More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_1537 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008262  CPR_0681  ISCpe7, transposase  97.65 
 
 		 340 aa  692    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0784  ISCpe7, transposase  97.35 
 
 		 340 aa  691    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.653929  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0802  ISCpe7, transposase  97.65 
 
 		 340 aa  692    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0691516  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0809  ISCpe7, transposase  96.47 
 
 		 340 aa  684    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.313897  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0947  ISCpe7, transposase  97.35 
 
 		 340 aa  690    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0680749  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0982  ISCpe7, transposase  95.88 
 
 		 340 aa  682    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000545032  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1313  ISCpe7, transposase  95.88 
 
 		 340 aa  682    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0190357  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1537  ISCpe7, transposase  100 
 
 		 340 aa  710    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.10688  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1473  ISCpe7, transposase  97.63 
 
 		 253 aa  517  1.0000000000000001e-145  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.804077  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0635  ISCpe7, transposase  96.7 
 
 		 186 aa  367  1e-100  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0929  ISCpe7, transposase  96.15 
 
 		 186 aa  367  1e-100  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0298408  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0755  integrase catalytic subunit  49.56 
 
 		 343 aa  346  3e-94  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000147635  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1944  Integrase catalytic region  47.13 
 
 		 353 aa  319  5e-86  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.704589  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2640  Integrase catalytic region  47.13 
 
 		 353 aa  319  5e-86  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0674  Integrase catalytic region  47.13 
 
 		 353 aa  319  5e-86  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2422  Integrase catalytic region  47.13 
 
 		 353 aa  319  5e-86  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1189  ISCpe7, transposase  99.34 
 
 		 152 aa  317  3e-85  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0238866  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1065  Integrase catalytic region  46.26 
 
 		 353 aa  314  9.999999999999999e-85  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.106559 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2243  Integrase catalytic region  46.26 
 
 		 353 aa  314  9.999999999999999e-85  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.781166 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1912  Integrase catalytic region  46.26 
 
 		 353 aa  314  9.999999999999999e-85  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2179  Integrase catalytic region  46.26 
 
 		 353 aa  314  9.999999999999999e-85  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000521095  hitchhiker  1.88153e-16 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2409  Integrase catalytic region  46.26 
 
 		 353 aa  314  9.999999999999999e-85  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0243  Integrase catalytic region  46.26 
 
 		 353 aa  314  9.999999999999999e-85  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0037  Integrase catalytic region  46.26 
 
 		 353 aa  314  9.999999999999999e-85  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0634  ISCpe7, transposase  94.84 
 
 		 156 aa  310  2.9999999999999997e-83  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0930  ISCpe7, transposase  93.59 
 
 		 156 aa  306  3e-82  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00303612  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1190  ISCpe7, transposase  96.35 
 
 		 137 aa  277  2e-73  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0283879  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1472  hypothetical protein  94.87 
 
 		 78 aa  152  8e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.380106  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1412  ISCpe7, transposase  29.52 
 
 		 316 aa  134  1.9999999999999998e-30  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000618416  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0315  ISCpe7, transposase  29.52 
 
 		 316 aa  134  1.9999999999999998e-30  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00611234  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0035  ISCpe7, transposase  29.52 
 
 		 316 aa  134  1.9999999999999998e-30  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.800546  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1261  ISCpe7, transposase  29.52 
 
 		 316 aa  134  1.9999999999999998e-30  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000118886  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0745  ISCpe7, transposase  29.52 
 
 		 316 aa  134  1.9999999999999998e-30  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000815737  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1078  ISCpe7, transposase  29.52 
 
 		 316 aa  134  1.9999999999999998e-30  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000101857  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0030  insertion element protein  32.56 
 
 		 312 aa  129  7.000000000000001e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000855614  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0556  ISCpe7, transposase  32.56 
 
 		 312 aa  129  8.000000000000001e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00138013  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1581  ISCpe7, transposase  32.56 
 
 		 312 aa  129  8.000000000000001e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0799  ISCpe7, transposase  32.56 
 
 		 312 aa  129  8.000000000000001e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0903  ISCpe7, transposase  32.56 
 
 		 312 aa  129  8.000000000000001e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000597662  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1361  ISCpe7, transposase  32.56 
 
 		 312 aa  129  8.000000000000001e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0203024  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1164  ISCpe7, transposase  32.56 
 
 		 312 aa  129  8.000000000000001e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1196  ISCpe7, transposase  32.56 
 
 		 312 aa  128  1.0000000000000001e-28  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0509  ISCpe7, transposase  32.23 
 
 		 312 aa  128  1.0000000000000001e-28  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0727  insertion element protein  32.56 
 
 		 312 aa  129  1.0000000000000001e-28  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0078  ISCpe7, transposase  32.56 
 
 		 312 aa  128  1.0000000000000001e-28  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.516266  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0422  insertion element protein  32.56 
 
 		 312 aa  129  1.0000000000000001e-28  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1574  ISCpe7, transposase  32.23 
 
 		 312 aa  128  1.0000000000000001e-28  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0337  ISCpe7, transposase  32.56 
 
 		 312 aa  128  1.0000000000000001e-28  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.500965  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0170  integrase catalytic subunit  35.45 
 
 		 319 aa  122  9.999999999999999e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0337001  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2050  transposase  23.73 
 
 		 478 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000963714  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0539  transposase  23.73 
 
 		 478 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000512999  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0694  transposase  23.73 
 
 		 478 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000208331  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0319  transposase  23.47 
 
 		 470 aa  110  3e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9135  transposase  37.09 
 
 		 180 aa  85.1  0.000000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0658372  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0115  hypothetical protein  32.66 
 
 		 261 aa  82.4  0.000000000000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000160092  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8473  putative transposase  29.61 
 
 		 233 aa  82.4  0.000000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.396806  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9039  transposase  32.61 
 
 		 243 aa  82  0.00000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0386  hypothetical protein  32.66 
 
 		 261 aa  82  0.00000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5656  integrase catalytic region  27.51 
 
 		 235 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  0.0204963 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3012  transposase  31.61 
 
 		 237 aa  81.6  0.00000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2997  transposase  31.61 
 
 		 237 aa  81.6  0.00000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3017  transposase  31.61 
 
 		 237 aa  81.6  0.00000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3074  transposase  31.61 
 
 		 237 aa  81.6  0.00000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3086  transposase  31.61 
 
 		 237 aa  81.6  0.00000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2945  transposase  31.61 
 
 		 237 aa  81.6  0.00000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2913  transposase  31.61 
 
 		 237 aa  81.6  0.00000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8044  transposase  36 
 
 		 238 aa  80.1  0.00000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9042  transposase  36 
 
 		 238 aa  80.1  0.00000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.276584  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0546  transposase  32.61 
 
 		 238 aa  78.6  0.0000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2762  transposase  29.74 
 
 		 251 aa  78.2  0.0000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.297514  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0175  transposase  31.91 
 
 		 232 aa  78.2  0.0000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7148  transposase  34.67 
 
 		 232 aa  77.8  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3408  integrase catalytic region  25 
 
 		 262 aa  77.4  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4083  transposase  28.23 
 
 		 236 aa  77  0.0000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0563  transposase protein  30.98 
 
 		 238 aa  77  0.0000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4167  putative transposase  28.71 
 
 		 237 aa  76.6  0.0000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4506  integrase catalytic region  27.69 
 
 		 236 aa  76.6  0.0000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8012  transposase protein  35.33 
 
 		 238 aa  76.3  0.0000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4149  integrase  27.8 
 
 		 213 aa  75.5  0.000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2851  putative transposase  28.71 
 
 		 237 aa  75.5  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.878699  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3268  integrase catalytic region  27.32 
 
 		 212 aa  75.5  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4360  transposase  34.13 
 
 		 237 aa  75.5  0.000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.017545  n/a   
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D29  transposase  27.75 
 
 		 226 aa  75.5  0.000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.0000656405  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2782  integrase catalytic subunit  32.61 
 
 		 231 aa  75.1  0.000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0856154  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7882  putative transposase  30.15 
 
 		 233 aa  74.3  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0096  IS26 transposase  29.8 
 
 		 234 aa  73.9  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7848  putative transposase  30.15 
 
 		 233 aa  74.3  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7870  putative transposase  30.15 
 
 		 233 aa  74.3  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0099  IS26 transposase  29.8 
 
 		 234 aa  73.9  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.41105  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0040  IS26 transposase  29.8 
 
 		 234 aa  73.9  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.318026 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8446  putative transposase  30.15 
 
 		 233 aa  74.3  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7844  putative transposase  30.15 
 
 		 233 aa  73.9  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0076  IS26 transposase  29.8 
 
 		 234 aa  73.9  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.572199  normal  0.511731 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0070  IS26 transposase  29.8 
 
 		 234 aa  73.9  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.321063 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1583  IS26 transposase  29.8 
 
 		 234 aa  73.9  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.736134  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0055  IS26 transposase  29.8 
 
 		 234 aa  73.9  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.790344 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1578  IS26 transposase  29.8 
 
 		 234 aa  73.9  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0392285  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0119  IS26 transposase  29.8 
 
 		 240 aa  73.6  0.000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.16763 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0014  IS26 transposase  29.8 
 
 		 234 aa  73.9  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.298746  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0048  IS26 transposase  29.8 
 
 		 234 aa  73.9  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.000229018  normal  0.335597 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>