More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_1763 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_1611  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  68.41 
 
 		 696 aa  949    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00143665  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1922  DNA topoisomerase IV subunit B  63.09 
 
 		 708 aa  856    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.921776  normal  0.0348119 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1425  DNA topoisomerase IV subunit B  63.8 
 
 		 723 aa  908    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15990  DNA topoisomerase IV subunit B  62.8 
 
 		 710 aa  904    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.440467  normal  0.0965428 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1613  DNA topoisomerase IV subunit B  65.41 
 
 		 702 aa  931    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000263124 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1680  DNA topoisomerase type IIA subunit B region 2 domain-containing protein  52.35 
 
 		 702 aa  707    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.313615  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2134  DNA topoisomerase IV subunit B  68.81 
 
 		 702 aa  981    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2280  DNA gyrase subunit B domain protein  52.09 
 
 		 680 aa  678    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.557074  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2394  DNA topoisomerase  67.24 
 
 		 690 aa  938    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.367142  normal  0.572955 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1763  DNA topoisomerase IV subunit B  100 
 
 		 709 aa  1441    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0298  DNA topoisomerase plasmid partition protein B  53.64 
 
 		 758 aa  760    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08220  DNA topoisomerase IV subunit B  51.99 
 
 		 701 aa  696    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14380  DNA topoisomerase IV subunit B  62.69 
 
 		 705 aa  897    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.219093  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1674  DNA gyrase subunit B  51.85 
 
 		 730 aa  699    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.759972 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3307  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  68.67 
 
 		 701 aa  969    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1988  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  64.58 
 
 		 715 aa  919    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15910  DNA topoisomerase IV subunit B  63.47 
 
 		 709 aa  904    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.39843 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1619  DNA topoisomerase IV subunit B  65.55 
 
 		 702 aa  931    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0681707  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1427  DNA topoisomerase IV subunit B  63.2 
 
 		 703 aa  860    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.529913  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2055  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  64.25 
 
 		 713 aa  884    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2958  DNA topoisomerase IV subunit B  66.52 
 
 		 710 aa  964    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.414962  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13260  DNA topoisomerase IV subunit B  65.11 
 
 		 701 aa  879    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0630779  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1534  DNA topoisomerase IV subunit B  65.01 
 
 		 693 aa  909    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.300498  normal  0.0102248 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7084  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  69.7 
 
 		 690 aa  947    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0006  DNA gyrase subunit B  46.8 
 
 		 661 aa  555  1e-157  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.925878  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0009  DNA gyrase subunit B  45.39 
 
 		 633 aa  552  1e-156  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000695632  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0094  DNA gyrase, B subunit  45.88 
 
 		 636 aa  554  1e-156  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000363706  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0094  DNA gyrase, B subunit  45.74 
 
 		 636 aa  551  1e-155  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000129942  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1393  DNA gyrase, B subunit  45.16 
 
 		 628 aa  551  1e-155  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0005  DNA gyrase, B subunit  44.86 
 
 		 686 aa  545  1e-153  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.217672  normal  0.192252 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0419  DNA gyrase subunit B  43.7 
 
 		 632 aa  545  1e-153  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0984  DNA gyrase subunit B  45.83 
 
 		 651 aa  543  1e-153  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0007  DNA gyrase subunit B  43.86 
 
 		 640 aa  541  9.999999999999999e-153  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.630363  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0006  DNA gyrase, B subunit  42.21 
 
 		 647 aa  535  1e-151  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0015  DNA gyrase, B subunit  43.08 
 
 		 644 aa  535  1e-150  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000155334 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1044  DNA gyrase, B subunit  42.07 
 
 		 675 aa  533  1e-150  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.248456 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0005  DNA gyrase subunit B  44.26 
 
 		 644 aa  535  1e-150  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.375435  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11740  DNA gyrase, B subunit  42.5 
 
 		 637 aa  533  1e-150  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00171708  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1480  DNA gyrase subunit B  44.56 
 
 		 650 aa  534  1e-150  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.515184  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0051  DNA gyrase, B subunit  45.2 
 
 		 640 aa  529  1e-149  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00060  DNA gyrase, B subunit  43.94 
 
 		 642 aa  531  1e-149  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0087  DNA gyrase subunit B  41.88 
 
 		 650 aa  531  1e-149  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1407  DNA gyrase, B subunit  45.37 
 
 		 656 aa  529  1e-149  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.68269  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0005  DNA gyrase, B subunit  44.02 
 
 		 644 aa  527  1e-148  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00336478  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0623  DNA gyrase subunit B  44.77 
 
 		 650 aa  527  1e-148  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00302751  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1048  DNA gyrase, B subunit  44.7 
 
 		 665 aa  527  1e-148  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.903378  normal  0.436385 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0006  DNA gyrase, B subunit  42.88 
 
 		 650 aa  526  1e-148  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000273734  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0132  DNA gyrase, B subunit  45.1 
 
 		 637 aa  527  1e-148  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.312038  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0412  DNA gyrase subunit B  45 
 
 		 651 aa  528  1e-148  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.000264952  decreased coverage  0.0001901 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2376  DNA gyrase subunit B  43.75 
 
 		 641 aa  528  1e-148  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0006  DNA gyrase, B subunit  42.94 
 
 		 648 aa  524  1e-147  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.000000466462  hitchhiker  0.000000932752 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0005  DNA gyrase subunit B  44.99 
 
 		 640 aa  523  1e-147  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00215329  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2805  DNA gyrase subunit B  44.28 
 
 		 633 aa  524  1e-147  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.035041  hitchhiker  0.00161489 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00050  DNA gyrase subunit B  42.24 
 
 		 645 aa  524  1e-147  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0377504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0005  DNA gyrase subunit B  45.78 
 
 		 640 aa  521  1e-146  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2748  DNA gyrase, B subunit  41.62 
 
 		 637 aa  520  1e-146  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000339515  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0015  DNA gyrase, B subunit  42.47 
 
 		 644 aa  519  1e-146  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000401037  normal  0.862842 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0087  DNA gyrase subunit B  44.1 
 
 		 655 aa  520  1e-146  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1634  DNA gyrase, B subunit  41.53 
 
 		 708 aa  520  1e-146  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  decreased coverage  0.00000582851  hitchhiker  0.000898108 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0995  DNA gyrase, B subunit  45.35 
 
 		 645 aa  519  1e-146  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2717  DNA gyrase, B subunit  42.94 
 
 		 649 aa  522  1e-146  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2729  DNA gyrase, B subunit  44.3 
 
 		 641 aa  522  1e-146  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.739794  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5315  DNA gyrase subunit B  45.01 
 
 		 640 aa  517  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.021698  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0006  DNA gyrase, B subunit  43.75 
 
 		 642 aa  518  1.0000000000000001e-145  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.965796  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0005  DNA gyrase subunit B  45.01 
 
 		 640 aa  516  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.19557  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0005  DNA gyrase subunit B  44.86 
 
 		 640 aa  515  1.0000000000000001e-145  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0005  DNA gyrase subunit B  44.86 
 
 		 640 aa  515  1.0000000000000001e-145  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0005  DNA gyrase subunit B  44.86 
 
 		 640 aa  516  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.204678  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0005  DNA gyrase subunit B  45.01 
 
 		 640 aa  518  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0005  DNA gyrase subunit B  45.28 
 
 		 640 aa  518  1.0000000000000001e-145  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0005  DNA gyrase subunit B  44.86 
 
 		 640 aa  515  1.0000000000000001e-145  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0007  DNA gyrase, B subunit  43.5 
 
 		 634 aa  515  1.0000000000000001e-145  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000328066  unclonable  0.0000000130354 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0015  DNA gyrase, B subunit  43.16 
 
 		 643 aa  516  1.0000000000000001e-145  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00473367  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0006  DNA gyrase, B subunit  44.76 
 
 		 649 aa  518  1.0000000000000001e-145  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0005  DNA gyrase subunit B  44.86 
 
 		 640 aa  515  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0005  DNA gyrase subunit B  44.86 
 
 		 640 aa  515  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00230725  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0006  DNA gyrase subunit B  45.53 
 
 		 696 aa  516  1.0000000000000001e-145  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.248414  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0016  DNA gyrase, B subunit  42.86 
 
 		 649 aa  517  1.0000000000000001e-145  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00028541  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0036  DNA gyrase subunit B  43.15 
 
 		 643 aa  518  1.0000000000000001e-145  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2271  DNA gyrase, B subunit  43.52 
 
 		 644 aa  516  1.0000000000000001e-145  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0671  DNA gyrase, B subunit  43.65 
 
 		 627 aa  512  1e-144  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.958816  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00050  DNA gyrase subunit B  42.75 
 
 		 648 aa  514  1e-144  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000300089  hitchhiker  0.00265407 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0130  DNA gyrase, B subunit  43.17 
 
 		 636 aa  514  1e-144  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.95821  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0005  DNA gyrase subunit B  44.19 
 
 		 640 aa  514  1e-144  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0005  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  41.52 
 
 		 633 aa  512  1e-144  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0005  DNA gyrase, B subunit  42.98 
 
 		 635 aa  513  1e-144  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00060  DNA gyrase subunit B  45.69 
 
 		 683 aa  514  1e-144  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2549  DNA gyrase, B subunit  43 
 
 		 643 aa  511  1e-143  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0133  DNA gyrase subunit B  43.3 
 
 		 655 aa  509  1e-143  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.879154  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0006  DNA gyrase, B subunit  44.54 
 
 		 638 aa  511  1e-143  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.014329  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0693  DNA gyrase, B subunit, C-terminal domain protein  55.36 
 
 		 792 aa  510  1e-143  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0006  DNA gyrase, B subunit  45.04 
 
 		 681 aa  511  1e-143  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18231  DNA gyrase subunit B  41.26 
 
 		 655 aa  510  1e-143  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.654486  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0029  DNA gyrase, B subunit  43.35 
 
 		 637 aa  507  9.999999999999999e-143  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0006  DNA gyrase subunit B  45.24 
 
 		 695 aa  509  9.999999999999999e-143  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000061906 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0306  DNA gyrase, B subunit  43.27 
 
 		 643 aa  506  9.999999999999999e-143  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.337431  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17611  DNA gyrase subunit B  42 
 
 		 658 aa  508  9.999999999999999e-143  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.616229  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0007  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  44.25 
 
 		 647 aa  505  9.999999999999999e-143  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00060  DNA gyrase subunit B  44.43 
 
 		 701 aa  506  9.999999999999999e-143  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01571  DNA gyrase subunit B  42.94 
 
 		 655 aa  507  9.999999999999999e-143  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>