More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_0634 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008262  CPR_0634  ISCpe7, transposase  100 
 
 		 156 aa  323  7e-88  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0947  ISCpe7, transposase  98.71 
 
 		 340 aa  321  3e-87  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0680749  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0930  ISCpe7, transposase  97.42 
 
 		 156 aa  315  2e-85  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00303612  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0809  ISCpe7, transposase  96.77 
 
 		 340 aa  314  4e-85  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.313897  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0982  ISCpe7, transposase  95.45 
 
 		 340 aa  312  9.999999999999999e-85  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000545032  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1313  ISCpe7, transposase  95.45 
 
 		 340 aa  312  9.999999999999999e-85  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0190357  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0681  ISCpe7, transposase  95.48 
 
 		 340 aa  311  2.9999999999999996e-84  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0802  ISCpe7, transposase  95.48 
 
 		 340 aa  311  2.9999999999999996e-84  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0691516  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0784  ISCpe7, transposase  95.48 
 
 		 340 aa  310  3.9999999999999997e-84  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.653929  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1537  ISCpe7, transposase  94.84 
 
 		 340 aa  310  5.999999999999999e-84  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.10688  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1190  ISCpe7, transposase  94.89 
 
 		 137 aa  271  3e-72  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0283879  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0755  integrase catalytic subunit  54.49 
 
 		 343 aa  177  5.999999999999999e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000147635  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1472  hypothetical protein  96.1 
 
 		 78 aa  151  2.9999999999999998e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.380106  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0037  Integrase catalytic region  47.74 
 
 		 353 aa  150  5e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0243  Integrase catalytic region  47.74 
 
 		 353 aa  150  5e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1912  Integrase catalytic region  47.74 
 
 		 353 aa  150  5e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1065  Integrase catalytic region  47.74 
 
 		 353 aa  150  5e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.106559 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2179  Integrase catalytic region  47.74 
 
 		 353 aa  150  5e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000521095  hitchhiker  1.88153e-16 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2409  Integrase catalytic region  47.74 
 
 		 353 aa  150  5e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2243  Integrase catalytic region  47.74 
 
 		 353 aa  150  5e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.781166 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2422  Integrase catalytic region  47.1 
 
 		 353 aa  150  8.999999999999999e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0674  Integrase catalytic region  47.1 
 
 		 353 aa  150  8.999999999999999e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1944  Integrase catalytic region  47.1 
 
 		 353 aa  150  8.999999999999999e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.704589  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2640  Integrase catalytic region  47.1 
 
 		 353 aa  150  8.999999999999999e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1473  ISCpe7, transposase  91.3 
 
 		 253 aa  135  3.0000000000000003e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.804077  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0170  integrase catalytic subunit  38.57 
 
 		 319 aa  84.3  6e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0337001  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0539  transposase  25.68 
 
 		 478 aa  63.9  0.0000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000512999  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2050  transposase  25.68 
 
 		 478 aa  63.9  0.0000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000963714  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0694  transposase  25.68 
 
 		 478 aa  63.9  0.0000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000208331  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0319  transposase  25.68 
 
 		 470 aa  63.9  0.0000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0035  ISCpe7, transposase  30.65 
 
 		 316 aa  62  0.000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.800546  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1078  ISCpe7, transposase  30.65 
 
 		 316 aa  62  0.000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000101857  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1261  ISCpe7, transposase  30.65 
 
 		 316 aa  62  0.000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000118886  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0745  ISCpe7, transposase  30.65 
 
 		 316 aa  62  0.000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000815737  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1412  ISCpe7, transposase  30.65 
 
 		 316 aa  62  0.000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000618416  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0315  ISCpe7, transposase  30.65 
 
 		 316 aa  62  0.000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00611234  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0175  transposase  39.73 
 
 		 232 aa  57.4  0.00000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8473  putative transposase  29.6 
 
 		 233 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.396806  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3925  integrase catalytic region  30.14 
 
 		 251 aa  55.1  0.0000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00155278  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2286  Integrase catalytic region  28.67 
 
 		 272 aa  53.5  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.102637  hitchhiker  0.00753929 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0124  Integrase catalytic region  28.67 
 
 		 272 aa  53.5  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.345936 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3838  Integrase catalytic region  28.67 
 
 		 272 aa  53.5  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0219  integrase catalytic subunit  41.79 
 
 		 231 aa  53.1  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.465023  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6171  Integrase catalytic region  28.67 
 
 		 272 aa  53.5  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2277  Integrase catalytic region  28.67 
 
 		 272 aa  53.5  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.0000868543  normal  0.0420034 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2782  integrase catalytic subunit  41.79 
 
 		 231 aa  52  0.000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0856154  normal  1 
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0069  integrase core subunit  28.77 
 
 		 178 aa  52.4  0.000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.8827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1369  integrase catalytic subunit  28.37 
 
 		 272 aa  52.4  0.000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0067  integrase catalytic region  28.77 
 
 		 251 aa  51.2  0.000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1361  ISCpe7, transposase  30.63 
 
 		 312 aa  50.8  0.000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0203024  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0030  insertion element protein  30.63 
 
 		 312 aa  50.8  0.000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000855614  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1581  ISCpe7, transposase  30.63 
 
 		 312 aa  50.8  0.000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1574  ISCpe7, transposase  30.63 
 
 		 312 aa  50.8  0.000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0903  ISCpe7, transposase  30.63 
 
 		 312 aa  50.8  0.000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000597662  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0078  ISCpe7, transposase  30.63 
 
 		 312 aa  50.8  0.000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.516266  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1196  ISCpe7, transposase  30.63 
 
 		 312 aa  50.8  0.000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0556  ISCpe7, transposase  30.63 
 
 		 312 aa  50.8  0.000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00138013  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0422  insertion element protein  30.63 
 
 		 312 aa  51.2  0.000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1164  ISCpe7, transposase  30.63 
 
 		 312 aa  50.8  0.000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0509  ISCpe7, transposase  30.63 
 
 		 312 aa  50.8  0.000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0727  insertion element protein  30.63 
 
 		 312 aa  51.2  0.000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0799  ISCpe7, transposase  30.63 
 
 		 312 aa  50.8  0.000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0337  ISCpe7, transposase  30.63 
 
 		 312 aa  50.8  0.000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.500965  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1459  IS6 family transposase  40.85 
 
 		 162 aa  50.4  0.000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.835209  n/a   
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D29  transposase  28.77 
 
 		 226 aa  50.4  0.000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.0000656405  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0133  transposase B  28.77 
 
 		 269 aa  50.4  0.000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.809419  normal  0.0748006 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4908  integrase catalytic subunit  29.08 
 
 		 283 aa  49.7  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.168017 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5656  integrase catalytic region  28.21 
 
 		 235 aa  49.7  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  0.0204963 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0109  integrase catalytic subunit  28.17 
 
 		 273 aa  50.1  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2021  integrase catalytic subunit  28.17 
 
 		 273 aa  50.1  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007616  NmulC_2783  integrase catalytic subunit  28.17 
 
 		 273 aa  50.1  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.983973  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1481  transposase  40.58 
 
 		 238 aa  50.1  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.84376  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1485  transposase  40.58 
 
 		 238 aa  50.1  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1495  transposase  40.58 
 
 		 238 aa  50.1  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1506  transposase  40.58 
 
 		 238 aa  50.1  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C12  transposase  29.2 
 
 		 226 aa  49.7  0.00001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D32  transposase  29.17 
 
 		 226 aa  50.4  0.00001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4863  Integrase catalytic region  28.97 
 
 		 225 aa  49.7  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3012  transposase  31.36 
 
 		 237 aa  48.9  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2997  transposase  31.36 
 
 		 237 aa  48.9  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3017  transposase  31.36 
 
 		 237 aa  48.9  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3074  transposase  31.36 
 
 		 237 aa  48.9  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3086  transposase  31.36 
 
 		 237 aa  48.9  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2945  transposase  31.36 
 
 		 237 aa  48.9  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2913  transposase  31.36 
 
 		 237 aa  48.9  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3665  Integrase catalytic region  25.64 
 
 		 305 aa  48.5  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0094  integrase core subunit  28.08 
 
 		 269 aa  48.5  0.00003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.445692 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0458  integrase catalytic subunit  24.84 
 
 		 338 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3883  transposase B  27.66 
 
 		 284 aa  48.1  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0156  transposase B  27.66 
 
 		 283 aa  48.1  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.580889  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0035  transposase InsB2 for insertion sequence IS26  31.9 
 
 		 240 aa  47.8  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.401823  normal  0.39623 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0149  IS26 transposase  31.9 
 
 		 240 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0132  IS26 transposase  31.9 
 
 		 240 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.667104  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0136  IS26 transposase  31.9 
 
 		 240 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0115  IS26 transposase  31.9 
 
 		 240 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.754112  normal  0.0114398 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1549  transposase B  27.66 
 
 		 284 aa  48.1  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3814  transposase B  27.66 
 
 		 284 aa  48.1  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0156  IS26 transposase  31.9 
 
 		 240 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.374184  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0160  IS26 transposase  31.9 
 
 		 240 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0100115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1886  integrase catalytic subunit  26.32 
 
 		 278 aa  48.1  0.00005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>