More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_0930 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008262  CPR_0930  ISCpe7, transposase  100 
 
 
156 aa  323  7e-88  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00303612  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0982  ISCpe7, transposase  97.44 
 
 
340 aa  320  5e-87  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000545032  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1313  ISCpe7, transposase  97.44 
 
 
340 aa  320  5e-87  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0190357  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0809  ISCpe7, transposase  96.79 
 
 
340 aa  316  7e-86  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.313897  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0784  ISCpe7, transposase  96.79 
 
 
340 aa  315  1e-85  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.653929  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0947  ISCpe7, transposase  96.15 
 
 
340 aa  315  1e-85  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0680749  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0634  ISCpe7, transposase  97.42 
 
 
156 aa  315  2e-85  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0681  ISCpe7, transposase  95.51 
 
 
340 aa  312  9.999999999999999e-85  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0802  ISCpe7, transposase  95.51 
 
 
340 aa  312  9.999999999999999e-85  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0691516  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1537  ISCpe7, transposase  93.59 
 
 
340 aa  306  5.9999999999999995e-83  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.10688  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1190  ISCpe7, transposase  95.62 
 
 
137 aa  273  8e-73  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0283879  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0755  integrase catalytic subunit  54.14 
 
 
343 aa  178  2.9999999999999997e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000147635  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1472  hypothetical protein  96.15 
 
 
78 aa  154  5.0000000000000005e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.380106  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0243  Integrase catalytic region  47.1 
 
 
353 aa  149  1e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1065  Integrase catalytic region  47.1 
 
 
353 aa  149  1e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.106559 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2409  Integrase catalytic region  47.1 
 
 
353 aa  149  1e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2179  Integrase catalytic region  47.1 
 
 
353 aa  149  1e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000521095  hitchhiker  1.88153e-16 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2243  Integrase catalytic region  47.1 
 
 
353 aa  149  1e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.781166 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1912  Integrase catalytic region  47.1 
 
 
353 aa  149  1e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0037  Integrase catalytic region  47.1 
 
 
353 aa  149  1e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0674  Integrase catalytic region  46.45 
 
 
353 aa  149  2e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1944  Integrase catalytic region  46.45 
 
 
353 aa  149  2e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.704589  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2640  Integrase catalytic region  46.45 
 
 
353 aa  149  2e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2422  Integrase catalytic region  46.45 
 
 
353 aa  149  2e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1473  ISCpe7, transposase  92.75 
 
 
253 aa  136  1e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.804077  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0170  integrase catalytic subunit  39.29 
 
 
319 aa  86.7  1e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0337001  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0319  transposase  25.68 
 
 
470 aa  63.2  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0694  transposase  25.68 
 
 
478 aa  63.2  0.000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000208331  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2050  transposase  25.68 
 
 
478 aa  63.2  0.000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000963714  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0539  transposase  25.68 
 
 
478 aa  63.2  0.000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000512999  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0035  ISCpe7, transposase  30.23 
 
 
316 aa  61.6  0.000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.800546  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0745  ISCpe7, transposase  30.23 
 
 
316 aa  61.6  0.000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000815737  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0315  ISCpe7, transposase  30.23 
 
 
316 aa  61.6  0.000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00611234  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1078  ISCpe7, transposase  30.23 
 
 
316 aa  61.6  0.000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000101857  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1261  ISCpe7, transposase  30.23 
 
 
316 aa  61.6  0.000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000118886  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1412  ISCpe7, transposase  30.23 
 
 
316 aa  61.6  0.000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000618416  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0175  transposase  39.73 
 
 
232 aa  58.2  0.00000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3925  integrase catalytic region  30.82 
 
 
251 aa  56.2  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00155278  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8473  putative transposase  29.6 
 
 
233 aa  54.7  0.0000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.396806  n/a   
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0069  integrase core subunit  29.45 
 
 
178 aa  53.9  0.0000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.8827  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0124  Integrase catalytic region  28.67 
 
 
272 aa  53.1  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.345936 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3838  Integrase catalytic region  28.67 
 
 
272 aa  53.1  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6171  Integrase catalytic region  28.67 
 
 
272 aa  53.1  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2286  Integrase catalytic region  28.67 
 
 
272 aa  53.1  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.102637  hitchhiker  0.00753929 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2277  Integrase catalytic region  28.67 
 
 
272 aa  53.1  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.0000868543  normal  0.0420034 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1164  ISCpe7, transposase  31.53 
 
 
312 aa  53.1  0.000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0903  ISCpe7, transposase  31.53 
 
 
312 aa  53.1  0.000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000597662  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1196  ISCpe7, transposase  31.53 
 
 
312 aa  53.1  0.000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1581  ISCpe7, transposase  31.53 
 
 
312 aa  53.1  0.000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0078  ISCpe7, transposase  31.53 
 
 
312 aa  53.1  0.000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.516266  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0509  ISCpe7, transposase  31.53 
 
 
312 aa  52.8  0.000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0422  insertion element protein  31.53 
 
 
312 aa  52.8  0.000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0799  ISCpe7, transposase  31.53 
 
 
312 aa  53.1  0.000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1574  ISCpe7, transposase  31.53 
 
 
312 aa  52.8  0.000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0337  ISCpe7, transposase  31.53 
 
 
312 aa  53.1  0.000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.500965  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0030  insertion element protein  31.53 
 
 
312 aa  52.8  0.000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000855614  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1369  integrase catalytic subunit  28.37 
 
 
272 aa  52.4  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0556  ISCpe7, transposase  31.53 
 
 
312 aa  53.1  0.000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00138013  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0727  insertion element protein  31.53 
 
 
312 aa  52.8  0.000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1361  ISCpe7, transposase  31.53 
 
 
312 aa  53.1  0.000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0203024  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0067  integrase catalytic region  29.45 
 
 
251 aa  52.4  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4863  Integrase catalytic region  29.66 
 
 
225 aa  52.4  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0219  integrase catalytic subunit  40.3 
 
 
231 aa  52  0.000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.465023  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0133  transposase B  29.45 
 
 
269 aa  52  0.000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.809419  normal  0.0748006 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2782  integrase catalytic subunit  40.3 
 
 
231 aa  50.4  0.000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0856154  normal 
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0094  integrase core subunit  28.77 
 
 
269 aa  50.1  0.00001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.445692 
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D32  transposase  28.47 
 
 
226 aa  49.7  0.00001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2913  transposase  31.36 
 
 
237 aa  49.3  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0383  Integrase catalytic region  27.41 
 
 
284 aa  48.9  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0288014  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2997  transposase  31.36 
 
 
237 aa  49.3  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3290  Integrase catalytic region  27.41 
 
 
285 aa  49.3  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3086  transposase  31.36 
 
 
237 aa  49.3  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4908  integrase catalytic subunit  27.78 
 
 
283 aa  49.7  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.168017 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3012  transposase  31.36 
 
 
237 aa  49.3  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3017  transposase  31.36 
 
 
237 aa  49.3  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1459  IS6 family transposase  39.44 
 
 
162 aa  48.9  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.835209  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1490  Integrase catalytic region  27.41 
 
 
284 aa  48.9  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00848161  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1155  Integrase catalytic region  27.41 
 
 
284 aa  48.9  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.667808  n/a   
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D29  transposase  28.08 
 
 
226 aa  49.7  0.00002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.0000656405  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3074  transposase  31.36 
 
 
237 aa  49.3  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2945  transposase  31.36 
 
 
237 aa  49.3  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5656  integrase catalytic region  28.21 
 
 
235 aa  49.3  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal  0.0204963 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0221  Integrase catalytic region  27.41 
 
 
285 aa  49.3  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1027  Integrase catalytic region  27.41 
 
 
284 aa  48.9  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2808  integrase catalytic region  32.74 
 
 
224 aa  48.5  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0988586  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2803  integrase catalytic region  32.74 
 
 
224 aa  48.5  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0109  integrase catalytic subunit  28.57 
 
 
273 aa  48.5  0.00003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2021  integrase catalytic subunit  28.57 
 
 
273 aa  48.5  0.00003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007616  NmulC_2783  integrase catalytic subunit  28.57 
 
 
273 aa  48.5  0.00003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.983973  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1481  transposase  39.13 
 
 
238 aa  48.5  0.00003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.84376  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1485  transposase  39.13 
 
 
238 aa  48.5  0.00003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1495  transposase  39.13 
 
 
238 aa  48.5  0.00003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1506  transposase  39.13 
 
 
238 aa  48.9  0.00003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2758  integrase catalytic subunit  32.74 
 
 
224 aa  48.5  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2763  integrase catalytic subunit  32.74 
 
 
224 aa  48.5  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.776965  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0458  integrase catalytic subunit  24.84 
 
 
338 aa  48.9  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3665  Integrase catalytic region  27.41 
 
 
305 aa  48.5  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3814  transposase B  27.01 
 
 
284 aa  48.5  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C12  transposase  28.32 
 
 
226 aa  48.5  0.00004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2707  transposase B  27.01 
 
 
284 aa  48.5  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>