57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0386 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009718  Fnod_0386  hypothetical protein  100 
 
 
261 aa  526  1e-149  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1196  ISCpe7, transposase  83.33 
 
 
312 aa  505  9.999999999999999e-143  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0078  ISCpe7, transposase  83.33 
 
 
312 aa  505  9.999999999999999e-143  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.516266  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0337  ISCpe7, transposase  83.33 
 
 
312 aa  505  9.999999999999999e-143  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.500965  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1361  ISCpe7, transposase  82.69 
 
 
312 aa  503  1e-141  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0203024  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0030  insertion element protein  83.01 
 
 
312 aa  503  1e-141  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000855614  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1574  ISCpe7, transposase  82.37 
 
 
312 aa  502  1e-141  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1581  ISCpe7, transposase  82.69 
 
 
312 aa  503  1e-141  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0422  insertion element protein  83.01 
 
 
312 aa  503  1e-141  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0509  ISCpe7, transposase  82.37 
 
 
312 aa  502  1e-141  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0556  ISCpe7, transposase  82.69 
 
 
312 aa  503  1e-141  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00138013  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0727  insertion element protein  83.01 
 
 
312 aa  503  1e-141  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0799  ISCpe7, transposase  82.69 
 
 
312 aa  503  1e-141  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0903  ISCpe7, transposase  82.69 
 
 
312 aa  503  1e-141  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000597662  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1164  ISCpe7, transposase  82.69 
 
 
312 aa  503  1e-141  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0115  hypothetical protein  97.7 
 
 
261 aa  498  1e-140  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000160092  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0745  ISCpe7, transposase  47.15 
 
 
316 aa  267  1e-70  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000815737  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0315  ISCpe7, transposase  47.15 
 
 
316 aa  267  1e-70  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00611234  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0035  ISCpe7, transposase  47.15 
 
 
316 aa  267  1e-70  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.800546  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1078  ISCpe7, transposase  47.15 
 
 
316 aa  267  1e-70  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000101857  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1412  ISCpe7, transposase  47.15 
 
 
316 aa  267  1e-70  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000618416  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1261  ISCpe7, transposase  47.15 
 
 
316 aa  267  1e-70  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000118886  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1621  hypothetical protein  32.42 
 
 
334 aa  125  1e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1473  ISCpe7, transposase  33.67 
 
 
253 aa  86.7  3e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.804077  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0802  ISCpe7, transposase  33.67 
 
 
340 aa  86.7  3e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0691516  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0681  ISCpe7, transposase  33.67 
 
 
340 aa  86.7  3e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1313  ISCpe7, transposase  33.67 
 
 
340 aa  86.7  4e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0190357  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0982  ISCpe7, transposase  33.67 
 
 
340 aa  86.7  4e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000545032  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0947  ISCpe7, transposase  33.67 
 
 
340 aa  86.7  4e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0680749  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0809  ISCpe7, transposase  33.67 
 
 
340 aa  86.7  4e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.313897  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0784  ISCpe7, transposase  33.17 
 
 
340 aa  84.7  0.000000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.653929  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0635  ISCpe7, transposase  35.98 
 
 
186 aa  83.2  0.000000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1537  ISCpe7, transposase  32.66 
 
 
340 aa  82  0.000000000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.10688  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0929  ISCpe7, transposase  35.98 
 
 
186 aa  82  0.000000000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0298408  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1189  ISCpe7, transposase  35.26 
 
 
152 aa  71.2  0.00000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0238866  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2422  Integrase catalytic region  23.42 
 
 
353 aa  68.9  0.00000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1944  Integrase catalytic region  23.42 
 
 
353 aa  68.9  0.00000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.704589  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0674  Integrase catalytic region  23.42 
 
 
353 aa  68.9  0.00000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2640  Integrase catalytic region  23.42 
 
 
353 aa  68.9  0.00000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0755  integrase catalytic subunit  25.08 
 
 
343 aa  65.9  0.0000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000147635  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2409  Integrase catalytic region  22.22 
 
 
353 aa  62.4  0.000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2243  Integrase catalytic region  22.22 
 
 
353 aa  62.4  0.000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.781166 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2179  Integrase catalytic region  22.22 
 
 
353 aa  62.4  0.000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000521095  hitchhiker  1.88153e-16 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1912  Integrase catalytic region  22.22 
 
 
353 aa  62.4  0.000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1065  Integrase catalytic region  22.22 
 
 
353 aa  62.4  0.000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.106559 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0037  Integrase catalytic region  22.22 
 
 
353 aa  62.4  0.000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0243  Integrase catalytic region  22.22 
 
 
353 aa  62.4  0.000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4083  transposase  34.92 
 
 
236 aa  45.8  0.0007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4519  putative transposase  41.07 
 
 
233 aa  44.3  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00999598  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4632  putative transposase  41.07 
 
 
233 aa  43.9  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.223023  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4167  putative transposase  34.55 
 
 
237 aa  43.9  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4457  putative transposase  41.07 
 
 
233 aa  43.9  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.459912  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4107  integrase  33.33 
 
 
236 aa  43.9  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4459  putative transposase  41.07 
 
 
233 aa  43.9  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4618  putative transposase  41.07 
 
 
233 aa  43.9  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0617811  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4081  putative transposase  33.33 
 
 
224 aa  43.5  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4110  integrase  33.33 
 
 
236 aa  43.1  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>