144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_2022 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_1878  amino acid transporter  60.56 
 
 		 677 aa  753    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.148156  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1714  putative aminoacid/polyamine transporter, permease protein  60.53 
 
 		 683 aa  740    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.553207  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6758  hypothetical protein  60.12 
 
 		 704 aa  710    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0797924 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1324  hypothetical protein  63.91 
 
 		 668 aa  798    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.112475  normal  0.347698 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2284  hypothetical protein  58.55 
 
 		 681 aa  676    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.225884 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2198  amino acid permease-associated region  61.21 
 
 		 664 aa  746    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2022  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  100 
 
 		 781 aa  1565    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.8083  normal  0.142802 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1642  putative transporter  54.81 
 
 		 654 aa  673    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.05725  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2258  amino acid transporter  60.03 
 
 		 672 aa  743    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.186562  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1397  hypothetical protein  59.75 
 
 		 674 aa  714    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2902  putative transporter  57.79 
 
 		 685 aa  679    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4526  amino acid transporter  60.75 
 
 		 655 aa  748    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0966094  normal  0.421958 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2244  amino acid permease-associated region  61.21 
 
 		 664 aa  746    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2474  amino acid permease-associated region  60.71 
 
 		 664 aa  723    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0436881  normal  0.698819 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2187  amino acid permease-associated region  61.36 
 
 		 664 aa  747    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00798252 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16180  hypothetical protein  58.03 
 
 		 672 aa  712    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.24522 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3926  amino acid permease-associated region  61.42 
 
 		 664 aa  718    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.036267  normal  0.618812 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1487  hypothetical protein  61.91 
 
 		 696 aa  724    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.479036  normal  0.671369 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1522  hypothetical protein  62.09 
 
 		 674 aa  714    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.579036  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12705  alanine, valine and leucine rich integral membrane protein  60.41 
 
 		 657 aa  706    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1563  putative transporter  59.85 
 
 		 677 aa  644    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.117047  normal  0.694586 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1916  hypothetical protein  58.32 
 
 		 667 aa  660    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.635201  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5190  hypothetical protein  59.48 
 
 		 731 aa  769    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.01905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1452  hypothetical protein  62.38 
 
 		 691 aa  714    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  hitchhiker  0.000394394  normal  0.0118097 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1404  amino acid permease  54.42 
 
 		 678 aa  647    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.943899 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3755  amino acid transporter  60.69 
 
 		 682 aa  743    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000328435  normal  0.279832 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1635  putative transporter  55.35 
 
 		 658 aa  680    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000053335 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1709  hypothetical protein  60.09 
 
 		 667 aa  697    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.71467  normal  0.0434218 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1943  putative transporter  59.72 
 
 		 678 aa  689    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.630635  normal  0.0235121 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0561  amino acid permease-associated region  46.2 
 
 		 614 aa  526  1e-148  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0441544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3857  amino acid permease-associated region  46.9 
 
 		 614 aa  525  1e-147  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.00000427762  unclonable  0.0000151298 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1201  amino acid permease-associated region  45.51 
 
 		 615 aa  489  1e-137  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0215506 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1191  amino acid permease-associated region  43.52 
 
 		 627 aa  471  1.0000000000000001e-131  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000300657  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2069  hypothetical protein  44.74 
 
 		 672 aa  463  1e-129  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000284344  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1068  hypothetical protein  44.01 
 
 		 611 aa  453  1.0000000000000001e-126  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0032  hypothetical protein  40.27 
 
 		 693 aa  445  1e-123  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4342  amino acid permease-associated region  42.23 
 
 		 611 aa  438  1e-121  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.676732  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4627  amino acid permease  40.92 
 
 		 608 aa  417  9.999999999999999e-116  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.486141  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2466  hypothetical protein  37.97 
 
 		 609 aa  412  1e-113  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000341492  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2515  hypothetical protein  37.97 
 
 		 609 aa  412  1e-113  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000264968  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2018  hypothetical protein  38.13 
 
 		 609 aa  402  1e-111  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0010431  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1112  hypothetical protein  41.61 
 
 		 612 aa  402  9.999999999999999e-111  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0727554  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1880  hypothetical protein  39.38 
 
 		 608 aa  402  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000195786  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3464  hypothetical protein  39.53 
 
 		 608 aa  401  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000852812  decreased coverage  4.4181400000000004e-23 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2243  amino acid transporter-like protein  37.68 
 
 		 629 aa  400  9.999999999999999e-111  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1210  amino acid permease  43.34 
 
 		 585 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.177071  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0699  amino acid transporter-like protein  36.97 
 
 		 627 aa  395  1e-108  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000494308  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1194  nucleic acid binding, OB-fold, tRNA/helicase-type  35.23 
 
 		 774 aa  390  1e-107  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.701127  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1601  amino acid transporter  38.1 
 
 		 636 aa  387  1e-106  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.654948  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1113  hypothetical protein  39.14 
 
 		 608 aa  384  1e-105  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1740  amino acid permease  39.59 
 
 		 608 aa  382  1e-104  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000902487  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1974  amino acid transporter-like protein  35.97 
 
 		 629 aa  378  1e-103  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1921  hypothetical protein  39.27 
 
 		 608 aa  379  1e-103  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.0058200000000004e-24 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1966  hypothetical protein  39.34 
 
 		 608 aa  375  1e-102  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000121839  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1697  amino acid permease  39.43 
 
 		 608 aa  375  1e-102  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000377076  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1994  hypothetical protein  39.34 
 
 		 608 aa  373  1e-102  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000355688  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1503  amino acid transporter  37.01 
 
 		 614 aa  365  1e-99  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0415343  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1190  amino acid permease-associated region  39.25 
 
 		 653 aa  365  2e-99  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000537417  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3408  amino acid permease-associated region  39.21 
 
 		 750 aa  360  7e-98  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.492526  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7673  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  32.55 
 
 		 815 aa  358  1.9999999999999998e-97  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.803412  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0357  amino acid permease-associated region  38.05 
 
 		 612 aa  349  1e-94  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000770343  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1922  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  34.8 
 
 		 777 aa  344  5e-93  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1638  amino acid transporter  35.32 
 
 		 615 aa  343  5.999999999999999e-93  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21241  amino acid transporter  38.07 
 
 		 615 aa  343  5.999999999999999e-93  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.97289 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1791  amino acid transporter  38.68 
 
 		 614 aa  337  5.999999999999999e-91  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0243869  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4183  putative aminoacid/polyamine transporter, permease protein  33.82 
 
 		 647 aa  311  2e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0002  hypothetical protein  34.83 
 
 		 622 aa  304  4.0000000000000003e-81  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000285538  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13060  amino acid transporter  37.99 
 
 		 650 aa  295  3e-78  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0101784  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1503  putative aminoacid/polyamine transporter, permease protein  35.87 
 
 		 619 aa  271  4e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1747  hypothetical protein  46.03 
 
 		 365 aa  270  8e-71  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.119292  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1443  amino acid permease-associated region  40.49 
 
 		 470 aa  213  1e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.839992  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2448  amino acid permease-associated region  31.86 
 
 		 713 aa  193  1e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0321394 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2826  hypothetical protein  31.86 
 
 		 713 aa  193  1e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3101  amino acid transporter-like protein  27.32 
 
 		 685 aa  164  5.0000000000000005e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1593  amino acid transporter-like protein  28.31 
 
 		 657 aa  164  5.0000000000000005e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2571  amino acid transporter-like  28.48 
 
 		 656 aa  162  3e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.715012 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3262  amino acid permease-associated region  27.77 
 
 		 657 aa  159  2e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0945  amino acid transporter-like protein  26.6 
 
 		 680 aa  155  2e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0942  amino acid transporter-like protein  30.3 
 
 		 680 aa  152  3e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.589203  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1725  amino acid permease, central region  43.17 
 
 		 253 aa  145  3e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.759722  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0024  lysine-specific permease  27.43 
 
 		 647 aa  132  3e-29  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1995  hypothetical protein  27.43 
 
 		 647 aa  132  3e-29  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1726  amino acid permease, C-terminal  32.49 
 
 		 272 aa  125  2e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0922786  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1708  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  55.66 
 
 		 140 aa  122  3e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0248195  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1400  nucleic acid binding, OB-fold, tRNA/helicase-type  51.82 
 
 		 133 aa  118  3.9999999999999997e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6762  hypothetical protein  46.03 
 
 		 130 aa  118  5e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0790875 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1559  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  47.83 
 
 		 133 aa  117  1.0000000000000001e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.311363  normal  0.277265 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2906  nucleic acid binding, OB-fold, tRNA/helicase-type  54.72 
 
 		 120 aa  116  2.0000000000000002e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1448  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  49.55 
 
 		 126 aa  110  1e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.362896  hitchhiker  0.00185234 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2288  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  50.47 
 
 		 136 aa  108  3e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.208905 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1483  nucleic acid binding, OB-fold, tRNA/helicase-type  48.65 
 
 		 126 aa  108  4e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.311126  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16140  OB-fold nucleic acid binding protein  45.38 
 
 		 122 aa  104  6e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.24417  normal  0.140824 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5194  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  43.75 
 
 		 133 aa  103  9e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.9488  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1518  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  45.45 
 
 		 125 aa  103  1e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.859194  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3759  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  46.55 
 
 		 122 aa  101  5e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000195946  normal  0.398005 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1705  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  43.59 
 
 		 122 aa  100  8e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.041605  normal  0.0985281 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1874  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  43.75 
 
 		 125 aa  99.4  2e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.809864  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1320  nucleic acid binding, OB-fold, tRNA/helicase-type  42.61 
 
 		 128 aa  98.6  4e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.434998 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1920  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  45.13 
 
 		 122 aa  92.8  2e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.286394  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3930  nucleic acid binding, OB-fold, tRNA/helicase-type  41.38 
 
 		 136 aa  93.2  2e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0928391  normal  0.448603 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>