependent FMN reductase  46.03 
 
 
191 aa  50.4  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.758573 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2180  NADPH-dependent FMN reductase  34.09 
 
 
193 aa  50.4  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.855995 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5119  NADPH-dependent FMN reductase  38.96 
 
 
185 aa  50.1  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.948082 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0260  NAD(P)H-dependent FMN reductase  36.25 
 
 
197 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.373687  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2040  FMN reductase  36.69 
 
 
193 aa  50.1  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2548  FMN reductase  29.61 
 
 
193 aa  49.3  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.33776 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5008  NADPH-dependent FMN reductase  36.36 
 
 
202 aa  49.3  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.14241  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26140  predicted flavoprotein  25 
 
 
187 aa  49.3  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.744413  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2472  flavoprotein  36.08 
 
 
172 aa  48.9  0.00004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7714  FMN reductase  33.66 
 
 
191 aa  48.9  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.707189  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1937  NADPH-dependent FMN reductase  37.5 
 
 
228 aa  48.9  0.00004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0787338  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03758  FMN reductase  35.14 
 
 
180 aa  48.9  0.00004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5569  FMN reductase  29.76 
 
 
186 aa  48.1  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0476585  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1143  NADPH-dependent FMN reductase  31.52 
 
 
193 aa  48.1  0.00006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0935648  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2153  NADPH-dependent FMN reductase  31.19 
 
 
206 aa  48.5  0.00006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.256474  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07440  predicted flavoprotein  40 
 
 
229 aa  48.1  0.00006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.222943  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5415  NAD(P)H-dependent FMN reductase  32.5 
 
 
197 aa  48.1  0.00008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.246778  hitchhiker  0.00193598 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0568  NADPH-dependent FMN reductase  33.62 
 
 
430 aa  47.8  0.00009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.036155  normal  0.154432 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5075  NADPH-dependent FMN reductase  34.83 
 
 
197 aa  47.4  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.613713 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6506  FMN reductase  32.99 
 
 
186 aa  47.4  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1783  NADPH-dependent FMN reductase  30.41 
 
 
218 aa  46.2  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.233264  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18720  predicted flavoprotein  34.38 
 
 
211 aa  46.2  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.49339 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30480  predicted flavoprotein  38.75 
 
 
200 aa  46.6  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.947146  normal  0.32989 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5363  luciferase family protein  33.71 
 
 
481 aa  47  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1774  FMN reductase  31.62 
 
 
209 aa  46.6  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5131  NADPH-dependent FMN reductase  34.94 
 
 
211 aa  46.6  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.088635 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1645  NAD(P)H-dependent FMN reductase  44.44 
 
 
184 aa  46.6  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.688912  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6093  FMN reductase  31.96 
 
 
186 aa  45.8  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.29051  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2005  NADPH-dependent FMN reductase  38.55 
 
 
218 aa  45.8  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.423484  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>