255 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_1473 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008262  CPR_0681  ISCpe7, transposase  100 
 
 		 340 aa  531  1e-150  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0802  ISCpe7, transposase  100 
 
 		 340 aa  531  1e-150  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0691516  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1473  ISCpe7, transposase  100 
 
 		 253 aa  531  1e-150  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.804077  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0784  ISCpe7, transposase  99.21 
 
 		 340 aa  528  1e-149  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.653929  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0947  ISCpe7, transposase  98.42 
 
 		 340 aa  523  1e-148  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0680749  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0982  ISCpe7, transposase  98.42 
 
 		 340 aa  523  1e-148  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000545032  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1313  ISCpe7, transposase  98.42 
 
 		 340 aa  523  1e-148  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0190357  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0809  ISCpe7, transposase  98.02 
 
 		 340 aa  521  1e-147  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.313897  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1537  ISCpe7, transposase  97.63 
 
 		 340 aa  517  1e-146  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.10688  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0635  ISCpe7, transposase  97.8 
 
 		 186 aa  375  1e-103  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0929  ISCpe7, transposase  97.8 
 
 		 186 aa  376  1e-103  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0298408  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1189  ISCpe7, transposase  98.68 
 
 		 152 aa  314  9.999999999999999e-85  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0238866  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0755  integrase catalytic subunit  48.02 
 
 		 343 aa  257  1e-67  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000147635  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2640  Integrase catalytic region  47.71 
 
 		 353 aa  247  1e-64  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1944  Integrase catalytic region  47.71 
 
 		 353 aa  247  1e-64  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.704589  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2422  Integrase catalytic region  47.71 
 
 		 353 aa  247  1e-64  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0674  Integrase catalytic region  47.71 
 
 		 353 aa  247  1e-64  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0037  Integrase catalytic region  46.95 
 
 		 353 aa  244  8e-64  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1912  Integrase catalytic region  46.95 
 
 		 353 aa  244  8e-64  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2179  Integrase catalytic region  46.95 
 
 		 353 aa  244  8e-64  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000521095  hitchhiker  1.88153e-16 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2243  Integrase catalytic region  46.95 
 
 		 353 aa  244  8e-64  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.781166 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2409  Integrase catalytic region  46.95 
 
 		 353 aa  244  8e-64  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0243  Integrase catalytic region  46.95 
 
 		 353 aa  244  8e-64  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1065  Integrase catalytic region  46.95 
 
 		 353 aa  244  8e-64  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.106559 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1190  ISCpe7, transposase  95.65 
 
 		 137 aa  140  9.999999999999999e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0283879  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0930  ISCpe7, transposase  92.75 
 
 		 156 aa  136  3.0000000000000003e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00303612  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0634  ISCpe7, transposase  91.3 
 
 		 156 aa  135  9e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0745  ISCpe7, transposase  33.2 
 
 		 316 aa  130  1.0000000000000001e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000815737  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0315  ISCpe7, transposase  33.2 
 
 		 316 aa  130  1.0000000000000001e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00611234  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1078  ISCpe7, transposase  33.2 
 
 		 316 aa  130  1.0000000000000001e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000101857  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1412  ISCpe7, transposase  33.2 
 
 		 316 aa  130  1.0000000000000001e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000618416  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0035  ISCpe7, transposase  33.2 
 
 		 316 aa  130  1.0000000000000001e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.800546  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1261  ISCpe7, transposase  33.2 
 
 		 316 aa  130  1.0000000000000001e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000118886  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0030  insertion element protein  34.73 
 
 		 312 aa  129  3e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000855614  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0799  ISCpe7, transposase  34.73 
 
 		 312 aa  129  4.0000000000000003e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0903  ISCpe7, transposase  34.73 
 
 		 312 aa  129  4.0000000000000003e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000597662  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1581  ISCpe7, transposase  34.73 
 
 		 312 aa  129  4.0000000000000003e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1164  ISCpe7, transposase  34.73 
 
 		 312 aa  129  4.0000000000000003e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1361  ISCpe7, transposase  34.73 
 
 		 312 aa  129  4.0000000000000003e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0203024  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0556  ISCpe7, transposase  34.73 
 
 		 312 aa  129  4.0000000000000003e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00138013  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0422  insertion element protein  34.73 
 
 		 312 aa  129  5.0000000000000004e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0727  insertion element protein  34.73 
 
 		 312 aa  129  5.0000000000000004e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0078  ISCpe7, transposase  34.73 
 
 		 312 aa  129  6e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.516266  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1196  ISCpe7, transposase  34.73 
 
 		 312 aa  129  6e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0509  ISCpe7, transposase  34.35 
 
 		 312 aa  129  6e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1574  ISCpe7, transposase  34.35 
 
 		 312 aa  129  6e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0337  ISCpe7, transposase  34.73 
 
 		 312 aa  129  6e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.500965  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0115  hypothetical protein  33.67 
 
 		 261 aa  87.4  2e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000160092  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0386  hypothetical protein  33.67 
 
 		 261 aa  86.7  3e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9135  transposase  37.67 
 
 		 180 aa  84.7  0.000000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0658372  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9039  transposase  35.86 
 
 		 243 aa  80.9  0.00000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8044  transposase  35.86 
 
 		 238 aa  80.1  0.00000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9042  transposase  35.86 
 
 		 238 aa  80.1  0.00000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.276584  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7148  transposase  35.86 
 
 		 232 aa  78.2  0.0000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8473  putative transposase  33.56 
 
 		 233 aa  77.4  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.396806  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0170  integrase catalytic subunit  35.37 
 
 		 319 aa  77  0.0000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0337001  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0175  transposase  31.88 
 
 		 232 aa  77  0.0000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0546  transposase  35.17 
 
 		 238 aa  76.6  0.0000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0563  transposase protein  33.79 
 
 		 238 aa  76.6  0.0000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4360  transposase  38.57 
 
 		 237 aa  76.6  0.0000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.017545  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4457  putative transposase  34.64 
 
 		 233 aa  76.3  0.0000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.459912  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4618  putative transposase  34.64 
 
 		 233 aa  76.3  0.0000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0617811  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4632  putative transposase  34.64 
 
 		 233 aa  76.3  0.0000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.223023  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4459  putative transposase  34.64 
 
 		 233 aa  76.3  0.0000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3173  transposase  31.79 
 
 		 236 aa  75.9  0.0000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.19085  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4519  putative transposase  34.64 
 
 		 233 aa  75.9  0.0000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00999598  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8012  transposase protein  35.17 
 
 		 238 aa  75.9  0.0000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3113  transposase  31.79 
 
 		 236 aa  75.9  0.0000000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3283  transposase  31.79 
 
 		 236 aa  75.9  0.0000000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2782  integrase catalytic subunit  32.61 
 
 		 231 aa  74.7  0.000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0856154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4506  integrase catalytic region  31.29 
 
 		 236 aa  74.3  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8446  putative transposase  33.33 
 
 		 233 aa  73.2  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7870  putative transposase  33.33 
 
 		 233 aa  73.2  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7882  putative transposase  33.33 
 
 		 233 aa  73.2  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7848  putative transposase  33.33 
 
 		 233 aa  73.2  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5656  integrase catalytic region  30.22 
 
 		 235 aa  73.2  0.000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  0.0204963 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7844  putative transposase  33.33 
 
 		 233 aa  73.2  0.000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0219  integrase catalytic subunit  32.14 
 
 		 231 aa  72.4  0.000000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.465023  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0694  transposase  23.25 
 
 		 478 aa  72  0.000000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000208331  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0539  transposase  23.25 
 
 		 478 aa  72  0.000000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000512999  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0561  transposase protein  33.56 
 
 		 233 aa  72  0.000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0319  transposase  22.88 
 
 		 470 aa  72  0.000000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2050  transposase  23.25 
 
 		 478 aa  72  0.000000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000963714  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0160  IS26 transposase  32.21 
 
 		 240 aa  71.2  0.00000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0100115  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0099  IS26 transposase  32.21 
 
 		 234 aa  71.6  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.41105  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0048  IS26 transposase  32.21 
 
 		 234 aa  71.6  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.000229018  normal  0.335597 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0119  IS26 transposase  32.21 
 
 		 240 aa  71.2  0.00000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.16763 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0136  IS26 transposase  32.21 
 
 		 240 aa  71.2  0.00000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0122  IS26 transposase  32.21 
 
 		 240 aa  71.2  0.00000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.559056 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1583  IS26 transposase  32.21 
 
 		 234 aa  71.6  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.736134  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0076  IS26 transposase  32.21 
 
 		 234 aa  71.6  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.572199  normal  0.511731 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0078  IS26 transposase  32.21 
 
 		 234 aa  71.6  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.753409 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0156  IS26 transposase  32.21 
 
 		 240 aa  71.2  0.00000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.374184  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0033  transposase InsB1 for insertion sequence IS26  32.21 
 
 		 240 aa  71.2  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.139125  normal  0.210279 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0035  transposase InsB2 for insertion sequence IS26  32.21 
 
 		 240 aa  71.2  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.401823  normal  0.39623 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0159  transposase InsB3 for insertion sequence IS26  32.21 
 
 		 240 aa  71.2  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.432493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0160  transposase InsB4 for insertion sequence IS26  32.21 
 
 		 240 aa  71.2  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0865619  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0040  IS26 transposase  32.21 
 
 		 234 aa  71.6  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.318026 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0115  IS26 transposase  32.21 
 
 		 240 aa  71.2  0.00000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.754112  normal  0.0114398 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0116  IS26 transposase  32.21 
 
 		 240 aa  71.2  0.00000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0605578 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>